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第41卷第6期
·792 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年6月
图7 差异LncRNA与差异mRNA的 Cis作用图
Figure 7 The Cis between differentially expressed LncRNAs and mRNAs
Tcf3-209 Slc25a38-202 Rp9-203 Nfe2l1-211 Zfp78-205 Ank1-216 Pard3-202 Htr1d-201 Kat14-206 Slc7a8-201
Sparc-209 Mier3-201 Tsku-206 Zfp384-205 Elf4-201 Gtf2i-219
Synpo-202 Hnrnpa1-205 Ehbp1-207 Slc35c2-203 Tab2-201 Lin28b-201
Mpdz-20 Parp6-2033 Thsd4-201 Syt6-202 Cdk9-202 Dtnbp1-202
Oxr1-207
Got1-204
Lrp8-218 Bak1-204 4932438A13Rik-204 Rps10-202 Fgfr2-207 Gm14434-202 Mindy1-201 Slc17a5-202 Fam220a-208 Kdm2a-203 Sec24c-202 Mcm9-208 Lrrc74b-201 Chtf18-207
Mecom-206 Psmd8-201
Lrrc8a-202
Rasgrp2-201 Amot-203 Asph-212 Ppp2r2b-203 Nlrx1-203 Tbc1d24-204 Ccdc85b-202 Brd3-203 Ttc3-217 Mycl-202 Erbin-202 Zfp385a-202 Champ1-202 Grin2c-202 9130221H12Rik-201 Palld-204 Ntpcr-204
Zmynd8-220 Pggt1b-201 Kmt2c-202 Zscan21-202 Mpo-203 Adra1a-201 March1-203 Slc2a Plekha6-2041-204 Vps39-204March7-209 Nav2-209 Ank1-209
AW554918-201
Nhsl2-201 Agpat5-202 Morf4l2-204 Gstt3-205 Efr3a-204 Mapk9-208 Pard3-216 Glod4-206 Tm9sf1-203 Kif21b-204Ubr4-203 Hsph1-201 Pnck-201 Ep Ksr1-207b41-207 Phc1-203 Apob-202 Abcc2-201 Tlr3-202 Smndc1-205 Gm16001-201 Gm10134-202
Sptan1-205
TCONS_00126756
Nkapd1-205
Iars-206
Cntn4-206 4930451G09Rik-201 Atp6v0a1-210 Grm8-206 Filip1-202 Trmt61b-202 Sipa1-205 Ttc38-202
Plec-217 Stxbp5-211 Top2a P4ha3-205 Pcgf5-202 9330182L06Rik-207 Abca3-203 Capn1-202 Pou2f1-205 Scn5a-201 Fcho1-201 Zfp729b-203 Atp5b-207 Golt1b-202 Tcp11l1-201 Syk-201
L3mbtl3-205-204
Ankle2-203
Ralgapb-209
Gm28875-201Dennd4c-203
Hira-209Mbnl1-212 Baz2b-206
Tbkbp1-204 Myo1b-2 Edn3-20410 Pcnt-208 Olfr1393-203 Rab11b-206 Sh3bp1-203 Bckdhb-206 Scrib-204
Bbs4-203
Rbm12-202
Tom1l2-203Unc13d-202 Actr3-201 A130077B15Rik-201 Vps8-205 TCONS_00002829 Atad2-208 Fgfr3-215 Tepsin-203 Myo6-205 Gm14440-202 Ilkap-213 Ralgps2-214 Arrb2-201 Cbfa2t2-204 Icos-202 Rian-261
Arid4a-203
Mbnl1-208
Pfdn4-204
Cenpi-205Tulp4-210
TCONS_00049248 Arid5a-202
Spata6-211
Reep1-203
Clasp1-224
Lpar2-202 Gmip-209 Wapl-203 Gprasp1-203 Anapc7-203Blm-202 Scmh1-204 Mfap3l-202 Rnf43-201 Sigmar1-206 Slc25a53-204 Cmip-201 Spata13-208 Wdr43-204 Lmo7-205
Arf4-206
Tmem
Atp11c-203189-204
Kng1-202
Crlf3-202
Apbb2-209
Tyrobp-201
Npdc1-207 Hps1-201 Iqsec2-207 Lifr-204 Errfi1-203 G3bp2-210 Depdc5-217 Zfp697-202 Mapk14-209 Nfkbib-201 Tank-201 Cyp2d26-201Ehbp1l1-202 Fam135a-208 Atp1b2-202 4931440P22Rik-201 Camsap2-206 Pigq-222 E130308A19Rik-202 Cramp1l-201 Plec-215 Vmn2r9-204 Ackr2-202
Tmem87a-207
Gigyf2-221
Klhl12-202
Gap43-202
Fcf1-202 Rbbp5-206 Cmah-202 Rif1-202 Tnfaip2-211 Stag2-202 Ash2l-203 Mertk-202 Akap11-203 Sept4-203 Mtch1-201 Bean1-204 Larp1b-207 Cpne8-202 Oma1-201
Mtmr14-202
Sec16a-208
Abl Nptxr-201im2-201 Mapkap1-203 Wnk2-207 Cdkl5-205 Myo7a-213 Slc39a3-205 Plk3-203 Cbfb-203 Pum2-209 Tns1-201 Nav1-201 2610035D17Rik-203 Atp11b-208 Myh1-203Map4k5-202Mtf1-201 Rbbp5-201 Tubgcp6-201
Nfatc2-209 Igf2-201 Psat1-207 Lsr-205 Hdac7-201 Gria1-202
Zg16-201 Lrrcc1-205
Unc79-201Slc38a3-206 Kif21a-205 Wnt7b-205 Ica1-203 Prmt6-202 Atf2-203
Arid1b-201
Fryl-219
Atp6v0a1-202 Socs2-214 Nup210-206 0610010F05Rik-203 Sh2b1-204 Ppil1-203 Ggt1-209 Arhgap44-204 Taf6-202 Lpcat1-202 Atf2-202
Tjp3-205 Zfp292-202
Lck-202 Ccdc163-204 Rbm47-209 Prdm16-203 Hist1h2br-203 Ryr3-201 Rragd-201
Zfp869-213 Zdhhc18-201 Aftph-209 Myo18a-202 Lrsam1-201 Fam160a2-202
Dzip1l-201 Fam219a-201 Gm14326-204 Pcx-202 Cntrl-203 Nfe2l2-202 Gm47163-201
Bcor-204
Serpina3f-202 Napg-215 Ctnnd1-214 Dnmt1-203 1810014B01Rik-201 Mob4-202
Utrn-212
Banf1-203 Pfkm-205 Trpm2-203 Mul1-201
Fam220a-204 Plekhg1-208 Ccdc114-201
Heatr1-206
TCONS_00034553
Fkbp5-202
Tspoap1-201
Poldip3-202 Prdm11-205
Eps8-209 Clec2d-201 Myl6-213 2810429I04Rik-203 Gm26576-201 Itpr1-201 Errfi1-201 Surf6-204 Lsm14a-208 Nop58-211 Epb41-214
Tesmin-203 Chdh-202 Tpm3-210
Gm11639-203 Abca13-202
2410021H03Rik-201 Grhl2-201
4933404O12Rik-203 Gm44117-201 1500002C15Rik-202
3830432H09Rik-202 Col11a2-211 Zrsr1-203 Abcb8-202 Chd9-213 Rnf214-213 Eya3-208 Elmod2-206 Rnmt-207
Scaf11-203 Pes1-202 Tdp2-205
Tfb2m-203 Epb41l3-215
Eef1b2-209 Angptl4-201
Inppl1-207
Cpne4-201 Ubap1-205 Hmgcl-202 Foxp1-229
Dock7-203 Gm26782-203 Exoc3-203
Slc15a2-214
Col11a2-203 Kcnk13-201 Ndufb1-ps-202 Arfgap1-208 Plcg1-204 Fgd4-204 Rgs11-201 Ing1-202 Crebzf-209 Bivm-201 Homer2-203 TCONS_00010281
Med15-213 Plscr2-202
Ttyh3-206 Mirt2-203 Gcnt1-201 Osr1-202 Fam83d-201 Gbp9-201 Alx4-202 Paqr9-201
Alkbh3-206 1110002L01Rik-201 Mief1-207 TCONS_00022173
Rpl37rt-201 Gm20878-207 Gbf1-213 Stard8-202 TCONS_00012853 Igf1os-202
Unc80-204 Zfp595-205
Gatb-202 Bclaf1-204 Rab27b-203 Brpf1-209
Blm-201 Ubl4a-203 Nadk2-209 Sdhaf3-202 Dysf-214 Dnase2a-207 Ntpcr-206 Cdo1-205 TCONS_00024969 Gm49032-201 Papola-207 Acad9-207 Itgam-201
Pgpep1-201 Morf4l2-213 Tfr2-206 Prss3-201 Letm2-201 Ciz1-202 Nxpe5-204 Scly-208
E330020D12Rik-201 Morrbid-210 Gm28187-201 Rab11fip1-205 Slx4ip-204
Dusp11-206 Cachd1-204 Mkrn2-202 Eef2kmt-206 Zc3h15-205 Nfatc2-203 Pisd-ps1-203 Amn1-207
Parp11-201 Usp43-201 Igip-201 Adgrb1-201 Prelp-201
Manf-202 Gm15545-204 Trarg1-201 Hccs-202 Cpt2-201 Dach1-202 Bicd1-202 H3f3b-202 Nphs1-203 Reg1-202 Rnf19a-203 Cyp2e1-201 Rnf123-207 Il16-203 Csta2-202 Hdac4-202 Elavl4-202 Mcm10-202 Ugt2b35-201 Nr1h3-202 Axin1-201
Golga1-201
Timp3-203 Gm9949-201 TCONS_00035286 Dcbld2-207 Zfp444-209 Lmbrd2-202 Ttll3-208
Gm29100-201 Abca2-202 Zc3h12b-204 Pkn2-202 Stk11-204 Pmm1-209 4930430F08Rik-207 Meg3-203 Pik3c2g-207 Trit1-203 Gm609-202 Zdhhc4-211 TCONS_00007633
Frem1-205
Fut10-201 Tle3-208 Faap100-201 Supt4a-203 C77080-202 Polq-206 Cacnb4-201
Camk2g-202 Cenpl-206 Acot11-203 Madd-205 Rpl14-205 Hist1h2bc-201 Add2-207 Hist1h1c-201 Tcp11-205 Polk-206 Ggnbp2-201 Ddr2-205 Zfp512-208 Mab21l3-201 Bnc2-201 Ocrl-203 Arntl-206 Ncoa7-201 1700019D03Rik-201 Tes-201 Eva1c-204 Rimbp2-208 Mapk1-204 Abr-201 Gtse1-202 Itih3-201 Ank3-230 Unc5cl-201 Jade3-202 S100pbp-204
Rian-241 Gm46633-201 Gm10824-201 Pax6os1-202 TCONS_00010257 Plpp2-202 Ddx50-206 Gm10062-201 Me3-207 Ttc7-206 Rbm47-208 TCONS_00071714 Exoc3l-207 Clpb-210 4930448E22Rik-202 Ppp1r15b-202 Gm17690-201 Dnajc7-205 Slc9a8-209 Set-206 Wdsub1-210 Gm20554-201 Tprgl-204 TCONS_00065022 TCONS_00014274 Gm47283-206 Lclat1-204 Ndufs7-206 Gm49542-201 2810433D01Rik-201
Ccdc77-202 Rasl11b-201 Lins1-201 Maf1-204 Neurl4-213 Neurl1a-202 Dhx34-201 Apol9b-201 Sh3bp1-202 Sipa1l2-204 Tef-201 Nfam1-201 Rrp1-206 Atp10d-202 Dnajc5-203 Ptpn21-201 Hist1h2bm-201 Cxcr4-201 Tpm2-201 Usp20-211 Arid5a-204 Cd47-202 Il15ra-217 Adcyap1r1-206 Sept4-201 Blvrb-204 Ankef1-201 Vps26a-204 Nr3c2-201 Acbd5-206
1810032O08Rik-205 Lin28b-202 Eif2s3y-204 Med21-204 Zfp608-204 Gm12500-202 Gm35551-201 TCONS_00039024 Tvp23b-202 Dixdc1-205 Nme6-212 Rhobtb2-203 TCONS_00060962 Rbm39-221 Ranbp3-203 Dock9-203 4930402H24Rik-205 E430024I08Rik-208 Spin1-202 Hp-203 Zfp871-203 Cytip-205 Ywhaz-209 TCONS_00091341 TCONS_00002480 Map2k5-203 Dusp7-204 TCONS_00118673 Card19-202 Akap11-204
Cdkl3-202 Dedd-203 Kdm1b-204 Sbf2-201 Duxbl1-201 Pdx1-201 Vat1l-201 Atxn3-204 Atxn7l2-202 Hmgcs2-201 Cpeb4-203 Fam171a1-203 Colca2-202 Ins2-206 Krcc1-201 Prkab1-201 Bicd2-202 Itga9-201 Fyn-206 Pdgfd-201 Pdp1-206 Tmem161a-201 Slc7a7-212 Heatr5b-206 Mef2c-228 Cdca4-202 Pim1-203 Leprot-202 Arhgef17-204 Rpl3-205
Ric8a-204 Aqr-204 Cdt1-202 Gm48796-201 Gm36266-201 Fam20c-202 Gm19605-201 Ptpmt1-205 Wdr54-201 4930525G20Rik-201 Pradc1-205 Camkmt-202 Tepsin-205 TCONS_00011286 Aldh16a1-210 Osbpl10-203 Tfam-204 Lcn2-204 Timp3-204 Gm13657-201 Col16a1-211 TCONS_00054037 Magi2-209 TCONS_00034740 TCONS_00016767 Gpr137b-ps-203 Gm40909-201 Zfp644-210 TCONS_00043619 Gm11963-201
Btg2-201 Kdm5d-207 Xpo4-201 Gm2663-201 Rab7-202 Cnot7-203 Elovl4-201 Aatk-201 Pnpla6-201 Ubap2-201 Ino80d-206 Spire2-201 Hells-201 Sde2-201 Fam168b-203 Gask1a-201 Mndal-201 Gmeb1-202 Zfp758-203 Ncoa1-203 Cnot2-210 Dab2-203 Zzz3-210 Kdm6a-205 Vipr2-201 Tfcp2-204 Dhcr7-202 Yod1-201 Hamp2-201 Tasor-201
Zfp862-ps-204 Sytl2-205 5930430L01Rik-201 TCONS_00044962 Mier3-211 TCONS_00096860 Srebf1-211 Jpx-207 6430503K07Rik-201 TCONS_00040254 Itgb6-204 BB123696-202 Pgpep1-207 TCONS_00106672 Zfr-204 Acot1-204 Rian-207 Gga3-209 9430065F17Rik-202 Usp8-203 Gm16551-203 Ddx31-203 Plut-202 D930016D06Rik-201 Entpd2-203 AC132253.6-201 Gtdc1-212 Cd300lf-206 TCONS_00046736 Stab2-204
Specc1-212 Rad50-202 Ccne2-207 B3gnt2-201 Map2k7-202 Aen-201 Smox-205 Otulinl-201 Pfkfb2-208 Ddi2-201 Slc16a3-202 Reg1-201 Smc4-202 Ctrl-201 Phf21a-201 Olfr78-201 Cdca3-201 Hdac7-205 Cdc45-202 Rnf32-201 Glipr2-202 Rab3il1-209 Drc1-201 Dync2h1-202 Zfp451-206 Cldn15-201 Slc41a3-201 Inpp4b-209 Setd1a-202 Pstpip1-201
Cit-216 4930528D03Rik-202 Eif4a1-208 9530026P05Rik-203 TCONS_00047611 Tie1-202 Cytip-204 A030001D20Rik-201 Gm10644-201 Rai1-205 Sec11a-208 Gm10605-202 Gm12059-201 Psrc1-207 Heca-204 B130034C11Rik-201 Rnf168-202 1810053B23Rik-204 Nlrp1c-ps-201 Dipk2b-202 Gm47283-207 Slc9a8-213 Gm9917-202 Gm36377-201 Ttc19-204 Eif2s3x-203 Pla2g1b-205 Limch1-215 Dnaja1-206 Gm16008-201
Cmas-203 Ttc21b-201 Smarcad1-215 Ercc8-205 Lepr-202 Rpgrip1l-204 Fgfr3-201 Dgcr2-203 Ache-201 Slc2a2-201 Stk24-201 Kirrel2-201 Slc39a5-202 Ssr1-203 Rassf5-203 Ranbp9-201 Suox-201 Mia2-214 Setd1b-206 Armcx1-205 Kif16b-205 Usp9x-201 D1Ertd622e-201 Zfp235-202 Arel1-202 Fam102b-201 Spon2-201 Cyth2-205 Mark2-215 Was-201
Psmd14-208 5033406O09Rik-202 Sirt4-205 9230105E05Rik-201 1810026B05Rik-206 Mllt6-204 Exosc10-206 Limd1-202 Prodh-202 D130017N08Rik-202 Ago3-206 Gm15998-201 Pbk-203 Taf2-204 Gm49439-202 Scfd2-204 E230001N04Rik-202 Camk2d-209 Gpr19-206 Firre-203 TCONS_00072274 Gm11423-201 Slc20a1-205 Phf20-202 Reck-202 Raly-210 Gm7240-204 Nr2c2-206 Mtf2-212 TCONS_00063781
Slc40a1-201 Tent5a-202 Cacna2d1-203 Gbgt1-203 Csf2rb2-201 3425401B19Rik-201 Psme2-201
Gsr-202 Rian-239 TCONS_00081122 TCONS_00040356 1700097N02Rik-201 Mbd5-209 Chd2-214
图8 差异表达LncRNA与差异表达mRNA的Trans作用图
Figure 8 The Trans between differentially expressed LncRNAs and mRNAs