Page 61 - 南京医科大学自然版
P. 61

第45卷第12期       李   平,王   峰,李 渊. 冠心病相关长链非编码RNA uc004coz.1的生物学功能与序列分析[J].
                 2025年12月                    南京医科大学学报(自然科学版),2025,45(12):1738-1746                      ·1743 ·


                2.5  uc004coz.1影响细胞周期                             回收后进行TA克隆,挑取10个菌落进行菌液PCR,
                    细胞周期检测结果显示,uc004coz.1敲减后S期                    琼脂糖凝胶电泳结果如图 7C 所示,挑取 3、5、7、10
                和 G2 期细胞较对照组明显减少(P 均<0.01),停滞                     号进行测序,测序结果:5′⁃CACATTACAGTCAAAT⁃
                G0/G1 期细胞明显增多(P < 0.01,图 5),说明敲减                  CCCTTCTCGTCCCCATGGATGACCCCCCTCAGATA⁃
                uc004coz.1能够抑制细胞的增殖。                              GGGGTCCCTTGACCACCATCCTCCGTGAAATCAA⁃
                2.6  uc004coz.1影响细胞周期蛋白表达                         TATCCCGCACAAGAGTGCTACTCTCCTCGCTCCGG⁃
                    Western blot 实验显示 uc004coz.1 敲减后 Cyclin       GCCCATAACACTTGGGGGTAGCTAAAGTGAACTG⁃
                D1、Cyclin E1 表 达 量 较 NC 组 明 显 下 调(P 均 <           TATCCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGGTCATAAA⁃
                0.01),Cyclin B1表达没有明显变化(P=0.08)。说明                GCCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGAC⁃
                uc004coz.1 能够影响细胞周期相关蛋白 Cyclin D1、                ATCACGATG⁃3′。
                Cyclin E1的表达(图6)。                                 2.8  5′⁃RACE结果

                2.7  目的基因扩增及3′⁃RACE结果                                 以样品提取的总 RNA 作为模板,加入 1 μL 5′⁃
                    以样品提取的总RNA作为模板,反转录后进行                         RACE adaptor 反转录为cDNA,进行5′⁃RACE第1轮
                PCR扩增uc004coz.1,琼脂糖凝胶电泳结果如图7A,                    PCR,以第1轮PCR产物为模板,以反向引物进行第

                基因 uc004coz.1 表达丰度较高,尝试进行 3′⁃RACE                 2 轮 PCR 扩增,琼脂糖凝胶电泳结果如图 8A 所示。
                及5′⁃RACE。以样品提取的总RNA进行加尾,以加                        对目的条带进行切胶回收,进行TA克隆,挑取10个

                尾产物为模板进行cDNA反转录,进行3′⁃RACE第1                       菌落进行菌液PCR,琼脂糖凝胶电泳结果如图8B所
                轮 PCR。 以 第 1 轮 PCR 产 物 为 模 板 进 行 第 2 轮            示,挑取 1、4、6、10 号进行测序。测序结果:5′⁃AA⁃
                PCR,琼脂糖凝胶电泳结果如图7B所示。目的条带                          GATTCTAATTTAAACTATTCTCTGTTCTTTCATGGG⁃


                A               siNC                        si⁃uc004coz.1      B
                                     G1:52.59%                      G1:57.92%
                                                                                   80         G0/G1  S  G2
                                     S:33.27%                       S:20.81%
                   400                            400
                                     G2:19.89%                      G2:15.35%      60
                   300                            300                            (%)
                  Count  200                    Count  200                       Distribution  40      **


                   100                            100                              20                     **
                                                                                   0
                                                                                          siNC      si⁃uc004coz.1
                     0                             0
                      0  200  400  600  800  1 000   0  200  400  600  800  1 000
                               FL2⁃A                          FL2⁃A
                   A:The cell cycle graphs of siNC and si⁃uc004coz.1 were detected by flow cytometry. B:Statistical results of cell number in each cell cycle. Com⁃
                               **
                pared to the siNC group,P < 0.01(n=3).
                                                    图5 流式细胞仪检测细胞周期
                                           Figure 5 Cell cycle was measured by flow cytometry


                              si⁃uc004coz.1
                         siNC
                                          Relative expression  of Cyclin B1  Relative expression  of Cyclin D1  Relative expression  of Cyclin E1  **
                Cyclin B1        55 kDa      1.5                      1.5                      1.5
                Cyclin D1        36 kDa      1.0                      1.0                      1.0
                Cyclin E1        48 kDa      0.5                      0.5         **           0.5
                 GAPDH           36 kDa       0   siNC si⁃uc004coz.1   0  siNC si⁃uc004coz.1    0  siNC si⁃uc004coz.1

                   The expressions of Cyclin B1,Cyclin D1,and Cyclin E1 were detected by Western blot,GAPDH representing the internal reference. The gray scale
                                                                                         **
                of the protein strip was analyzed by Image J and GraphPad Prism 7 statistical software. Compared to the siNC group,P < 0.01(n=3).
                                                   图6 Western blot 检测蛋白表达
                                         Figure 6 Protein expression was detected by Western blot
   56   57   58   59   60   61   62   63   64   65   66