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第43卷第3期          王伟民,赵晨卉,倪思琦,等. ZBTB3表达对胶质母细胞瘤细胞增殖和克隆形成的调控[J].
                  2023年3月                     南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(3):297-303                        ·299 ·


                PCR):通过NCBI数据库查找人ZBTB3和GAPDH基                     1.2.4 ZBTB3短发卡质粒的构建和靶点的筛选
                因 CDS 序列,并使用 Primer Premier 5 软件设计 PCR                由南京科瑞斯生物科技有限公司设计并合成
                引物,由通用生物系统有限公司合成。引物序列如                            3 个针对 ZBTB3 基因不同靶点的 shRNA 质粒,分别
                下:ZBTB3上游5′⁃CCACTGGTGGGGACCTTTTT ⁃3′,             命名为 shZBTB3⁃1、shZBTB3⁃2 和 shZBTB3⁃3,并进
                下游5′⁃AGCAGAGCCTTTCCATTCCC ⁃3′;GAPDH 上             行了 DNA 测序鉴定。靶点序列 shZBTB3⁃1:5′⁃
                游 5′⁃CAAGGTCATCCATGACAACTTTG⁃3′,下游 5′⁃            GCTTCTGGACTTTATGTATGC ⁃ 3′ ;shZBTB3 ⁃ 2:5′ ⁃
                GTCCACCACCCTGTTGCTGTAG ⁃3′。提取细胞总                  GGAAACCAACTCACAGCTTCC⁃3′;shZBTB3⁃3:5′⁃

                RNA,逆转录为 cDNA,以 cDNA 为模板,用 Prime⁃                 GCATCTCAGCAGTTTCATTGG⁃3′。同时构建对照
                STAR Max DNA Polymerase 对 cDNA 进行 PCR 扩增          shRNA 质 粒(shCTR)。 将 shCTR、shZBTB3 ⁃ 1、
                     @
                反应,PCR 产物用 1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳                         shZBTB3⁃2和shZBTB3⁃3分别转染U87细胞48 h,并
               (120 V,30 min),成像观察。使用 Quantity One 软              收集 RNA 和蛋白,行 RT⁃PCR、qPCR 和 Western blot
                件对电泳条带进行灰度扫描,同时行半定量分析。                            筛选最佳沉默靶点,方法同前。
                    实时定量PCR(quantitativereal⁃time PCR,qPCR):      1.2.5  Western blot 检测 p38MAPK、AMPK、Akt1 的

                通过 NCBI 数据库查找人 ZBTB3 和β⁃actin 基因 CDS              磷酸化水平
                序列,并使用 Primer Premier 5 软件设计 PCR 引物,                  无血清培养 U87 细胞 12 h,再用 10 μmol/L 的
                由通用生物系统有限公司合成。引物序列如下:                             SB203580、Compound C 和 Perifosine 分别处理细胞,
                ZBTB3上游5′⁃TCCTTCGTGGGGTACTATGGA⁃3′,下              收取蛋白样,用Western blot检测p38MAPK、AMPK、
                游 5′⁃CCAATTCCCGCTCCTTGTAGAA⁃3′;β⁃actin 上          Akt1的磷酸化水平,方法同前。
                游5′⁃CAGCCATGTACGTTGCTATCCAGG⁃3′,下游5′              1.2.6 CCK⁃8实验检测细胞的增殖水平
                ⁃AGGTCCAGACGCAGGATGGCATG ⁃3′。每个样本                     U87细胞接种于96孔板,同时转染各shRNA质
                设置 3 个复孔,反应条件:使用 ABI Step One Plus 实              粒,培养48 h,每孔替换100 μL 10%的CCK⁃8溶液,
                时定量 PCR 仪进行扩增反应。①保温阶段:95 ℃                        放置培养箱避光孵育30~50 min,酶标仪测定450 nm
                5 min;②循环阶段:95 ℃ 10 s,60 ℃ 30 s,共 40 个            处的吸光度值。
                循环;③熔解曲线阶段:95 ℃ 15 s,60 ℃ 30 s,95 ℃               1.2.7 克隆形成实验
                15 s。实验数据处理时,以β⁃actin作为内参,计算公                         U87细胞接种于35 mm细胞培养皿中(300个/皿),
                式为2  -ΔΔCT 。                                      放置培养箱孵育 2 周,每隔 2 d 换 1 次液。弃上清
                    Western blot:将细胞裂解物煮沸后离心取上                    液,用 PBS 洗 3 次,加甲醇固定 15 min。去除甲醇,
                清,用10%预制混胶行SDS⁃PAGE电泳,先用50 V恒                     PBS洗3次,加入2 mL结晶紫染液孵育30 min,PBS洗
                压浓缩,再用 120 V 恒压电泳分离 2 h,接着用 0.3A                  3次,空气干燥。当细胞克隆直径≥0.75 mm时,记为
                湿转2 h,待蛋白转印到PVDF 膜上后,再用5%脱脂                       阳性。
                奶粉室温封闭 2 h,加入抗 ZBTB3 抗体 4 ℃孵育过                    1.3  统计学方法
                夜,1×TBST洗涤3次,每次30 min,再用HRP标记的                        采用 SPSS 19.0 软件进行统计学分析,使用
                二抗室温孵育 40 min,洗涤 3 次后行 ECL 化学发光                   GraphPad Prism 5.01软件进行绘图。所有实验均独
                试剂检测。使用 Quantity One 软件对电泳条带进行                    立重复3次,所得定量数据以均数±标准误(x ± sx )进
                灰度扫描,同时行半定量分析。                                    行统计描述。多组间比较采用单因素方差分析,
                1.2.3 细胞转染                                        Bonfferoni 法进行两两比较;两组间差异比较采用 t
                    取1.5 mL EP管,加入6 μL Lipofectamine 2000和        检验,P < 0.05为差异有统计学意义。
                94 μL无血清DMEM,吹打混匀,静置5 min;另取1个
                                                                  2  结 果
                1.5 mL EP管,加入2 μg质粒,再加入无血清DMEM至
                100 μL;DMEM 稀释后的 Lipofectamine 2000 加入质           2.1  GBM肿瘤组织和细胞系中ZBTB3的表达情况
                粒中,吹打混匀,静置 15 min;弃去细胞培养皿中的                           首先通过GEPIA2数据库分析GBM肿瘤组织中
                DMEM,用 PBS 清洗,加入 1.8 mL 无血清 DMEM,将                ZBTB3 的表达情况,结果显示,GBM 组织中 ZBTB3
                静置后的 Lipofectamine 2000 和质粒混合溶液缓慢                 的表达显著高于正常组织(图1A),且与患者的不良
                旋转加入细胞培养皿中。                                       预后呈正相关(图 1B)。接着选用 3 种 GBM 细胞系
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