Page 9 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第3期 王伟民,赵晨卉,倪思琦,等. ZBTB3表达对胶质母细胞瘤细胞增殖和克隆形成的调控[J].
2023年3月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(3):297-303 ·299 ·
PCR):通过NCBI数据库查找人ZBTB3和GAPDH基 1.2.4 ZBTB3短发卡质粒的构建和靶点的筛选
因 CDS 序列,并使用 Primer Premier 5 软件设计 PCR 由南京科瑞斯生物科技有限公司设计并合成
引物,由通用生物系统有限公司合成。引物序列如 3 个针对 ZBTB3 基因不同靶点的 shRNA 质粒,分别
下:ZBTB3上游5′⁃CCACTGGTGGGGACCTTTTT ⁃3′, 命名为 shZBTB3⁃1、shZBTB3⁃2 和 shZBTB3⁃3,并进
下游5′⁃AGCAGAGCCTTTCCATTCCC ⁃3′;GAPDH 上 行了 DNA 测序鉴定。靶点序列 shZBTB3⁃1:5′⁃
游 5′⁃CAAGGTCATCCATGACAACTTTG⁃3′,下游 5′⁃ GCTTCTGGACTTTATGTATGC ⁃ 3′ ;shZBTB3 ⁃ 2:5′ ⁃
GTCCACCACCCTGTTGCTGTAG ⁃3′。提取细胞总 GGAAACCAACTCACAGCTTCC⁃3′;shZBTB3⁃3:5′⁃
RNA,逆转录为 cDNA,以 cDNA 为模板,用 Prime⁃ GCATCTCAGCAGTTTCATTGG⁃3′。同时构建对照
STAR Max DNA Polymerase 对 cDNA 进行 PCR 扩增 shRNA 质 粒(shCTR)。 将 shCTR、shZBTB3 ⁃ 1、
@
反应,PCR 产物用 1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳 shZBTB3⁃2和shZBTB3⁃3分别转染U87细胞48 h,并
(120 V,30 min),成像观察。使用 Quantity One 软 收集 RNA 和蛋白,行 RT⁃PCR、qPCR 和 Western blot
件对电泳条带进行灰度扫描,同时行半定量分析。 筛选最佳沉默靶点,方法同前。
实时定量PCR(quantitativereal⁃time PCR,qPCR): 1.2.5 Western blot 检测 p38MAPK、AMPK、Akt1 的
通过 NCBI 数据库查找人 ZBTB3 和β⁃actin 基因 CDS 磷酸化水平
序列,并使用 Primer Premier 5 软件设计 PCR 引物, 无血清培养 U87 细胞 12 h,再用 10 μmol/L 的
由通用生物系统有限公司合成。引物序列如下: SB203580、Compound C 和 Perifosine 分别处理细胞,
ZBTB3上游5′⁃TCCTTCGTGGGGTACTATGGA⁃3′,下 收取蛋白样,用Western blot检测p38MAPK、AMPK、
游 5′⁃CCAATTCCCGCTCCTTGTAGAA⁃3′;β⁃actin 上 Akt1的磷酸化水平,方法同前。
游5′⁃CAGCCATGTACGTTGCTATCCAGG⁃3′,下游5′ 1.2.6 CCK⁃8实验检测细胞的增殖水平
⁃AGGTCCAGACGCAGGATGGCATG ⁃3′。每个样本 U87细胞接种于96孔板,同时转染各shRNA质
设置 3 个复孔,反应条件:使用 ABI Step One Plus 实 粒,培养48 h,每孔替换100 μL 10%的CCK⁃8溶液,
时定量 PCR 仪进行扩增反应。①保温阶段:95 ℃ 放置培养箱避光孵育30~50 min,酶标仪测定450 nm
5 min;②循环阶段:95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,共 40 个 处的吸光度值。
循环;③熔解曲线阶段:95 ℃ 15 s,60 ℃ 30 s,95 ℃ 1.2.7 克隆形成实验
15 s。实验数据处理时,以β⁃actin作为内参,计算公 U87细胞接种于35 mm细胞培养皿中(300个/皿),
式为2 -ΔΔCT 。 放置培养箱孵育 2 周,每隔 2 d 换 1 次液。弃上清
Western blot:将细胞裂解物煮沸后离心取上 液,用 PBS 洗 3 次,加甲醇固定 15 min。去除甲醇,
清,用10%预制混胶行SDS⁃PAGE电泳,先用50 V恒 PBS洗3次,加入2 mL结晶紫染液孵育30 min,PBS洗
压浓缩,再用 120 V 恒压电泳分离 2 h,接着用 0.3A 3次,空气干燥。当细胞克隆直径≥0.75 mm时,记为
湿转2 h,待蛋白转印到PVDF 膜上后,再用5%脱脂 阳性。
奶粉室温封闭 2 h,加入抗 ZBTB3 抗体 4 ℃孵育过 1.3 统计学方法
夜,1×TBST洗涤3次,每次30 min,再用HRP标记的 采用 SPSS 19.0 软件进行统计学分析,使用
二抗室温孵育 40 min,洗涤 3 次后行 ECL 化学发光 GraphPad Prism 5.01软件进行绘图。所有实验均独
试剂检测。使用 Quantity One 软件对电泳条带进行 立重复3次,所得定量数据以均数±标准误(x ± sx )进
灰度扫描,同时行半定量分析。 行统计描述。多组间比较采用单因素方差分析,
1.2.3 细胞转染 Bonfferoni 法进行两两比较;两组间差异比较采用 t
取1.5 mL EP管,加入6 μL Lipofectamine 2000和 检验,P < 0.05为差异有统计学意义。
94 μL无血清DMEM,吹打混匀,静置5 min;另取1个
2 结 果
1.5 mL EP管,加入2 μg质粒,再加入无血清DMEM至
100 μL;DMEM 稀释后的 Lipofectamine 2000 加入质 2.1 GBM肿瘤组织和细胞系中ZBTB3的表达情况
粒中,吹打混匀,静置 15 min;弃去细胞培养皿中的 首先通过GEPIA2数据库分析GBM肿瘤组织中
DMEM,用 PBS 清洗,加入 1.8 mL 无血清 DMEM,将 ZBTB3 的表达情况,结果显示,GBM 组织中 ZBTB3
静置后的 Lipofectamine 2000 和质粒混合溶液缓慢 的表达显著高于正常组织(图1A),且与患者的不良
旋转加入细胞培养皿中。 预后呈正相关(图 1B)。接着选用 3 种 GBM 细胞系