Page 40 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第2期
               ·182 ·                            南 京    医 科 大 学 学         报                        2023年2月


              VA)检验,多组间比较采用 Dunnett 法。P < 0.05 为                度及诱导时间设计四因素多水平因子条件筛选最
              差异有统计学意义。                                         佳的小鼠 IL⁃3 的诱导表达条件(图 2A)。经 SDS⁃
                                                                PAGE 以及考马斯亮蓝 G250 染色检测,结果显示,
              2  结 果
                                                                在不同的因素和水平下均可观察到约 16 kDa 处的
              2.1  小鼠IL⁃3基因序列优化                                 蛋白诱导条带,与小鼠IL⁃3理论序列的分子量相符
                  应用 OptimumGene 算法分析,小鼠 IL⁃3 原始                合;同时可观察到目的蛋白的表达量随着温度的升
                                   TM
              核苷酸序列的密码子适应指数(codon adaptation in⁃                高(16℃~37℃)表现为上升趋势,而 IPTG 单因素的
              dex,CAI)和GC含量分别为0.35和47.53%。经优化                   变化对目的蛋白表达量的影响程度较小;诱导时间
              后,CAI 值和 GC 含量分别提高到 0.97 和 55.50%,优               从 8 h 增加至 16 h 后,目的蛋白的表达量呈下降趋
              化前与优化后的核苷酸序列如图1所示。                                势(图2B~E)。

              2.2  小鼠IL⁃3蛋白的原核表达和条件优化                                为了进一步分析选定的四因素及各个水平对
                  根据不同的菌密度、IPTG 诱导剂浓度、诱导温                       小鼠 IL⁃3 的表达量影响情况,将每组实验重复 3 次


                          Optimized 001 GACACCCACCGTCTGACCCGTACCCTGAACTGCAGCAGCATCGTTAAGGAAATCATTGGT
                          Original  001 GATACCCACCGTTTAACCAGAACGTTGAATTGCAGCTCTATTGTCAAGGAGATTATAGGG
                                       D  T  H   R  L  T  R  T  L  N  C  S  S  I  V  K  E  I  I  GG
                          Optimized 061 AAACTGCCGGAGCCGGAACTGAAGACCGACGATGAGGGCCCGAGCCTGCGTAACAAGAGC
                          Original  061 AAGCTCCCAGAACCTGAACTCAAAACTGATGATGAAGGACCCTCTCTGAGGAATAAGAGC
                                       K  L  P  E  P  E  L  K  T  D  D  E  G  P  S  L  R  N  K  SS
                          Optimized 121 TTCCGTCGTGTGAACCTGAGCAAATTTGTTGAGAGCCAGGGTGAAGTGGACCCGGAGGAT
                          Original  121 TTTCGGAGAGTAAACCTGTCCAAATTCGTGGAAAGCCAAGGAGAAGTGGATCCTGAGGAC
                                       F  R  R  V  N  L  S  K  F  V  E  S  Q  G  E  V  D  P  E  DD
                          Optimized 181 CGTTACGTTATCAAGAGCAACCTGCAAAAACTGAACTGCTGTCTGCCGACCAGCGCGAAC
                          Original  181 AGATACGTTATCAAGTCCAATCTTCAGAAACTTAACTGTTGCCTGCCTACATCTGCGAAT
                                       R  Y  V  I  K  S  N  L  Q  K  L  N  C  C  L  P  T  S  A  NN
                          Optimized 241 GACAGCGCGCTGCCGGGCGTGTTCATTCGTGATCTGGACGATTTCCGTAAGAAACTGCGT
                          Original  241 GACTCTGCGCTGCCAGGGGTCTTCATTCGAGATCTGGATGACTTTCGGAAGAAACTGAGA
                                       D   S  A  L  P  G  V  F  I  R  D  L  D   D  F  R  K   L  RR
                          Optimized 301 TTTTATATGGTTCACCTGAACGATCTGGAAACCGTGCTGACCAGCCGTCCGCCGCAGCCG
                          Original  301 TTCTACATGGTCCACCTTAACGATCTGGAGACAGTGCTAACCTCTAGACCACCTCAGCCC
                                       F  Y  M  V  H   L  N  D  L  E  T  V  L  T  S  R  P  P  Q  PP
                          Optimized 361 GCGAGCGGTAGCGTTAGCCCGAACCGTGGCACCGTGGAGTGC
                          Original  361 GCATCTGGCTCCGTCTCTCCTAACCGTGGAACCGTGGAATGT
                                       A  S  G  S  V  S  P  N  R  G  T  V  E  CC
                                                 画横线的部分表示经优化后的密码子。
                                   图1 优化前和优化后的小鼠IL⁃3的基因序列及其编码的氨基酸序列
               Figure 1 The gene sequence of mouse IL⁃3 before and after codon optimization and its corresponding amino acid sequence


              后,使用 ImageJ 图像分析软件计算各组 SDS⁃PAGE                   达,破碎后的上清液中无可观测的目的蛋白条带
              结果中目的条带的面积强度。如图 3 所示,当诱导                          (图 4A)。因此,对分离的包涵体变性溶解后,在

                                                                                        2+
              条件设置为诱导前菌液度吸光值为 0.6、使用 IPTG                       8 mol/L咪唑条件下进行Ni 亲和层析纯化。由层析
              终浓度为 1 mmol/L、诱导温度为 37 ℃、诱导时长为                    紫外吸收图谱可见,在50%比例的洗脱缓冲液条件
              8 h 时,小鼠 IL⁃3 在大肠杆菌中具有平均最高的表                      下(咪唑浓度约 250 mmol/L)出现一个明显的洗脱
              达量。                                               峰,进一步收集后经 SDS⁃PAGE 分析确认小鼠 IL⁃3

              2.3  小鼠IL⁃3的表达形式分析和纯化表征                           成功得到了纯化(图4B)。在经过透析复性后,产物
                  进一步的诱导表达和超声破碎产物的 SDS⁃                         通过阴离子交换层析进一步纯化,并在低NaCl浓度
              PAGE 结果显示,位于 16 kDa 处的小鼠 IL⁃3 存在于                 条件下出现洗脱峰。收集主要峰组分进行分析显示
              超声破碎后沉淀物中,几乎全部以包涵体形式表                             最终纯化的小鼠IL⁃3在SDS⁃PAGE中表现为单一蛋
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