Page 74 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第6期
               ·852 ·                            南 京    医 科 大 学 学         报                        2021年6月


              养 Nitrosomonadaceae_uncultured(1.05%)、鞘脂菌属        测出81个菌属,有8.73%(59 514/681 674)的序列不
              Sphingobium(1.01%)。以上菌属在33个样本中检出                  能被归为任何菌属;P 组共检测出 54 个菌属,有
              率为100%。33个样本检测出了4种条件致病菌属:                         11.05%(32 739/296 380)的序列不能被归为任何菌
              军团菌属、不动杆菌属、肠球菌属、假单胞菌属                             属,故只能在更高一级的分类水平中进行分析。
             (Pseudomonas)(0.44%),检出率为 100%。E 组共检                    组间门、属分类差异性分析:基于群落丰度数

                  Thermus                 Aerophobetes_norank   Rhodospirillaceae_uncultures  Oligoflexales_norank
                  Sphingomonas            Planctomyces          Comamonadaceae_unclassified  S⁃70_norank
                  Brevibacillus           Subgroup_4_unclassified  Vampiroviorionales_norank  Oxalobacteraceae_unclassified
                  Legionella              Candidatus_Rhabdochlamydia  Nitrospira       Enterobacteriaceae_unclassified
                  Anoxybacillus           Geobacitlus           Alphaproteobacteria_unclassified  AKIW1012_norank
                  Novosphingobium         Phreatobacter         Acetobacteraceae_uncultrued  Bacillus
                  Acinetobacter           Bradyrhizobizceae_unclassified  Neisseriaceae_uncultured  Azospirillum
                  Reyranella              Prevotella_7          Lysinibacillus         Tepidimonas
                  Obscuribacterales_uncultured  Erythrobacteraceae_unclassified  SM2D12_norank  Exiguobacterium
                  Enterococcus            Bacteria_unclassified  Sh765B⁃TzT⁃29_norank  Empedobacter
                  Methyioversatilis       Anaerolineaceae_uncultured  NKB5_norank      Inquilinus
                  Holosporaceae_uncuitured  Aquicella           KCM⁃B⁃60_norank        Beggiatoa
                  Hyphomicrobium          Azoarcus              OPB56_norank           7B⁃8_norank
                  Planctomycetaceae_uncultured  TM6_NORANK      Ectothiorhodospiraceae_norank  Delftia
                  Aquabacterium           Dechioromonas         Staphylococcus         Rickettsiales_unclassified
                  Nitrosomonadaceae_uncultured  Coxiella        Pesudorhodoferax       Sulfuritalea
                  Sphingobium             Desulfurellaceae_uncultured  Mitochondria_norank  Caulobacter
                  Legionellaceae_uncultured  Pseudomonas        Bryobacter             FukuN18_freshwater_group_norank
                  GR⁃WP33⁃30_norank       Coxiellaceae_uncultured  Silanimonas         Armatimonadetes_norank
                  11⁃24_norank            cvE6_norank           Phenylobacterium       Opitutae_unclassified
                  Methylobacterlum        Sphingopyxis          Rickettsiaceae_unclassified  Sphongosinicella
                  SHA⁃109_norank          Candidatus_Captivus   Rickettsiaceae_uncultured  Subgroup_7_norank
                  Gammaproteobacteria_unclassified  Comamonas   Pseudoxanthomonas      1174⁃901⁃12_norank
                  Bradyrhizobium          TRA3⁃20_norank        Cyanobacteria_norank   Chitinophagaceae_uncultured
                  Proteobacterla_unclassified  Variibacter      Skermanella            Others

                     100


                      80


                     相对丰度  60


                      40


                      20


                       0
                             E1  E2  E3  E4  E5  E6  E7  E8  E9  E10  E11  E12  E13  E14  E15  E16  E17  E18  E19  E20  E21  E22  E23  P1  P2  P3  P4  P5  P6  P7  P8  P9  P10
                                横坐标是样本编码,纵坐标为相关物种在样本中的比例,不同的物种以不同的颜色表示。
                                           图5 E组和P组33个样本菌群在属水平上的分类
                     Figure 5  Dominant bacterial communities at the genus level of the 33 samples from E group and P group

              据对 E 组和 P 组群落门、属分类水平显著性差异进                        les_o_ norank差异有统计学意义(P < 0.05)。
              行检验,运用 Wilcoxon 秩和检验方法分析可以检测                           物种主坐标分析:基于 unweighted Unifrac 距离
              到组间微生物群落中丰富度具有差异性的物种。                             进行物种主坐标分析,PCoA图是根据方差分解将每
              由图6可见E组与P组样本中检出的菌门,差异有统                           个样本群落之间的差异通过二维坐标图反映出来,
              计学意义(P < 0.05)的为蓝藻菌门(Cyanobacteria)、              坐标图中的 1 个点代表 1 个样本信息,两个点之间
              放线菌门(Actinobacteria)、衣原体门(Chlamydiae、             的距离越近,表明两者之间的组成差异越小。第 1
              Aerophobetes)、绿 弯 菌 门(Chloroflexi)、Bacte⁃         主成分对样品差异的解释率为26.73%,第2主成分
              ria_d_norank_k_unclassified、TM6;属水平上,军团菌          对样品差异的解释率为7.59%。从图7可知E 组样
              属 (Legionella) 、Methyloversatilis、Obscuribactera⁃  本(18/23)聚集在一起,P组样本(9/10)聚集在一起,
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