Page 104 - 南京医科大学自然版
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第44卷第4期
·542 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2024年4月
准。 Wang 等 [74] 认为 ITC 能够提供传统生化测定难 测模型综述[J]. 广州大学学报(自然科学版),2023,22
以获得的酶活性信息,并使用 ITC 来测量酶抑制剂 (1):25-32
的强度、结合模式、缔合和解离动力学。 [3] HAN R C,LIANG L,QIN T,et al. Encephalomyocarditis
2.5 微量热泳动(microscale thermophoresis,MST) virus 2A protein inhibited apoptosis by interaction with
annexin A2 through JNK/c ⁃ Jun pathway[J]. Viruses,
MST 是一种表征生物分子特性的光学方法,反
2022,14(2):359
映粒子在微观温度梯度中的定向运动 [75] 。MST 检
[4] SUN N,QIN Y J,XU C,et al. Design of fast⁃onset antide⁃
测设备由 Nano Temper 公司发明,其工作原理是生
pressant by dissociating SERT from nNOS in the DRN[J].
物分子在毛细管中发生热泳动现象,发生相互作用
Science,2022,378(6618):390-398
的生物分子的水化层、分子大小、电荷等性质发生
[5] ELZEFZAFY W M,HUSSIEN M,MOHMMED Z A Z,et
改变,进而引起反应体系中荧光分布的变化,以检测
al. The diagnostic value of Golgi protien ⁃ 73 and DICK⁃
相互作用的生物分子间的亲和性 。MST允许使用 KOPF⁃1 in hepatocellular carcinoma[J]. J Immunoassay
[76]
[77]
非常小的样本量(微升范围)进行高通量筛选 。热 Immunochem,2021,42(2):174-187
泳动对分子属性的微小变化十分敏感,适合于蛋白 [6] SOJKA S,AMIN N M,GIBBS D,et al. Congenital heart
质、核酸、小分子和离子等多种物质的相互作用研 disease protein 5 associates with CASZ1 to maintain myo⁃
究 [78] 。Asmari 等 [79] 通过 MST 技术测定铁螯合药物 cardial tissue integrity[J]. Development,2014,141(15):
与乳铁蛋白的结合亲和力,预测母乳中铁螯合药物 3040-3049
的分泌。 [7] FIELDS S,SONG O. A novel genetic system to detect pro⁃
tein⁃protein interactions[J]. Nature,1989,340(6230):
3 基于生物信息学的研究方法 245-246
[8] CHEN Q,WEI T Y. Membrane and nuclear yeast two⁃hy⁃
蛋白质相互作用错综复杂,形成巨大的 PPI 网
brid systems[J]. Methods Mol Biol,2022,2400:93-104
络,将生物信息学技术运用在 PPI 检测中非常重 [9] 沈 竹,曹勤红. 酵母双杂交及其衍生技术应用研究进
要。Chen 等 [80] 提出了一种基于序列的新型计算方 展[J]. 农业生物技术学报,2022,30(12):2425-2433
法,称为 DCSE(Double Channel⁃Siamese⁃Ensemble) [10]JIA Y,KOWALSKI P,LOPEZ I. Using yeast two⁃hybrid
来预测潜在的PPI。胡嘉伦等 [81] 采用计算机模拟的 system and molecular dynamics simulation to detect ven⁃
方法,对 2 类皂苷(达玛烷型皂苷和齐墩果型皂苷) om protein ⁃ protein interactions[J]. Curr Res Toxicol,
和α⁃乳白蛋白的相互作用进行研究,并获得其相互 2021,2:93-98
作用模式的相关图像。 [11]SUN Z J,SUN Y H,LI Y M,et al. Identification of HeLa
cell proteins that interact with Chlamydia trachomatis gly⁃
4 总结与展望 cogen synthase using yeast two ⁃ hybrid assays[J]. Mol
Med Rep,2020,21(3):1572-1580
PPI 研究方法根据原理大致可分为以下 3 种:
[12]SHI K Y,YANG L L,ZHUANG X Q,et al. Yeast two⁃hy⁃
①通过抗体或添加表位标签亲和纯化,得到诱饵蛋
brid screen identifies PKA⁃riα interacting proteins during
白与猎物蛋白的蛋白复合物,再经过免疫蛋白印迹
mouse spermiogenesis[J]. Genes,2021,12(12):1941
或质谱分析得到猎物蛋白的信息;②通过基因工程
[13]OMAGARI R,YAGISHITA M,SHIRAISHI F,et al. Eva⁃
等手段加入报告基因或荧光信号,表征PPI的发生;
luation of human thyroid hormone receptor⁃antagonist ac⁃
③通过检测发生相互作用的蛋白质分子的光学信 tivity in 691 chemical compounds using a yeast two⁃hy⁃
号、热力学变化、电荷改变等的函数变化来表征 brid assay with Saccharomyces cerevisiae Y190[J]. Data
PPI。本文介绍的几种方法各有优势与不足,不同的 Brief,2022,42:108303
方法可互为验证,互为补充。相信随着现代技术的 [14]HEINTZ V J,WANG L,LACOUNT D J. NanoLuc lucifer⁃
不断发展,会产生更先进、准确的 PPI 研究方法,为 ase as a quantitative yeast two⁃hybrid reporter[J]. FEMS
人类探索生命奥秘提供更先进的工具。 Yeast Res,2022,21(8):foab069
[15]SHIVHARE D,MUSIALAK⁃LANGE M,JULCA I,et al.
[参考文献]
Removing auto⁃activators from yeast⁃two⁃hybrid assays by
[1] 孙 宇,贾凌云,任 军. 蛋白质相互作用的研究方 conditional negative selection[J]. Sci Rep,2021,11(1):
法[J]. 分析化学,2007,35(5):760-766 5477
[2] 钱 冰,马宝山,刘 玉. 蛋白质与蛋白质相互作用预 [16]LIU Q,ZHENG J,SUN W P,et al. A proximity⁃tagging