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第45卷第12期 李 平,王 峰,李 渊. 冠心病相关长链非编码RNA uc004coz.1的生物学功能与序列分析[J].
2025年12月 南京医科大学学报(自然科学版),2025,45(12):1738-1746 ·1743 ·
2.5 uc004coz.1影响细胞周期 回收后进行TA克隆,挑取10个菌落进行菌液PCR,
细胞周期检测结果显示,uc004coz.1敲减后S期 琼脂糖凝胶电泳结果如图 7C 所示,挑取 3、5、7、10
和 G2 期细胞较对照组明显减少(P 均<0.01),停滞 号进行测序,测序结果:5′⁃CACATTACAGTCAAAT⁃
G0/G1 期细胞明显增多(P < 0.01,图 5),说明敲减 CCCTTCTCGTCCCCATGGATGACCCCCCTCAGATA⁃
uc004coz.1能够抑制细胞的增殖。 GGGGTCCCTTGACCACCATCCTCCGTGAAATCAA⁃
2.6 uc004coz.1影响细胞周期蛋白表达 TATCCCGCACAAGAGTGCTACTCTCCTCGCTCCGG⁃
Western blot 实验显示 uc004coz.1 敲减后 Cyclin GCCCATAACACTTGGGGGTAGCTAAAGTGAACTG⁃
D1、Cyclin E1 表 达 量 较 NC 组 明 显 下 调(P 均 < TATCCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGGTCATAAA⁃
0.01),Cyclin B1表达没有明显变化(P=0.08)。说明 GCCTAAATAGCCCACACGTTCCCCTTAAATAAGAC⁃
uc004coz.1 能够影响细胞周期相关蛋白 Cyclin D1、 ATCACGATG⁃3′。
Cyclin E1的表达(图6)。 2.8 5′⁃RACE结果
2.7 目的基因扩增及3′⁃RACE结果 以样品提取的总 RNA 作为模板,加入 1 μL 5′⁃
以样品提取的总RNA作为模板,反转录后进行 RACE adaptor 反转录为cDNA,进行5′⁃RACE第1轮
PCR扩增uc004coz.1,琼脂糖凝胶电泳结果如图7A, PCR,以第1轮PCR产物为模板,以反向引物进行第
基因 uc004coz.1 表达丰度较高,尝试进行 3′⁃RACE 2 轮 PCR 扩增,琼脂糖凝胶电泳结果如图 8A 所示。
及5′⁃RACE。以样品提取的总RNA进行加尾,以加 对目的条带进行切胶回收,进行TA克隆,挑取10个
尾产物为模板进行cDNA反转录,进行3′⁃RACE第1 菌落进行菌液PCR,琼脂糖凝胶电泳结果如图8B所
轮 PCR。 以 第 1 轮 PCR 产 物 为 模 板 进 行 第 2 轮 示,挑取 1、4、6、10 号进行测序。测序结果:5′⁃AA⁃
PCR,琼脂糖凝胶电泳结果如图7B所示。目的条带 GATTCTAATTTAAACTATTCTCTGTTCTTTCATGGG⁃
A siNC si⁃uc004coz.1 B
G1:52.59% G1:57.92%
80 G0/G1 S G2
S:33.27% S:20.81%
400 400
G2:19.89% G2:15.35% 60
300 300 (%)
Count 200 Count 200 Distribution 40 **
100 100 20 **
0
siNC si⁃uc004coz.1
0 0
0 200 400 600 800 1 000 0 200 400 600 800 1 000
FL2⁃A FL2⁃A
A:The cell cycle graphs of siNC and si⁃uc004coz.1 were detected by flow cytometry. B:Statistical results of cell number in each cell cycle. Com⁃
**
pared to the siNC group,P < 0.01(n=3).
图5 流式细胞仪检测细胞周期
Figure 5 Cell cycle was measured by flow cytometry
si⁃uc004coz.1
siNC
Relative expression of Cyclin B1 Relative expression of Cyclin D1 Relative expression of Cyclin E1 **
Cyclin B1 55 kDa 1.5 1.5 1.5
Cyclin D1 36 kDa 1.0 1.0 1.0
Cyclin E1 48 kDa 0.5 0.5 ** 0.5
GAPDH 36 kDa 0 siNC si⁃uc004coz.1 0 siNC si⁃uc004coz.1 0 siNC si⁃uc004coz.1
The expressions of Cyclin B1,Cyclin D1,and Cyclin E1 were detected by Western blot,GAPDH representing the internal reference. The gray scale
**
of the protein strip was analyzed by Image J and GraphPad Prism 7 statistical software. Compared to the siNC group,P < 0.01(n=3).
图6 Western blot 检测蛋白表达
Figure 6 Protein expression was detected by Western blot

