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第44卷第6期 马晴晴,顾圣玮,王红玉,等. 基于线粒体自噬相关基因的哮喘亚型鉴定及预测模型构建研究[J].
2024年6月 南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(6):802-811 ·807 ·
ATG5、ATG12、MAP1LC3B、CSNK2A1、TOMM20、 三聚化、亚硝基化、金属离子转运以及对缺氧反应
UBA52、TOMM22、TOMM5 及 FUNDC1 表达显著高 的相关功能(图5B)。
于亚型 2(图 4D),应用预测模型对亚型 1 的预测准 KEGG 分析结果示,两种亚型均与 IL⁃17(由
确性更高(图4E);年龄方面两亚型间差异无统计学 Th17 细胞和 3 型固有淋巴细胞产生的 IL⁃17 可刺激
意义(图4F),但需指出的是亚型1中女性患者数量 中性粒细胞性气道炎症)信号通路相关,但每种亚
略多于男性患者(图4G)。 型均有各自独特的通路;亚型 1 特异富集病毒蛋白
2.5 两种亚型GO及KEGG富集分析 与细胞因子及受体相互作用、金黄色葡萄球菌感
对筛选出的DEG同时进行GO及KEGG富集分 染、趋化因子信号等通路,亚型2特异富集与卡波西
析。GO 分析结果示,两亚型间肽酶活性调控的功 肉瘤相关的疱疹病毒感染、结核病及精氨酸生物合
能特征差异显著,尽管存在一定共性,但在特定的 成相关通路(图5C)。
生物过程中差异明显;亚型 1 显著富集于与体液免 2.6 小分子药物预测
疫反应相关功能(图5A),亚型2则富集于与蛋白质 使用WGCNA识别与哮喘不同亚型相关的关键
A B E
Consensus matrix k=2 Probability 2 Probability
Sex ***
0.8 1.2
Age
1 1
2 Cluster 0.9
SRC 0.2
CSNK2B 0
Sex 0.6
MAP1LC3A Feale Probability
ULK1 -1 Male
MFN1 Age 0.3
UBB -2 70
UBC 0
CSNK2A2 Cluster 1 Cluster 2
PINK1 20 (n=157) (n=132)
PGAM5 Cluster
C *** SQSTM1 1 2 F 70
GSVA score of MRG geneset 5.0 MAP1LC3B (years) Age 50
TOMM22
ATG5
60
UBA52
FUNDC1
40
CSNK2A1
4.5
TOMM20
30
MFN2
20
4.0
Cluster 2
Cluster 1
RPS27A
Cluster 1
Cluster 2
TOMM5
(n=157) (n=132) ATG12 (n=91) (n=70)
D Cluster 1(n=157) Cluster 2(n=132) G P=0.17 P=0.81
100
****
15.0 90
****
**** 80 43% 51%
12.5 ** **** **** (%) 70
Expression 10.0 *** **** * **** *** *** **** **** Percent weight 50 Male
60
**
Female
40
7.5 * 30 57% 49%
20
10
5.0
0
CSNK2B
RPS27A
PGAM5 SRC UBB MFN2 SQSTM1 ATG5 MAP1LC3B UBC PINK1 ULK1 MFN1 TOMM20 UBA52 TOMM5 (n=91) (n=70)
TOMM22
CSNK2A1
FUNDC1
MAP1LC3A
ATG12
CSNK2A2
Cluster 1
Cluster 2
Gene
A:Consensus clustering matrix. B:The heatmap of the expression pattern of 22 MRGs in the two subtypes with the addition of clinical information.
C:The boxplot of the overall MRGs expression in the two subtypes(cluster 1 and cluster 2). D:The violin plot of 22 MRG expression in the two subtypes
(cluster 1 and cluster 2). E:The comparison of diagnostic performance of prediction models for the two subtypes(cluster 1 and cluster 2). F:Compari⁃
son of the age between asthma patients with alternative subtype(cluster 1 and cluster 2). G:The comparison of sex distribution between asthma patients
***
*
**
with alternative subtype. P < 0.05,P < 0.01, P < 0.001,and **** P < 0.000 1.
图4 哮喘亚型的鉴定及亚型间的差异分析
Figure 4 Identification of the subtypes of asthma and differences between the subtypes