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第44卷第6期 马晴晴,顾圣玮,王红玉,等. 基于线粒体自噬相关基因的哮喘亚型鉴定及预测模型构建研究[J].
2024年6月 南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(6):802-811 ·809 ·
A 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 600 1 B 1.0 Cluster dendrogram
Scale free topology model fit 1.0 2 3 Mean connectivity 500 Height 0.8
0.8
0.9
400
0.6
300
0.7
0.4
200
0.6
2
100
0.5
0.2
3
4
1
5
0
6
8
7
9
14
15
12
13
16
19
20
17
18
11
10
Module
5 10 15 20 5 10 15 20
colors
Soft threshold Soft threshold
C Module⁃trait relationships D
XMD8⁃92 Verrucarin⁃A
0.15
-0.15
black (0.01) (0.01) 1.0
0.18 -0.18
brown (0.003) (0.003)
-0.28
0.28
salmon (2e⁃06) (2e⁃06)
0.5
-0.5
trrquoise (3e⁃19) (3e⁃19) 0.5
0.16 -0.16
green (0.005) (0.005)
0.23
-0.23
greenyellow (8e⁃05) (8e⁃05)
0.28
-0.28
pink (2e⁃06) (2e⁃06)
-0.15 0.15 0
red
(0.01) (0.01)
-0.062
0.062
purple (0.3) (0.3)
0.21
-0.21
blue (5e⁃04) (5e⁃04)
0.23 -0.23 -0.5
tan (7e⁃05) (7e⁃05)
0.43
-0.43
magenta (5e⁃14) (5e⁃14)
-0.47 0.47
yellow (6e⁃17) (6e⁃17)
-0.2
0.2
grey (6e⁃04) (6e⁃04) -1.0
Cluster 1 Cluster 2
(n=157) (n=132)
A:The scale⁃free topological model indices fitting for different soft threshold powers(left panel)and corresponding mean connectivity values for
each soft threshold power(right panel). B:The cluster dendrogram of genes. C:Correlations between different modules and clusters. D:Molecular struc⁃
tures of XMD8⁃92 and Verrucarin⁃A.
图6 两种哮喘亚型小分子靶向药物预测
Figure 6 Prediction of small molecule agents targeting the two subtypes of asthma
表1 两种哮喘亚型的小分子靶向药物 本研究通过系统分析健康受试者和哮喘患者气道
Table 1 Small molecule agents targeting the two subtypes 上皮转录组数据,探究哮喘与线粒体自噬之间的关
of asthma
系,为哮喘的诊断和治疗提供理论依据。
Cluster Score Name Mechanism
研究结果显示哮喘患者MRG整体表达上调,其
1 -96.14 XMD8⁃92 MAP kinase inhibitor
中7个上调显著、1 个下调显著,证实哮喘患者气道
2 -95.84 Verrucarin⁃A Protein synthesis inhibitor
上皮确实存在线粒体自噬状态改变。免疫组化进
Th2⁃低型。尽管其分型不同,但临床症状如气短、喘 一步验证发现,OVA 诱导的哮喘小鼠气道上皮与
息和咳嗽等却非常相似。因此,利用传统临床与生 IL⁃13处理的原代气道上皮细胞的TOMM5表达均显
理参数,从生物学角度界定哮喘不同亚型以辅助临 著上调、与转录组学数据一致,表明该转录组数据
床诊疗,面临着重重困难 。 生物信息分析可靠。
[11]
[12]
线粒体功能障碍常见于各种急慢性肺部疾病 。 继而使用机器学习算法,从22个 MRG中筛选出
研究发现,哮喘患者气道上皮中可出现线粒体肿胀 7个疾病最相关基因以构建哮喘预测模型,通过验证
甚至碎裂,加剧氧化损伤、诱发上皮凋亡 [13] ;抑制线 发现预测效能良好,同时为探寻疾病治疗新靶点提供
粒体自噬可减少蟑螂过敏原诱导的气道上皮细胞 了宝贵线索。其中,TOMM5与TOMM22是线粒体外
[7]
因子释放 ;芝麻素可通过调节线粒体自噬、减轻哮 膜转运酶复合物组分,可促进核编码蛋白质进入线
[8]
喘气道炎症水平 。系列研究结果均提示,线粒体 粒 体 [14- 15] ,在 调 节 线 粒 体 稳 态 中 起 重 要 作 用 。
自噬可能在哮喘的发生发展中扮演着重要角色。 FUNDC1 作为线粒体外膜蛋白,通过直接与 LC3 相