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第41卷第6期 周如玉,平逸帆,张 元,等. 基于叠氮溴化丙锭结合高通量测序技术分析口腔综合治疗台水路系统中
2021年6月 活菌多样性的研究[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(06):847-855 ·851 ·
OTU水平、Coverage指数、Shannon指数、丰富度 菌门(Actinobacteria)(1.13%)。以上菌门在 33 个样
指数等多样性统计指数提示 DUWL 中存在丰富的 本中检出率为100%
细菌群落构成和多样性(图 3)。E 组物种丰度指数 微生物属分类分析:从属的分布水平看(图5),相
(Chao、Ace 值)显著高于 P 组,差异有统计学意义 对丰度较高的菌属有栖热菌属(Thermus)(10.32%)、鞘
(P < 0.001);物种多样性指数(Simpson、Shannon)显 脂单胞菌属(Sphingomonas)(10.19%)、短芽孢杆菌
示两组之间差异没有统计学意义(P > 0.05)。 属(Brevibacillus)(7.04%)、军 团 菌 属(Legionella)
2.2.2 微生物群落组成分析 (6.09%)、厌氧芽孢杆菌属(Anoxybacillus)(5.95%)、
微生物门分类分析:从门的分布水平看(图4), 新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)(4.62%)、不动
在所有序列中,变形菌门(Proteobacteria)(56.71%) 杆菌属(Acinetobacter)(4.35%)、Reyranella(2.94%)、
是相对丰度占比最高的门类,其次是厚壁菌门(Fir⁃ Obscuribacterales_norank(2.56%)、肠球菌属(Entero⁃
micutes)(16.89%)、异常球菌⁃栖热菌门(Deinococcus⁃ coccus)(2.34%)、Methyloversatilis(1.73%)、全孢菌属⁃
Thermus)(10.36% )、蓝 藻 菌 门(Cyanobacteria) 未培养(Holosporaceae_uncultured)(1.44%)、生丝微
(3.10%)、浮霉菌门(Planctomycetes)(2.78%)、酸杆 菌属(Hyphomicrobium)(1.33%)、浮霉状菌科⁃未培
菌门(Acidobacteria)(2.11%)、拟杆菌门(Bacteroide⁃ 养(Planctomycetaceae_uncultured)(1.30%)、水杆菌
tes)(1.45%)、衣原体门(Chlamydiae)(1.20%)、放线 属(Aquabacterium)(1.12%)、亚硝化单胞菌科⁃未培
600 * 600 * 0.4 5
500 500 0.3 4
Chao指数 400 Ace指数 400 Simpson指数 0.2 Shannon指数 3 2
300
300
200
100
100 200 0.1 1
0 0 0.0 0
E组 P组 E组 P组 E组 P组 E组 P组
两组比较,P<0.001 。
*
图3 两组Alpha多样性分析
Figure 3 Alpha diversity analysis of the two groups
Proteobacteria Acidobacteria Aerophobetes Chlorobi
Firmicutes Bacteroidetes Chloroflexi Verrucomicrobia
Deinococcus⁃Thermus Chlamydiae Bacteria_unclassified Armatimonadetes
Cyanobacteria Actinobacteria TM6 Others
Planctomycetes SHA⁃109 Nitrospirae
100
80
60
相对丰度
40
20
0
E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14 E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10
横坐标是样本编码,纵坐标为相关物种在样本中的比例,不同的物种以不同的颜色表示。
图4 E组和P组33个样本菌群在在门水平上的分类
Figure 4 Dominant bacterial communities at the phylum level of 33 samples from E group and P group