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第44卷第6期       马晴晴,顾圣玮,王红玉,等. 基于线粒体自噬相关基因的哮喘亚型鉴定及预测模型构建研究[J].
                  2024年6月                     南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(6):802-811                        ·809 ·


                A          4  5  6  7  8  9  10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20  600  1  B  1.0  Cluster dendrogram
                    Scale free topology model fit 1.0  2  3  Mean connectivity 500  Height 0.8
                     0.8
                                                                            0.9
                                               400
                     0.6
                                               300
                                                                            0.7
                     0.4
                                               200
                                                                            0.6
                                                    2
                                               100
                                                                            0.5
                     0.2
                                                     3
                                                      4
                        1
                                                       5
                                                 0
                                                        6
                                                          8
                                                         7
                                                           9
                                                               14
                                                                15
                                                             12
                                                              13
                                                                 16
                                                                    19
                                                                     20
                                                                  17
                                                                   18
                                                            11
                                                           10
                                                                           Module
                            5   10   15   20           5   10   15  20
                                                                            colors
                             Soft threshold             Soft threshold
                C                  Module⁃trait relationships   D
                                                                          XMD8⁃92                Verrucarin⁃A
                                   0.15
                                                 -0.15
                       black      (0.01)        (0.01)     1.0
                                   0.18          -0.18
                       brown      (0.003)       (0.003)
                                                 -0.28
                                   0.28
                      salmon      (2e⁃06)       (2e⁃06)
                                   0.5
                                                 -0.5
                     trrquoise    (3e⁃19)       (3e⁃19)    0.5
                                   0.16          -0.16
                       green      (0.005)       (0.005)
                                   0.23
                                                 -0.23
                   greenyellow    (8e⁃05)       (8e⁃05)
                                   0.28
                                                 -0.28
                        pink      (2e⁃06)       (2e⁃06)
                                   -0.15         0.15      0
                         red
                                  (0.01)        (0.01)
                                   -0.062
                                                 0.062
                       purple     (0.3)         (0.3)
                                                 0.21
                                   -0.21
                        blue      (5e⁃04)       (5e⁃04)
                                   0.23          -0.23     -0.5
                         tan      (7e⁃05)       (7e⁃05)
                                                 0.43
                                   -0.43
                      magenta     (5e⁃14)       (5e⁃14)
                                   -0.47         0.47
                       yellow     (6e⁃17)       (6e⁃17)
                                                 -0.2
                                   0.2
                        grey      (6e⁃04)       (6e⁃04)    -1.0
                                  Cluster 1    Cluster 2
                                 (n=157)       (n=132)
                   A:The scale⁃free topological model indices fitting for different soft threshold powers(left panel)and corresponding mean connectivity values for
                each soft threshold power(right panel). B:The cluster dendrogram of genes. C:Correlations between different modules and clusters. D:Molecular struc⁃
                tures of XMD8⁃92 and Verrucarin⁃A.
                                                图6 两种哮喘亚型小分子靶向药物预测
                                Figure 6 Prediction of small molecule agents targeting the two subtypes of asthma
                        表1 两种哮喘亚型的小分子靶向药物                         本研究通过系统分析健康受试者和哮喘患者气道
                Table 1  Small molecule agents targeting the two subtypes  上皮转录组数据,探究哮喘与线粒体自噬之间的关
                       of asthma
                                                                  系,为哮喘的诊断和治疗提供理论依据。
                Cluster  Score   Name          Mechanism
                                                                      研究结果显示哮喘患者MRG整体表达上调,其
                1       -96.14  XMD8⁃92     MAP kinase inhibitor
                                                                  中7个上调显著、1 个下调显著,证实哮喘患者气道
                2       -95.84  Verrucarin⁃A  Protein synthesis inhibitor
                                                                  上皮确实存在线粒体自噬状态改变。免疫组化进
                Th2⁃低型。尽管其分型不同,但临床症状如气短、喘                         一步验证发现,OVA 诱导的哮喘小鼠气道上皮与
                息和咳嗽等却非常相似。因此,利用传统临床与生                            IL⁃13处理的原代气道上皮细胞的TOMM5表达均显
                理参数,从生物学角度界定哮喘不同亚型以辅助临                            著上调、与转录组学数据一致,表明该转录组数据
                床诊疗,面临着重重困难 。                                     生物信息分析可靠。
                                     [11]
                                                          [12]
                    线粒体功能障碍常见于各种急慢性肺部疾病 。                             继而使用机器学习算法,从22个 MRG中筛选出
                研究发现,哮喘患者气道上皮中可出现线粒体肿胀                            7个疾病最相关基因以构建哮喘预测模型,通过验证
                甚至碎裂,加剧氧化损伤、诱发上皮凋亡                  [13] ;抑制线     发现预测效能良好,同时为探寻疾病治疗新靶点提供
                粒体自噬可减少蟑螂过敏原诱导的气道上皮细胞                             了宝贵线索。其中,TOMM5与TOMM22是线粒体外
                        [7]
                因子释放 ;芝麻素可通过调节线粒体自噬、减轻哮                           膜转运酶复合物组分,可促进核编码蛋白质进入线
                              [8]
                喘气道炎症水平 。系列研究结果均提示,线粒体                            粒 体 [14- 15] ,在 调 节 线 粒 体 稳 态 中 起 重 要 作 用 。
                自噬可能在哮喘的发生发展中扮演着重要角色。                             FUNDC1 作为线粒体外膜蛋白,通过直接与 LC3 相
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