Page 49 - 南京医科大学自然版

第44卷第9期 张 虎，毛春蓉，练 云，等. 一种新型结直肠癌预后模型的建立与治疗预测［J］.
2024年9月 南京医科大学学报（自然科学版），2024，44（9）：1217-1226 ·1221 ·

A GSE17536 E GSE17536 F CRC_TCGA
10.0 Expression 5 Expression
Risk score
Risk score
Survival probability 0.8 P < 0.001 High Risk score 9.0 -4 -2 0 2 4 4 000 0 -2 0 2
1.0
Low
9.5
0.5
8.5
-5
Risk score
0.3
8.0
Risk score
Low
Low
0 HR=2.19，95%CI（1.37-3.50）
High
High
2 000
Alive
Low 92 65 30 9 1 （months） 100 Status （days） 3 000 Status
Alive
50
High 85 39 11 4 1 Dead Time 1 000 Dead
0 35 70 105 140 Time 0 ZEB1⁃AS1 0 ZEB1⁃AS1
Time（months）
PTPN14 PTPN14
MYB MYB
B LINC00973 LINC00973
CRC_TCGA
GDI1 GDI1
Risk score
Survival probability 0.8 High SIX4 ACAT2
1.0
SLC2A3
SLC2A3
Low
SIX4
ACAT2
KRT6A
KRT6A
0.5
ZNF552
ZNF552
0.3
SEMA4C
SEMA4C
P < 0.001
KIF7
0 HR=2.61，95%CI（1.71-3.98）
GABRG2
GABRG2 KIF7
TNFRSF14 TNFRSF14
Low 288 62 13 4 1 LINC00638 LINC00638
High 188 35 04 1 1 OIT3 OIT3
HCH4 HCH4
0 1 125 2 250 3 375 4 500 OFCC1
Time（days） OFCC1
C D CRC_TCGA
GSE17536
1.0 1.0
0.8 0.8
Sensitivity 0.6 Sensitivity 0.6
0.4
Time：AUC（95%CI）
0.4
Time：AUC（95%CI）
1 year：0.67（0.78-0.56） 1 year：0.68（0.77-0.59）
0.2 0.2 3 year：0.68（0.76-0.60）
3 year：0.65（0.74-0.56）
5 year：0.69（0.78-0.59） 5 year：0.74（0.84-0.63）
0 0
.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 .0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
1-Specificity 1-Specificity
A，B：Kaplan⁃meier of PSCRC in validation cohort of GSE17536（A）and CRC_TCGA（B）. C，D：ROC curves of PSCRC in validation cohort of
GSE17536（C）and CRC_TCGA（D）. E，F：Heatmap plots of PSCRC in validation cohort of GSE17536（E）and CRC_TCGA（F）.
图2 PSCRC预后预测的验证
Figure 2 Validation of PSCRC to predict clinical outcome
方面的作用，结果显示 PSCRC 低风险组免疫治疗 CRC_TCGA 3个CRC数据队列，以GSE39582作为训
响 应 率 显 著 优 于 高 风 险 组（P 均 < 0.001，图 练集构建 PSCRC，以 CRC_TCGA 和 GSE17536 作为
6A~C）。化疗预测结果显示 PSCRC 风险分数与伊 外部数据队列验证 PSCRC。单因素生存分析筛选
马替尼、达沙替尼、帕唑帕尼等药物 IC50呈显著负 训练集 GSE39582，获得了 2 663 个 OS 相关基因。
相关（P 均< 0.001，图 6D），与二甲双胍、索拉非尼 LASSO⁃Cox 回归分析获得了由 18 个基因构成的
等药物 IC50成显著正相关（P 均< 0.001，图 6E）。 PSCRC及其风险分数计算公式，低风险组CRC患者
OS 显著优于高风险组，ROC 曲线证实 PSCRC 是一
3 讨 论
种具有良好敏感性和特异性的预后标签。该预测
CRC 是一种常见的消化道肿瘤，严重威胁人们 标签中，ZNF552、OIT3、MYB、TNFRSF14 和 ACAT2
［1］
的生命健康 。化疗和免疫治疗的进步改善了患者 的表达是 CRC OS 的保护性因素，其他基因的表达
的生存期，但是肿瘤异质性依然影响CRC的诊疗效 是 CRC OS 的不良因素。验证队列 CRC_TCGA 和
［6］
果 。本研究旨在构建一种新的整合多因素的CRC GSE17536均验证PSCRC 是一种具有良好敏感性和
预后模型，并尝试预测化疗和免疫治疗疗效。 特异性的预测标签。
研究人员下载并整理了GSE39582、GSE17536和 接下来，本研究对 PSCRC 进行了表征，分析了