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第43卷第11期              王盛锦,王 峰,孙 锋. 循环肿瘤DNA检测在胃肠间质瘤诊疗中的价值[J].
                 2023年11月                    南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(11):1596-1604                      ·1601 ·


                                                     表2 ctDNA检测技术对比
                                           Table 2 Comparisons of ctDNA detection techniques
                     技术          步骤原理                   优点                        缺点                参考文献

                  dRCR           样品分割             绝对定量、高灵敏度                  仪器设备成本高                [65-68]
                                 PCR扩增             高精确性和准确性                 只能检测已知点突变
                                 信号检测            定量结果无需标准曲线               通量相对较低,耗时较长
                                 数据分析             能检测低浓度的突变               需要较多的样本处理步骤
                  ddPCR          样品分割                 独立扩增                      成本较高                [69-70]
                                 PCR扩增              不依赖标准曲线                   通量相对较低
                                 信号检测             高灵敏度和高精确性                   分析时间较长
                                 数据分析             能检测低浓度的突变
                  qPCR           DNA扩增            操作简单、高灵敏度                      成本高                [66,71]
                               荧光信号检测              能检测低浓度突变                  受限于引物设计
                                 Ct值计算             特异度高、速度快                  潜在的污染风险
                                 标准曲线
                  BEAMing        DNA扩增            高灵敏度、高精确性                     成本较高                [65,72]
                               珠子分离包埋             高通量、可定量分析                 需要专业的技术设备
                                 PCR扩增                                     对全基因组分析不适用
                                 突变检测
                  ARMS⁃PCR       引物设计                 快速高效                     引物难设计                [73-74]
                                 PCR扩增             高灵敏度和特异度                  依赖于先验信息
                                 电泳分析            不需要对目标序列测序                无法同时检测多个位点
                  CAPP⁃Seq       样品准备              灵敏度及特异度高                     成本较高                [66,75]
                                 引物设计             高通量、个体化分析                   数据分析复杂
                                 文库捕获           能检测单个核苷酸的变异                  依赖于先验信息
                                 深度测序
                                 数据分析
                  NGS            文库制备              高通量、高灵敏度                   数据处理复杂                [76-77]
                                   测序          已知或未知点突变均可检测                  比对困难、成本高
                                 数据分析          可进行多样性分析,应用广泛                测序存在一定误差率


                取样本,因其微创和可重复性,可能会促进早期发                            变者ctDNA检测的灵敏度显著低于 KIT基因突变患
                现肿瘤。ctDNA 检测具有提供肿瘤动态变化的优                          者 [48] ;对于野生型 GIST,目前尚无研究表明 ctDNA
                势,可实时掌握疾病最新进展,了解其复发转移情                            中 可 检 测 到 K/N⁃RAS、琥 珀 酸 脱 氢 酶(succinate
                况以判断预后。此外,ctDNA 检测可以发现新耐药                         dehydrogenase,SDH)等突变基因      [63] 。虽然迄今为止
                突变,有助于监测治疗反应,并在影像学评估治疗                            ctDNA检测运用于GIST诊疗的相关研究有限,但当
                反应之前即可了解治疗效果以便及时调整治疗决                             前ctDNA 检测作为穿刺活检技术的有效补充手段,
                策从而实现GIST患者的最佳管理,更为临床工作中                          对GIST的临床和生物学认识、基于风险的肿瘤患者
                发现 GIST 新的潜在靶点提供了技术支持。肿瘤特                         分层、个体化治疗、临床结果评估等方面都展现出

                异 ctDNA 作为高度特异的生物标志物应用于 GIST                      巨大的价值和广阔的应用前景。
                患者的基因分型是一种新的诊疗思路。同时ctDNA                         [参考文献]
                检测也面临着一些挑战:ctDNA在外周血含量低,目
                                                                 [1] BLAY J Y,KANG Y K,NISHIDA T,et al. Gastrointesti⁃
                前尚缺乏灵敏检测方法;ctDNA结构稳定性差、半衰
                                                                       nal stromal tumours[J]. Nat Rev Dis Primers,2021,7:22
                期短(16 min~2.5 h)、易被降解,其检出率取决于肿                   [2] YANG Z X,ZHENG R S,ZHANG S W,et al. Incidence,
                瘤的位置、大小和血管分布             [17] ,这也给检测增加了                distribution of histological subtypes and primary sites of
                难度;ctDNA 检测的灵敏度会受到 KIT/PDGFRA 基                        soft tissue sarcoma in China[J]. Cancer Biol Med,2019,
                因突变异质性的影响,有研究指出PDGFRA 基因突                              16(3):565-574
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