Page 8 - 南京医科大学自然版
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第45卷第2期
               ·148 ·                            南 京    医 科 大 学 学         报                        2025年2月


                  乳腺癌是全球女性发病率和病死率最高的恶                           serum,FBS)、PRIM 1640和PBS(Sigma公司,美国)。
              性肿瘤   [1-2] ,严重威胁患者生命健康。乳腺癌具有明                         乳腺组织标本源于重庆大学附属肿瘤医院住
              显的异质性     [3-5] :可分为多个分子亚型,不同亚型之                  院患者(入院时统一签署知情同意书,经医院伦理
              间的临床和病理特征各不相同,在治疗敏感性、基                            委员会批准),其中乳腺癌 20 例(Luminal A、Lumi⁃
              因表达、浸润转移、生存预后等方面存在很大差                             nal B、HER2、三阴性乳腺癌,每个亚型5例)、乳腺纤
              异。目前临床将乳腺癌分为 Luminal A、Luminal B、                 维腺瘤2例、正常乳腺组织2例。
              HER2 型和三阴性型等分子亚型,并根据各亚型的                          1.2  方法
              特征进行个体化治疗,包括手术、化疗、放疗、内分                           1.2.1 DNA序列合成与纯化
              泌治疗和分子靶向治疗。乳腺癌的异质性增加了                                  随 机 DNA 库 序 列(5′ ⁃ ATACCAGCTTATTCA
              诊断治疗的难度,探究能够同时结合乳腺癌细胞多                            ATT⁃52⁃NT⁃AGATAGTAAGTGCAATCT⁃3′);异硫氰
              个分子亚型的抗体类似物,将有助于进一步提高肿                            酸荧光素(fluorescein isothiocyanate,FITC)标记引物
              瘤识别和分子治疗的效率。                                     (5′⁃FITC⁃ATACCAGCTTATTCAATT⁃3′);生物素标

                  近年来,采用指数富集的配体进化系统(sys⁃                        记引物(5′⁃trB⁃AGATTGCACTTACTATCT⁃3′)。以上
              tematic evolution of ligands by exponential enrich⁃  DNA序列由上海生工公司进行人工合成、高效液相
              ment,SELEX)技术成功筛选了肿瘤细胞特异性的核                       色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)
              酸适配子    [6-8] ,有望用于肿瘤筛查、诊断、治疗、监测                  纯化和DNA定量分析。
              和研究等。研究发现,采用细胞⁃SELEX筛选的乳腺                         1.2.2 dsDNA库和ssDNA库的制备
              癌细胞特异性 DNA 适配子具有识别乳腺癌亚型细                               参考文献[14],以FITC标记引物和生物素标记
              胞的功能 ,这提示采用细胞⁃SELEX技术获取的适                         引物进行PCR扩增,PCR产物即为双链DNA(double
                      [9]
              配子具有细胞水平的特异性;如果以多种亚型的乳                            ⁃stranded DNA,dsDNA)库。将 dsDNA 库置于碱性
              腺癌细胞为靶标进行SELEX筛选,就可能获取同时                          环境(0.2 mol/L NaOH)经 95 ℃变性5 min后;再用卵
              识别一种以上乳腺癌亚型细胞的适配子,从而有利于                           白素包被的琼脂糖珠分离,以去除生物素化引物所
              提高乳腺癌的诊断和治疗效率。另一方面,不同分子                           在的反义 DNA 单链,保留 FITC 标记引物所在的正
              亚型的乳腺癌有相应的细胞株             [10-11] ,也为筛选识别多        义单链,从而获得单链 DNA(single⁃stranded DNA,
              种乳腺癌细胞的适配子研究提供了可能。                                ssDNA)库,即原始库。PCR 的扩增效果通过 3%琼
                  近年来,尽管细胞⁃SELEX技术本身取得了较大                       脂糖凝胶电泳进行鉴定,并以此来优化PCR反应的
              发展、建立了多种复杂的 SELEX 筛选方法                [12-13] ,但  条件。
              目前尚未发现与本研究方法类似的报道。本研究                             1.2.3 细胞培养
              以细胞⁃SELEX技术为基础,采用不同分子亚型乳腺                              人乳腺癌细胞 MCF⁃7 和 MDA⁃MB⁃231,以及正
              癌对应的细胞株作为靶标,进行交叉串联细胞⁃                             常人乳腺上皮细胞MCF⁃10A,采用常规细胞培养液
              SELEX筛选,最终获取能与不同亚型乳腺癌细胞高                         (PRIM 1640+10%FBS+100 U/mL青⁃链霉素)培养于
              特异性、高亲和力结合的 DNA 适配子,为乳腺癌的                         37 ℃、5%CO2孵箱;细胞生长至对数生长期时,用
              诊断和治疗研究提供一种新的思路和方法。                               洗脱液(PBS+5 g/L 糖+5 mmol/L MgCl2)洗涤 3 次,
                                                                并进行靶细胞和对照细胞的计数、活力检测,备筛
              1  材料和方法
                                                                选之用。
              1.1  材料                                           1.2.4 交叉进行的乳腺细胞⁃SELEX筛选
                  人乳腺癌细胞MCF⁃7和MDA⁃MB⁃231以及正常                         采用常规细胞培养技术,大量培养乳腺癌细胞
              乳腺上皮细胞 MCF⁃10A(ATCC,美国);大肠杆菌                      株和正常乳腺上皮细胞株;待细胞进入对数生长
              DH5α菌株由第三军医大学实验中心提供;卵白素                           期后,用于交叉串联细胞⁃SELEX 筛选。每次筛选

              包被的琼脂糖珠(Amersham Pharmacia Biosciences            前,需注意细胞状态良好、清除死细胞和确保细胞
              公司,美国);PCR试剂盒及相关酶(TaKaRa公司,日                      无污染。
              本);pUC⁃T simple TA 连接试剂盒(北京康为世纪                        筛选流程:通过预实验确定 3 种细胞交叉串联
              生物科技有限公司);酵母 tRNA、牛血清白蛋白                          SELEX 筛选方法,包括 2 种乳腺癌细胞的交叉正筛
             (bovine serum albumin,BSA)、胎牛血清(fetal bovine       选、1 种正常乳腺细胞的负筛选;正筛选部分,每个
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