Page 146 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第11期
·1618 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年11月
精胰岛素(22 U),查糖化血红蛋白为13.3%,糖尿病 显子前后5个碱基处,即7号内含子上第5个碱基由
自身抗体均为阴性,胰岛功能检查结果见表 1, C 突变为 T,该突变发生在内含子,会引起 mRNA 剪
HOMA⁃IR为0.76。 接突变,可能会保留内含子或缺失外显子,导致翻
患者的妹妹因脑梗死住院时确诊为“糖尿病”, 译的多肽链发生改变,是否影响蛋白的剪切需要动
目前口服降糖药物治疗,血糖控制一般。此外患者 物模型实验进行验证,蛋白功能预测软件 SIFT、
的儿子 21 岁,已确诊为“糖尿病”,但尚未正规治 PolyPhen⁃2、REVEL的预测结果均为未知(表2)。另
疗。患者的父亲和伯伯等均在 20 岁左右时发现糖 一 个 突 变 基 因 为 MTNR1B 基 因 ,其 位 于 chr11 ⁃
尿病。该家系成员糖尿病发病早,考虑不排除特殊 92714846,该编码区域的第 457 号核苷酸中的胞嘧
类型糖尿病可能,为此征得患者及家属同意后,对 啶变异为胸腺嘧啶,导致合成的氨基酸发生改变
患者及其家系成员的所有已知单基因遗传病相关 (第 153 号氨基酸由精氨酸变异为色氨酸),为错义
基因(包括全部外显子,已报道的所有内含子、启动 突变,根据ACMG指南,初步判定该突变为临床意义
子位点)进行检测。 未明,蛋白功能预测软件SIFT、PolyPhen⁃2、REVEL的
预测结果分别为有害、有害、良性(表2)。该患者家
系图(图3)及基因突变位点的验证结果如下(表3)。
2 讨 论
糖尿病及其相关并发症是全球疾病死亡的主
要原因之一,2015—2017年我国18岁及以上人群的
[2]
糖尿病患病率为 11.2% 。国际糖尿病联合会估
计,到 2035 年,将有 5.92 亿人患糖尿病。糖尿病的
图1 患者姐姐背部黑棘皮照片
发病机制复杂,其发病与环境、遗传等多种因素相
抽取患者及其家系成员外周血 2 mL,提取 关。不管1型糖尿病还是2型糖尿病(type 2 diabetes
DNA。利用捕获芯片将目标区域的 DNA 片段进行 mellitus,T2DM),均存在明显的遗传异质性。迄今
富集后再借助高通量二代测序平台进行测序,采用 为止,T2DM的致病机制仍不清楚。然而,越来越多
靶向捕获测序。将原始测序数据去除污染和接头 的证据显示 T2DM 的发病机制与遗传变异相关,其
序列,然后利用 BWA 软件将过滤后的序列与 NCBI 中胰岛素的信号转导和分泌途径相关基因之间的
数据库人类基因组参考序列(hg19)比对,利用 相互作用在个体对T2DM的易感性方面发挥重要作
GATK软件分析得出单核苷酸变异(single nucleotide 用。现有的降糖药物均有一定不良反应,因此发现
variation,SNV)和插入缺失突变(insertion deletion 一种可以有效帮助糖尿病管理的新型生物分子至
mutation,INDEL)的相关信息。然后通过ANNOVAR 关重要。
软件对所有的 SNP 和 INDEL 进行注释。利用 PCR 褪黑素是一种负责调节昼夜节律的激素,由哺
和 Sanger 测序验证经过分析筛选得到的变异位 乳动物和人类的松果体产生,分布于各靶器官和组
点 。 利 用 Primer 3.0 在 线 软 件 设 计 PCR 引 物 。 织,研究显示其可通过影响昼夜节律来影响葡萄糖
[3]
PCR 产物经过 Sanger 测序并在 ABI 3130 Genetic 代谢 。褪黑素受体(melatonin receptor,MTNR)分
Analyzer上进行分析。再在家系成员中进行共分离 为MTNR1和MTNR2两个亚型,主要分布于海马、下
验证。最后通过生物信息学蛋白功能预测软件 丘脑、视网膜等部位。MTNR1B基因编码的MTNR1B
SIFT、PolyPhen⁃2、REVEL对突变基因位点的致病性 是褪黑激素受体家族的成员,其可在许多组织中表
进行预测 。 突变基因的筛选标准:在软件筛选基础 达,包括胰岛 ,褪黑素通过MTNR1B和下游的Raf⁃1/
[4]
[1]
上根据有无糖尿病病史,最后挑选出研究的基因。 ERK信号通路对胰岛素基因转录发挥作用 。研究显
[5]
基因检测结果发现患者家系中有两个位点的 示小鼠体内MTNR1缺失时,其糖代谢能力降低,推
基因发生杂合突变,包括INSR基因(IVS7+/⁃5C>T, 测激活 MTNR1 能够促进葡萄糖的代谢能力,从而
[6]
即 c.1610+5G>A)和 MTNR1B 基 因(c.457C>T, 改善胰岛素抵抗,维持机体血糖稳态 。另有研究
p.R153W)(图 2),未发现其他符合临床表型的突变 表明MTNR激动剂提高经棕榈酸处理过的脂肪细胞
基因。INSR 基因位于 chr19⁃7167974,突变位于外 脂联素、脂联素受体1的表达,激活AMPK氧化应激