Page 38 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第2期
·188 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年2月
沉 淀 ⁃ 测 序(chromatin immunoprecipitation high ⁃ 设置 3 个复孔,独立重复 3 次。YY1 上游引物:5′⁃
throughput sequencing,ChIP⁃seq)结果表明YY1可以 CTTTTCACTGGACTTCAATTTGCG⁃3′;下游引物:5′⁃
直接与长链非编码RNA SOX2OT的启动子区结合 , CACTGGTTGTTTTTGGCCTTAGC⁃3′;SOX2OT 上游
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表明 YY1 可能调控 SOX2OT 的转录,SOX2OT 可能 引物:5′⁃AGACAGCTCTGTTCAGTATT⁃3′;下游引
参与胰腺癌的发生和进展。本研究以人胰腺癌细 物:5′⁃TTACACCAGCCTCCAAGA⁃3′;GAPDH 上游
胞株 BXPC⁃3 和 PANC⁃1 为研究对象,探讨 YY1/ 引物:5′⁃ACGGGAAGCTTGTCATCAAT⁃3′;下游引
SOX2OT 轴在胰腺癌细胞迁移和侵袭中的作用,为 物:5′⁃TGGACTCCACGACGTACTCA⁃3′。
YY1作为胰腺癌早期诊断、预后及治疗的靶标提供 1.2.3 Western blot
理论依据。 使用 RIPA 细胞裂解液抽提细胞总蛋白,并用
BCA 蛋白浓度测定试剂盒测定浓度。蛋白加 1 ×
1 材料和方法
SDS 上样缓冲液后于 100 ℃水浴 5 min,取 20 μg 进
1.1 材料 行 SDS⁃PAGE 电泳,而后把蛋白质转移至 PVDF 膜
人胰腺癌细胞株 BXPC⁃3 和 PANC⁃1 购于上海 上,5%脱脂奶粉封闭2 h,加入1∶1 000 一抗,4 ℃过
细胞所;YY1过表达及YY1干扰的稳转细胞株由本 夜,TBST 洗涤 3 次,加二抗(1∶2 000)室温孵育 1 h,
实验室构建及保存 ;PBS、胰酶、DMEM 高糖培养 TBST洗3次,然后用ECL化学发光试剂于暗室自显
[4]
基、胎牛血清(Wisent 公司,加拿大);双抗(青、链霉 影。用成像分析系统拍照记录并进行灰度分析。
素)、RIPA 细胞裂解液、PMSF、BCA 蛋白浓度测定 1.2.4 细胞划痕实验
试剂盒、GAPDH 抗体、二抗(上海碧云天);TRIzol、 先用记号笔在 6 孔板背面划横线,每隔 0.5~
Lipofectamine 3000 转 染 试 剂(Invitrogen 公 司 ,美 1.0 cm一道,横穿过孔;每孔至少穿过5条线。在孔
国);反转录试剂盒、SYBR green master mix、蛋白 中加入 5×10 个细胞。第 2 天用枪头垂至于背后的
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Marker(Bio⁃Rad公司,美国);PVDF膜、ECL试剂盒、 横线划痕。PBS洗细胞3次,去除划下的细胞,加入
Transwell 小室(Millipore 公司,美国);Matrigel 基质 无血清培养基,放入 37 ℃、5%CO2培养箱培养。按
胶(BD公司,美国);细胞培养耗材(Corning公司,美 0 h、24 h时间点取样,拍照。
国);YY1抗体(Abcam公司,美国);其他常用试剂均 1.2.5 Transwell细胞侵袭实验
为国产分析纯;引物由上海吉玛设计合成;siRNA片 将Matrigel 1∶8稀释,包被Transwell小室底部膜
段由广州锐博设计合成;定量 PCR 仪为美国 ABI 的上室面,置 37 ℃ 30 min,使 Matrigel 聚合成凝胶。
Stepone plus 型号;倒置荧光显微镜为美国 Nikon 使用前进行基底膜水化。细胞撤血清饥饿12 h后,
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Ti⁃E 型;成像分析系统为美国 Protein simple Fluo⁃ 消化细胞,调整细胞密度至 5×10 个/mL,取细胞悬
rchem 型。 液 100 μL 加入 Transwell 小室。24 孔板下室加入
1.2 方法 600 μL含20%胎牛血清的培养基,放入37 ℃ 5%CO2
1.2.1 细胞培养 培养箱培养 24 h。随后取出 Transwell 小室,弃去孔
BXPC⁃3 和 PANC⁃1 细胞使用含 10%胎牛血清、 中培养液,PBS洗2遍,甲醇固定30 min,将小室适当
50 U/mL青霉素和50 mg/mL链霉素的DMEM高糖培 风干。0.1%结晶紫染色 20 min,用棉签轻轻擦掉上
养基,在37 ℃、5% CO2饱和湿度下培养,待细胞融合 层未侵入细胞,用PBS洗3遍。400倍显微镜下随机
率为 70%左右时,以 0.25%胰蛋白酶、0.02%乙二胺 5个视野观察细胞,记数。
四乙酸消化、传代。 1.2.6 SOX2OT过表达慢病毒及稳转细胞株构建
1.2.2 定量RT⁃PCR SOX2OT过表达慢病毒及其对照病毒由上海和
使用TRIzol试剂抽提细胞总RNA。分光光度法 元公司构建。将全长人 SOX2OT 亚克隆入 pLenti⁃
测定浓度后,根据说明,使用 1 μg 总 RNA 和 iscript CMV⁃MCS⁃3FLAG H155载体,测序验证。YY1过表
cDNA 合成试剂盒在 20 μL 的最终体积中进行逆转 达BXPC⁃3细胞(BXPC⁃3⁃YY1)感染SOX2OT过表达
录(RT)。采用 SYBR green master mix 在定量 PCR 慢病毒或对照慢病毒。6~8 h 后换液并在荧光显微
仪 中 进 行 定 量 PCR。 采 用 2 - ΔCt 法 ,即 用 YY1/ 镜下观察荧光,批量扩增培养后用嘌呤霉素进行细
SOX2OT(靶基因)的 Ct 值减去 GAPDH(内参基因) 胞筛选,加药浓度由低到高,直至细胞正常培养状
的Ct值,计算相对基因表达量。每一个定量PCR均 态,筛选出稳转细胞株(BXPC⁃3⁃YY1⁃SOX2OT 和