Page 41 - 南京医科大学学报自然科学版

第42卷第12期 王玉明，邵 可，刘一纬，等. 基于生物信息学方法分析影响胆管癌发生发展的差异基因［J］.
2022年12月 南京医科大学学报（自然科学版），2022，42（12）：1673-1680 ·1677 ·

1.0 低AGXT组（n=18） 1.0 低APOA1组（n=18）
高AGXT组（n=18） 高APOA1组（n=18）
0.8 Logrank 0.8 Logrank
HR=1.3 HR=1.9
P=0.58
P=0.2
生存率 0.6 生存率 0.6
0.4
0.4
0.2 0.2
0.0 0.0
0 10 20 30 40 50 60 0 10 20 30 40 50 60
时间（月） 时间（月）

1.0 低F13B 组（n=17） 1.0 低FETUB组（n=17）
高F13B组（n=17） 高FETUB组（n=17）
0.8 Logrank P=0.15 0.8 Logrank
HR=1.5
P=0.41
生存率 0.6 生存率 0.6
0.4
0.4
0.2 0.2

0.0 0.0
0 10 20 30 40 50 60 0 10 20 30 40 50 60
时间（月） 时间（月）
1.0 低SERPINC1组（n=18） 1.0 低SLC2A2组（n=18）
高SERPINC1组（n=18） 高SLC2A2组（n=18）
0.8 Logrank 0.8 Logrank
HR=2.3 HR=1.4
生存率 0.6 生存率 0.6
P=0.50
P=0.11
0.4
0.4
0.2 0.2
0.0 0.0
0 10 20 30 40 50 60 0 10 20 30 40 50 60
时间（月） 时间（月）
图4 6个胆管癌枢细基因与患者总体生存率分析
Figure 4 Survival analysis of hub genes in cholangiocarcinoma in TCGA

析结果显示在 CCA中，SLC2A2 枢纽基因的表达水 目前，临床各种靶向药物及免疫治疗药物飞速发
+
平 与 B 细 胞（r=-041，P=0.014）、CD8 T 细 胞（r= 展，但是针对于 CCA 的靶向药物匮乏，因此，对于
-0.352，P=0.038）、巨噬细胞（r=-0.364，P=0.032）、中 CCA进行基础研究，了解CCA的发生发展，将为CCA
性 粒 细 胞（r=- 0.15，P＜0.001）和 树 突 状 细 胞（r= 的靶向治疗和免疫治疗提供新的方向。
-0.45，P =0.006）相关（图5）。 整合多个数据集分析已被证明可以提高检测
2.6 SLC2A2在CCA细胞系的表达情况 能力。与单个阵列分析相比，集成多个阵列被认为
为了验证枢纽基因的准确性，选取了 SLC2A2 是提高结果可靠性的更好方法 ［20］ 。在目前研究中，
枢纽基因进行验证，RT⁃PCR 和 Western blot 显示 3个数据集中的每一个肿瘤组都独立于正常组。
SLC2A2 在正常胆管上皮细胞 BEC 细胞系低表达， 本研究中，基于公开数据库进行基因表达和
在 RBE、CCT、9810、QCB⁃939 这 4 种 CCA 细胞系中 PPI 分析，以确定与 CCA 相关的潜在关键基因。基
均高表达（图6）。 于来自 GEO 数据库的基因表达谱数据筛选出 CCA
和健康人类胆管组织之间的差异基因。本文总共
3 讨 论
确定了151个上调的 DEG 和 50个下调的 DEG。对
CCA是一种异质性疾病，各亚型的组织病理学 上调基因做后续分析发现，上调基因 GO 富集主要
特征和临床表现均不同。CCA 预后较差，5 年生存 富集于 CCA 中的氧化还原、药物反应、肽链内切酶
［3］
率不足百分之十 。手术切除是治疗CCA的主要方 活性、受体结合等；KEGG 通路富集分析表明，代谢
式之一 ［19］ ，但 CCA复发和内脏转移的可能性极高。 途径、补充和凝固级联、过氧物酶体在内的通路存