Page 74 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第6期
·852 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年6月
养 Nitrosomonadaceae_uncultured(1.05%)、鞘脂菌属 测出81个菌属,有8.73%(59 514/681 674)的序列不
Sphingobium(1.01%)。以上菌属在33个样本中检出 能被归为任何菌属;P 组共检测出 54 个菌属,有
率为100%。33个样本检测出了4种条件致病菌属: 11.05%(32 739/296 380)的序列不能被归为任何菌
军团菌属、不动杆菌属、肠球菌属、假单胞菌属 属,故只能在更高一级的分类水平中进行分析。
(Pseudomonas)(0.44%),检出率为 100%。E 组共检 组间门、属分类差异性分析:基于群落丰度数
Thermus Aerophobetes_norank Rhodospirillaceae_uncultures Oligoflexales_norank
Sphingomonas Planctomyces Comamonadaceae_unclassified S⁃70_norank
Brevibacillus Subgroup_4_unclassified Vampiroviorionales_norank Oxalobacteraceae_unclassified
Legionella Candidatus_Rhabdochlamydia Nitrospira Enterobacteriaceae_unclassified
Anoxybacillus Geobacitlus Alphaproteobacteria_unclassified AKIW1012_norank
Novosphingobium Phreatobacter Acetobacteraceae_uncultrued Bacillus
Acinetobacter Bradyrhizobizceae_unclassified Neisseriaceae_uncultured Azospirillum
Reyranella Prevotella_7 Lysinibacillus Tepidimonas
Obscuribacterales_uncultured Erythrobacteraceae_unclassified SM2D12_norank Exiguobacterium
Enterococcus Bacteria_unclassified Sh765B⁃TzT⁃29_norank Empedobacter
Methyioversatilis Anaerolineaceae_uncultured NKB5_norank Inquilinus
Holosporaceae_uncuitured Aquicella KCM⁃B⁃60_norank Beggiatoa
Hyphomicrobium Azoarcus OPB56_norank 7B⁃8_norank
Planctomycetaceae_uncultured TM6_NORANK Ectothiorhodospiraceae_norank Delftia
Aquabacterium Dechioromonas Staphylococcus Rickettsiales_unclassified
Nitrosomonadaceae_uncultured Coxiella Pesudorhodoferax Sulfuritalea
Sphingobium Desulfurellaceae_uncultured Mitochondria_norank Caulobacter
Legionellaceae_uncultured Pseudomonas Bryobacter FukuN18_freshwater_group_norank
GR⁃WP33⁃30_norank Coxiellaceae_uncultured Silanimonas Armatimonadetes_norank
11⁃24_norank cvE6_norank Phenylobacterium Opitutae_unclassified
Methylobacterlum Sphingopyxis Rickettsiaceae_unclassified Sphongosinicella
SHA⁃109_norank Candidatus_Captivus Rickettsiaceae_uncultured Subgroup_7_norank
Gammaproteobacteria_unclassified Comamonas Pseudoxanthomonas 1174⁃901⁃12_norank
Bradyrhizobium TRA3⁃20_norank Cyanobacteria_norank Chitinophagaceae_uncultured
Proteobacterla_unclassified Variibacter Skermanella Others
100
80
相对丰度 60
40
20
0
E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14 E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10
横坐标是样本编码,纵坐标为相关物种在样本中的比例,不同的物种以不同的颜色表示。
图5 E组和P组33个样本菌群在属水平上的分类
Figure 5 Dominant bacterial communities at the genus level of the 33 samples from E group and P group
据对 E 组和 P 组群落门、属分类水平显著性差异进 les_o_ norank差异有统计学意义(P < 0.05)。
行检验,运用 Wilcoxon 秩和检验方法分析可以检测 物种主坐标分析:基于 unweighted Unifrac 距离
到组间微生物群落中丰富度具有差异性的物种。 进行物种主坐标分析,PCoA图是根据方差分解将每
由图6可见E组与P组样本中检出的菌门,差异有统 个样本群落之间的差异通过二维坐标图反映出来,
计学意义(P < 0.05)的为蓝藻菌门(Cyanobacteria)、 坐标图中的 1 个点代表 1 个样本信息,两个点之间
放线菌门(Actinobacteria)、衣原体门(Chlamydiae、 的距离越近,表明两者之间的组成差异越小。第 1
Aerophobetes)、绿 弯 菌 门(Chloroflexi)、Bacte⁃ 主成分对样品差异的解释率为26.73%,第2主成分
ria_d_norank_k_unclassified、TM6;属水平上,军团菌 对样品差异的解释率为7.59%。从图7可知E 组样
属 (Legionella) 、Methyloversatilis、Obscuribactera⁃ 本(18/23)聚集在一起,P组样本(9/10)聚集在一起,