Page 46 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第8期
·1148 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年8月
A 0 69 91 106 C D
4 1.00 高风险
3 Score 低风险
0.6 Risk Group
0.4 2 Risk High 0.75
Low
系数 0.2 总生存率 0.50
0.0
Survival Time Alive P<0.000 1
-0.2 3 000 Status 0.25
-0.4 2 000
0 5 10 15 1 000 Dead 0.00
L1 Norm 0 1 000 2 000 3 000
0 Risk Group
B High 时间(d)
107 105 103 98 96 91 83 67 49 28 18 14 4 0 E
ACKR1 Low 1.00
CALCR Expression
CCR3
部分似然偏差值 20 IL18RAP 4 2 0 真阳性率 0.75
CD8A
25
HMOX1
IL15RA
IL12A
KLRK1
NOD2
PGF
PLXNC1
0.50
RNASE2
S100A9
15
SLC11A1
SSTR2
SPP1 -2
TNFRSR11B 0.25 1年AUC=0.823
-8 -7 -6 -5 -4 -3 -2 3年AUC=0.811
Log(λ) 0.00 5年AUC=0.824
0.00 0.25 0.50 0.75 1.00
假阳性率
A、B:确定因子的数目;C:预后风险模型分析;D:TCGA队列的K⁃M曲线;E:TCGA队列的tROC曲线。
图8 LASSO分析
Figure 8 LASSO analysis
期中具有显著差异。为了确保结果的可靠性,使用 中更常见。据报道称TP53突变体是在癌细胞表达中
GEO 数 据 GSE76427 进 行 了 验 证 。 对 TCGA 和 最常见的蛋白质突变体 。值得一提的是,CTNNB1
[33]
GEO 数据进行单因素和多因素 Cox 回归分析显示, 在散发性肿瘤不显示突变,而在可遗传的患者所占
SOX12 表达与患者生存预后显著相关。这一结果 比例较高 [34] ,提示某些基因突变与SOX12表达和肿
表明,SOX12 表达可能影响 HCC 的发展,可作为 瘤进展相关。这与本研究结果一致,后期将进一步
HCC 预后不良的独立生物标志物。之前研究结果 通过实验验证以逐步完善 SOX12 表达对 HCC 影响
也证实 SOX12 与多种癌症的不良预后显著相关 [29] , 的证据。
其在肿瘤相关的免疫浸润中起重要作用 [30] ,并且与 根据风险评分系数将 HCC 患者分为高低风险
TNM 分期显著相关 [13] ,本文结果与这些研究报道相 组,Kaplan⁃Meier 分析显示出高风险组比低风险组
一致。基于WGCNA与 LASSO 回归分析选定出18 个 的总生存率较差。tROC 曲线分析表明基于 SOX12
显著影响患者生存预后的 IRG,并获得了相应的风 表达的风险预后模型 1、3、5 年的 AUC 分别为
险评分。 0.823、0.811、0.824,比之前报道的肝癌预后模型表
尽管临床上使用 TNM 分期和分子特征对不同 现更好 [35-36] 。虽然前期研究人员分别构建了 4 基
的肿瘤亚型、阶段和临床预后进行分类,但新出现 因、6 基因肝癌预后模型 [37-38] ,但这两项研究没有定
的证据表明免疫环境可能对于肿瘤类型分类和分期 量评估预后模型的生存预测能力。而本预后模型
[5]
以及预测患者生存率非常有用,甚至更为优越 。先 具有很好的预测能力,有望帮助加强肝癌的预后预
前已有报道,T细胞存在于HCC的免疫细胞浸润中, 测能力。
T细胞的免疫浸润程度与HCC患者的存活率密切有 总之,利用WGCNA 与 LASSO 回归得到的基于
关 [31-32] ,本研究观察到与文献报道相同的现象。此 SOX12 表达的风险预后模型具有很好的预后预测
外本研究还发现 SOX12 高低表达与 CD4 T 细胞和 能力。此外,SOX12高低表达组中静息记忆性CD4 +
+
滤泡辅助性 T 细胞的免疫浸润水平具有显著差异, T 细胞和滤泡辅助性T细胞的免疫浸润水平表现出
提示 SOX12 在免疫微环境中的作用是通过这两类 显著差异,SOX12的高表达不仅会影响HCC患病基
免疫细胞浸润体现的。随后,我们研究了SOX12基 因的突变频率,而且与 HCC 的不良预后显著相关。
因高低表达组和高低风险组的基因突变频率,发现 本研究提示 SOX12 可能成为新型的 HCC 预后生物
TP53、CTNNB1 等基因突变在高 SOX12基因表达组 标志物,为HCC后续免疫治疗和靶向治疗的进一步