Page 75 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第6期 周如玉,平逸帆,张 元,等. 基于叠氮溴化丙锭结合高通量测序技术分析口腔综合治疗台水路系统中
2021年6月 活菌多样性的研究[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(06):847-855 ·853 ·
A
95%CI P值
Proteobacteria 0.984 4 E组
P组
Fimicutes 0.709 8
Deinococcus⁃Thermus 0.104 0
Cyanobacteria 0.017 8
Planctomycetes 0.449 0
Acidobacteria 0.074 7
Bacteroidetes 0.068 5
Actinobacteria 0.008 2
Chiamydiae 0.024 3
SHA⁃109 0.468 6
Aerophobetes 0.001 4
Chlorofiexi 0.000 0
unclassified_k_norank_d_Bateria 0.006 5
TM6 0.002 0
Nitrospirae 0.112 6
-25 -20 -15 -10
0 10 20 30 40 50 -5 0 5 10 15 20
Proportions(%) Difference between proportions(%)
B
95%CI P值
Thermus 0.104 0 E组
P组
Sphingomonas 0.829 4
Brevibacillus 0.739 2
Anoxybacillus 0.299 2
Legionella 0.000 8
Acinetobacter 0.281 4
Novosphingobium 0.317 8
Reyranella 0.444 9
Methyloversatilis 0.000 7
norank_o_Obscuribacterales 0.024 3
Enterococcus 0.421 9
uncultured_f_Holosporaceae 0.890 9
Hyphomicrobium 0.709 8
Sphingobium 0.953 1
unclassified_f_Bradyrhizobiaceae 0.860 1
-25 -20 -15 -10
0 4 8 12 -5 0 5 10 15
Proportions(%) Difference between proportions(%)
A:两组样本门水平比较,B:两组样本属水平比较。
图6 两组样本门水平和属水平物种丰度差异
Figure 6 Differences in species abundance at phylum level and genus level between the two groups
并且这两组样本在 PCoA 的横轴上被区分,形成了 存在 E 组或 P 组。Miseq 测序结果中未被分类或是
两个单独的集群。这表明两组样本组内群落间的 尚未被培养出的菌属约占检出菌属的50%,这些都
相似性较高,而这两组样本组间的群落组成存在轻 是以往研究中未能培养出的或者未知的种属。在本
微差异性。 研究中,所有样本均检测出了4种条件致病菌属:军
团菌属、不动杆菌属、肠球菌属、假单胞菌属,检出
3 讨 论
率为100%。Göksay等 曾对土耳其伊斯坦布尔市的
[13]
通过PMA预处理方法与Miseq高通量测序技术 59个DUWL水样进行了细菌培养,仅在其中的14个
检测了33台DUWL水样中活菌群落构成和多样性, 样品中检测出了假单胞菌,检出率为24%。我们前
研究结果表明,DUWL 中微生物群落多样性的信息 期也对条件致病菌进行培养研究,采用CFC假单胞
要比以往研究结果丰富,且检出的细菌种属类别也 菌琼脂培养基对科室 25 个 DUWL 水样进行了细菌
[12]
远远高于以往的检测方法 。33台DUWL样本中共 培养,在不同浓度条件下均未检出假单胞菌,在成
得到978 054条优质序列,两组共有的OTU为753个, 功完成高通量测序的 16 个样本中均检测到了假单
[14]
检测的共有优势菌门及共有较高丰度的菌属是DU⁃ 胞菌属的存在,丰度0.52%~8.32%不等 。
WL 中的共有核心微生物,其中一些细菌属序列仅 军团菌属和假单胞菌属这两种常见的条件致