Page 51 - 南京医科大学自然版

第44卷第9期 张 虎，毛春蓉，练 云，等. 一种新型结直肠癌预后模型的建立与治疗预测［J］.
2024年9月 南京医科大学学报（自然科学版），2024，44（9）：1217-1226 ·1223 ·

A 0.6 GSE39582 Oxidative phosphorylation
Enrichment score -0.2 0 Peroxisome
0.4
0.2
MYC targets v1
Epithelial mesenchymal transition
-0.4
Angiogenesis
-0.6
E2F targets
-0.8
HEDGEHOG_signalng
MYC targets V2
Apical junction
UV response dn
Ranked list metric -0.2 0 Hypoxia
Low
0.2
G2M checkpoint
DNA repair
KRAS signaling_up
Fatty acid metabolism
High
Inflammatory response
0 10 000 20 000
Rank in ordered dataSet
B 0.6 GSE17536 MYC targets v1 C 0.6 CRC_TCGA Oxidative phosphorylation
Enrichment score -0.2 E2F targets Enrichment score -0.2 0 UV response dn
0.4
0.4
Oxidatve phosphorylation
Angiogenesis
0.2
0.2
0.0
MYC targets v2
Apical junction
-0.4
Kras signaling_up
G2M checkpoint
-0.4
-0.6
Peroxisome
Estrogen response early
Mitotic spindle -0.6 Hedgehog signaling
DNA repair Apoptosis
Myogenesis 0.4 Low Hypoxia
Ranked list metric -0.1 MTORC1 signaling Ranked list metric -0.2 0 TGF beta signaling
Low
Unfolded protein_response
0.2
Inflammatory_response
0.1
0.2
0.0
Spermatogenesis
Apical surface
Fatty acid metabolism
TNFα signaling via NFκb
-0.2
-0.4
PI3K AKT MTOR signaling
High
-0.3
Androgen response
Angiogenesis High Mitotic spindle
0 10 000 20 000 0 20 000 40 000
Rank in ordered dataset Rank in ordered dataset
A-C：The GSEA results of PSCRC in cohorts of GSE39582（A），GSE17536（B），and CRC_TCGA（C）.
图4 GSEA分析PSCRC
Figure 4 The GSEA analysis of PSCRC
TME，加剧肿瘤的侵袭和转移 ［29-30］ 。对于活化记忆 助于提升预后效果。新模型纳入了传统的临床指
+ 标与基因表达数据，其中传统的指标均可从临床获
性CD4 T 细胞，文献报道CRC不良预后标志物TN⁃
FRSF11B 可抑制活化记忆性 CD4 T 细胞浸润 ［31］ ， 得，基因表达数据可以通过 RNA 测序或者反转录⁃
+
且活化记忆性 CD4 T 细胞浸润与 CRC 预后延长有 聚合酶链式反应技术获得，成本不高且技术难度不
+
关 ［32］ 。因此，PSCRC 很可能通过促进 TAN 浸润，抑 大，便于开展预后评估。
制活化记忆性 CD4 T 细胞浸润，促进 CRC 进展，不 最后利用 PSCRC 风险评分预测了 CRC 免疫治
+
利于患者预后。此外，GSEA 富集分析结果显示 疗疗效和化疗药物敏感性，结果显示PSCRC低风险
PSCRC 参与氧化磷酸化、血管新生、缺氧、HEDGE⁃ 组免疫治疗响应率显著优于高风险组，PSCRC风险
HOG通路和炎症应答等信号通路，再次提示PSCRC 分数与伊马替尼、达沙替尼、帕唑帕尼等药物 IC50
具有调节CRC TME的潜在能力。 显著负相关，与二甲双胍、索拉非尼等药物 IC50显
为了构建CRC预后模型，本研究整合传统的临 著正相关，提示 PSCRC 是一个具有潜力的治疗预
床预后指标 TNM 分期、患者年龄、性别和新构建的 测标志物。
PSCRC，绘制了预后列线图和预后校准曲线。预后 总之，本研究不仅构建了一个预后更佳的模
DCA 结果显示整合传统临床指标和 PSCRC 等 7 个 型，还为治疗预测提供了一个具有前景的潜在标志
要素的模型预后效用最佳。为了评估新模型的预 物。但本研究仍存在一定不足，需要在后续研究中
后效果，对比了文献报道的3个CRC预后模型 ［16-18］ ， 得以完善：①纳入更多外部数据队列验证PSCRC的
其DCA评估结果显示新模型的一致性指数最高，有 效能，优化模型的计算方法；②收集临床治疗数据，