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第43卷第11期 王盛锦,王 峰,孙 锋. 循环肿瘤DNA检测在胃肠间质瘤诊疗中的价值[J].
2023年11月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(11):1596-1604 ·1601 ·
表2 ctDNA检测技术对比
Table 2 Comparisons of ctDNA detection techniques
技术 步骤原理 优点 缺点 参考文献
dRCR 样品分割 绝对定量、高灵敏度 仪器设备成本高 [65-68]
PCR扩增 高精确性和准确性 只能检测已知点突变
信号检测 定量结果无需标准曲线 通量相对较低,耗时较长
数据分析 能检测低浓度的突变 需要较多的样本处理步骤
ddPCR 样品分割 独立扩增 成本较高 [69-70]
PCR扩增 不依赖标准曲线 通量相对较低
信号检测 高灵敏度和高精确性 分析时间较长
数据分析 能检测低浓度的突变
qPCR DNA扩增 操作简单、高灵敏度 成本高 [66,71]
荧光信号检测 能检测低浓度突变 受限于引物设计
Ct值计算 特异度高、速度快 潜在的污染风险
标准曲线
BEAMing DNA扩增 高灵敏度、高精确性 成本较高 [65,72]
珠子分离包埋 高通量、可定量分析 需要专业的技术设备
PCR扩增 对全基因组分析不适用
突变检测
ARMS⁃PCR 引物设计 快速高效 引物难设计 [73-74]
PCR扩增 高灵敏度和特异度 依赖于先验信息
电泳分析 不需要对目标序列测序 无法同时检测多个位点
CAPP⁃Seq 样品准备 灵敏度及特异度高 成本较高 [66,75]
引物设计 高通量、个体化分析 数据分析复杂
文库捕获 能检测单个核苷酸的变异 依赖于先验信息
深度测序
数据分析
NGS 文库制备 高通量、高灵敏度 数据处理复杂 [76-77]
测序 已知或未知点突变均可检测 比对困难、成本高
数据分析 可进行多样性分析,应用广泛 测序存在一定误差率
取样本,因其微创和可重复性,可能会促进早期发 变者ctDNA检测的灵敏度显著低于 KIT基因突变患
现肿瘤。ctDNA 检测具有提供肿瘤动态变化的优 者 [48] ;对于野生型 GIST,目前尚无研究表明 ctDNA
势,可实时掌握疾病最新进展,了解其复发转移情 中 可 检 测 到 K/N⁃RAS、琥 珀 酸 脱 氢 酶(succinate
况以判断预后。此外,ctDNA 检测可以发现新耐药 dehydrogenase,SDH)等突变基因 [63] 。虽然迄今为止
突变,有助于监测治疗反应,并在影像学评估治疗 ctDNA检测运用于GIST诊疗的相关研究有限,但当
反应之前即可了解治疗效果以便及时调整治疗决 前ctDNA 检测作为穿刺活检技术的有效补充手段,
策从而实现GIST患者的最佳管理,更为临床工作中 对GIST的临床和生物学认识、基于风险的肿瘤患者
发现 GIST 新的潜在靶点提供了技术支持。肿瘤特 分层、个体化治疗、临床结果评估等方面都展现出
异 ctDNA 作为高度特异的生物标志物应用于 GIST 巨大的价值和广阔的应用前景。
患者的基因分型是一种新的诊疗思路。同时ctDNA [参考文献]
检测也面临着一些挑战:ctDNA在外周血含量低,目
[1] BLAY J Y,KANG Y K,NISHIDA T,et al. Gastrointesti⁃
前尚缺乏灵敏检测方法;ctDNA结构稳定性差、半衰
nal stromal tumours[J]. Nat Rev Dis Primers,2021,7:22
期短(16 min~2.5 h)、易被降解,其检出率取决于肿 [2] YANG Z X,ZHENG R S,ZHANG S W,et al. Incidence,
瘤的位置、大小和血管分布 [17] ,这也给检测增加了 distribution of histological subtypes and primary sites of
难度;ctDNA 检测的灵敏度会受到 KIT/PDGFRA 基 soft tissue sarcoma in China[J]. Cancer Biol Med,2019,
因突变异质性的影响,有研究指出PDGFRA 基因突 16(3):565-574