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第41卷第7期 马 佩,方 圆,查全斌,等. 长链非编码RNA LINC01197调节胃癌进展的机制研究[J].
2021年7月 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(07):992-998,1014 ·993 ·
胃癌是当前严重威胁人类健康的恶性肿瘤之 显影液(苏州新赛美生物科技有限公司),PAGE凝胶
一。2018 年全球胃癌新发病例 1 810 万,居恶性肿 快速制备试剂盒(上海雅酶生物科技有限公司),Li⁃
瘤第 5 位;新发死亡病例 960 万,居恶性肿瘤第 3 pofectamine 3000(Termo Fisher 公 司 ,美 国 ),
位。东亚地区是全世界胃癌发病率最高的地区,远 LINC01197 干 扰 RNA(shLINC01197)及 阴 性 对 照
远超过第 2 位。而我国作为东亚地区最大的国家, (NC)序列由上海吉玛公司合成。
胃癌防控形势严峻。据《中国肿瘤登记年报 2018》 1.2 方法
报道,2014 年全国胃癌发病率为 19.8/10 万,居恶性 1.2.1 生物信息学分析
肿瘤第 2 位;死亡率为 13.5/10 万,居恶性肿瘤第 3 GEPIA 数据库(Gene Expression Profiling Inter⁃
位。国家癌症中心预测 2020 年我国胃癌发病率将 active Analysis,http://gepia.cancer⁃pku.cn/)是一个研
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高达24.3/10万 。 究人类各种类型肿瘤及正常组织 RNA 测序数据的
近年来,随着分子生物学、消化内镜和医学影 数据库,其整合了 TCGA(The Cancer Genome Atlas)
像、医学病理等技术的发展和健康意识的提升,早 和GTEx(The Genotype⁃Tissue Expression)等数据库,
期胃癌的诊断和治疗有了很大的改善,但是,靶向 可以对肿瘤的基因表达、病理类型、患者生存期等各
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药物、免疫检查点抑制剂等新型药物的临床应用并 方面进行高效、专业的分析 。基于GEPIA数据库,
未明显改善进展期胃癌的总体预后,进展期胃癌的 我们选取408个胃癌组织样本和211个正常胃部组织
诊治仍是一个难点。侵袭和转移是导致晚期胃癌 样本,分析LINC01197在胃癌组织中的表达情况,同
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患者死亡的主要原因 。因此,研究胃癌的发生及 时,按照 Kaplan ⁃ Meier Plotter(KM plotter)数据库
侵袭、转移机制有助于胃癌的早期诊断、靶向治疗 (http ://kmplot.com/analysis/index.php?p=service&ca⁃
及改善预后,从而提高患者生存率。 ncer=gastric)中LINC00197的表达量中位数,将胃癌
长链非编码RNA(long non⁃coding RNA,lncRNA) 患者分为高表达组和低表达组,进行预后研究。
是长度超过 200 bp 的非编码 RNA。近来研究发现 1.2.2 细胞培养
它们能通过调控基因转录、RNA的剪接等方式参与 人胃癌细胞株 SGC⁃7901、BGC⁃823、MGC⁃803、
肿瘤等多种重大疾病进展 [3-7] 。 LINC01197 是被发 AGS及人胃黏膜上皮细胞GES⁃1均购自中国科学院
现的 lncRNA 之一,其位于 15q26.2,长度为 1 445 个 典型培养物保藏委员会细胞库,传代培养于低糖生
碱基。研究发现,LINC01197与胰腺癌进展相关,其 长液RPMI1640中,生长于提供37 ℃和5% CO2环境
低表达提示胰腺癌患者预后差,并且 LINC01197 的 的培养箱。取对数生长的细胞用于后续实验。
低表达可通过 Wnt/β⁃catenin 信号通路调控抑制胰 1.2.3 RNA提取和实时荧光定量PCR(qPCR)
腺癌细胞增殖 [8-9] 。那么,LINC001197 在胃癌等其 用 TRIzol 提取 RNA,使用 Prime Script RT Mas⁃
他消化系统肿瘤中有什么作用?本研究通过生物 ter Mix 反转录试剂盒将 RNA 逆转成 cDNA,并按照
信息学分析发现 LINC01197 在胃癌组织中高表达, qPCR反应体系配制反应溶液,加入荧光定量用384
并通过敲低胃癌细胞中 LINC01197 的表达,进一步 孔板中,ABI 7900HT Real⁃Time PCR System 7900 高
. 探讨 LINC01197 对胃癌细胞增殖、侵袭与转移能力 通量快速实时荧光定量 PCR 仪收纳 384 板进行
的影响,并对可能的分子机制进行初步探究。 PCR。程序包括预变性和循环。收集并处理数据,
结果用2 -ΔΔCt 法计算。qPCR引物见表1。
1 材料和方法
1.2.4 细胞转染
5
5
1.1 材料 取生长活跃的细胞 2×10 ~4×10 个接种至 6 孔
BLAB/c 裸鼠购自北京维通利华。本研究经江 板中,生长 24 h。按照 Lipofectamine 3000 说明书进
苏 大 学 附 属 金 坛 医 院 伦 理 委 员 会 批 准(编 号 行转染,6 h 后换液。干扰片段序列如下:阴性对照
2020001)。RPMI 1640细胞培养基、PBS、胰酶、青链 (NC)5′⁃ GTTCTCCGAACGTGTCACGT ⁃3′,干扰片段
霉素、胎牛血清(Gibco 公司,美国),二甲基亚砜、甲 1(shLINC01197⁃1)5′⁃GGTCGTACTTCTCCATGTTCT⁃
醇、吐温⁃20、氯仿、异丙醇、无水乙醇(Sigma⁃Alrich 3′ ,干 扰 片 段 2(shLINC01197 ⁃ 2)5′ ⁃ GGACATA⁃
公司,美国),Cell Counting Kit 8(CCK⁃8)细胞增殖检 AAGTTCCTGGTTGA⁃3′。
测试剂盒、PMSF、BCA 蛋白定量试剂盒、结晶紫染 1.2.5 细胞增殖实验
5
液、DEPC水(上海Beyotime生物技术有限公司),ECL 取对数生长期细胞1×10 个,制成单细胞悬液,