Page 10 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第6期
·788 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年6月
A B
30 Group 2 Group
IUGR⁃D1
1 NC⁃D1
0
25
-1 -2
( FDR) 20
-1*log10 15
10
5
0
-4 -2 0 2 4
logFC
表达下调
表达上调
表达无差异
NC⁃D1⁃1 NC⁃D1⁃2 NC⁃D1⁃3 IUGR⁃D1⁃1 IUGR⁃D1⁃2 IUGR⁃D1⁃3
A:差异表达LncRNA的火山图,红色表示上调,绿色表示下调,黑色表示无差异;B:差异表达LncRNA的热图,横坐标表示样本,纵坐标表
示差异表达LncRNA。
图1 IUGR、正常新生小鼠差异表达LncRNA
Figure1 Differentially expressed LncRNAs between IUGR and normal neonatal mice
表2 部分差异上调或下调的LncRNAs
Table 2 Part differentially up⁃ or down⁃regulated LncRNAs
ID LncRNA名称 Log2 (变化倍数) P值 上调或下调
ENSMUST00000148682 Tnks1bp1⁃205 -12.133 <0.001 上调
ENSMUST00000165584 Papola⁃207 011.671 <0.001 上调
ENSMUST00000137591 Yars⁃204 -11.292 <0.001 上调
ENSMUST00000147816 Bptf⁃206 -11.159 <0.001 上调
ENSMUST00000212315 Zfpm1⁃205 -10.448 <0.001 上调
ENSMUST00000218372 Ddx50⁃206 -11.004 <0.001 下调
ENSMUST00000235411 Sec11c⁃208 -10.917 <0.001 下调
ENSMUST00000209449 1300002E11Rik⁃205 -10.751 <0.001 下调
ENSMUST00000207039 Homer2⁃203 -10.485 <0.001 下调
ENSMUST00000150899 Pex5⁃207 -10.176 <0.001 下调
个基因)、“pathway in cancer”(285 个基因)、“Endo⁃ tion regulator”“nucleic and binding transcription fac⁃
cytosis”(228 个基因)、“HTLV⁃1 infection”(181 个基 tor activity”(图3B)。
因)、“Proteoglycans in cancer”(171 个 基 因)(图 Trans:差 异 LncRNA Trans 调 控 靶 基 因 GO、
3A)。按照GO分析基因表达数目可知,BP中前5位 KEEG 富集分析如图 4 所示。按照 KEEG 信号通路
是“cellular process”“single⁃organism process”“biolog⁃ 富集分析中基因数量,前 5 位分别是“pathway in
ical regulation”“metabolicprocess”“response to stimu⁃ cancer”(260 个基因)、“Neuroactive ligand⁃receptor
lus”,CC 前 5 位是“cell”“cellpart”“organelle”“mem⁃ interaction”(173个基因)、“HTLV⁃1 infection”(166个
brane”“organelle part”,MF 前 5 位是“binding”“cata⁃ 基因)、“cAMP signaling pathway”(157个基因)、“Ad⁃
lytic activity”“transporter activity”“molecular func⁃ renergic signaling in cardiomyocytes”(138 个 基 因)