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第43卷第4期 高玉杰,龙启福,李积东,等. 基于转录组学研究高原低氧胁迫对小鼠肾脏能量代谢相关通
2023年4月 路的影响机制[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(04):475⁃483 ·481 ·
8 2.5 3 10 3
***
* *** 8 *** ***
mRNA 6 1.5 2 mRNA 6 HPGDS mRNA 2
2.0
PRTN3 相对表达水平 4 2 FCGR4 mRNA 相对表达水平 1.0 APOE mRNA 相对表达水平 1 RRLR 相对表达水平 4 2 相对表达水平 1
0.5
0 0 0 0 0
P H P H P H P H P H
4 1.5 1.5 1.5 1.5
*** mRNA ** mRNA
BAAT mRNA 相对表达水平 2 APOA4 相对表达水平 1.0 *** RXRB mRNA 相对表达水平 1.0 CYCS mRNA 相对表达水平 1.0 *** HSPB1 相对表达水平 1.0 ***
3
0.5
0.5
0.5
0.5
0 1 0 0 0 0
P H P H P H P H P H
1.5 1.5 ** 1.5 * 1.5 1.5
COX5A mRNA 相对表达水平 1.0 ** COX5B mRNA 相对表达水平 1.0 COX7A mRNA 相对表达水平 1.0 ACOX2 mRNA 相对表达水平 1.0 *** mRNA MT⁃ATP8 相对表达水平 1.0 ***
0.5
0.5
0.5
0.5
0.5
0 0 0 0 0
P H P H P H P H P H
P:PKC组,H:HKT组;与PKC组相比,P < 0.05,P < 0.01, P < 0.001(n=5)。
***
*
**
图6 随机挑选15个基因的RT⁃qPCR结果
Figure 6 RT⁃qPCR results of 15 randomly selected genes
4 等 [19] 发现,APOA4 水平与肾功能参数相关,APOA4
RNA⁃Seq
RT⁃qPCR 水平升高伴随血清尿素氮(BUN)和肌酸(Cr)的增加
以及血清蛋白和白蛋白的降低,可作为预测糖尿病
2
患者肾功能损害进展的循环标志物。
log2FC 细胞色素 C(cytochrome C somatic,CYCS)是电
0 子传递链的核心成分,在酶存在的情况下,对组织
的氧化、还原有促进作用。研究表明,CYCS是参与
ATP 合成的线粒体电子传递蛋白的核心元素,故
-2
CYCS 被选为线粒体的代表基因 [20] 。CYCS 的下调
会抑制电子传递和氧化磷酸化(ATP 产生的主要来
MT⁃ATP8
PRTN3 FCGR4 APOE PRLR HPGDS BAAT APOA4 RXRB CYCS HSPB1 COX5A COX5B COX7A ACOX2 源),从而减少线粒体ATP合成并增加ROS的产生,
[21-22]
图中横坐标为基因名称,纵坐标为log2FC。 最终引起炎症反应 。本次 RNA⁃Seq 结果显示
CYCS 基因显著下调,故低氧条件下会使机体 ATP
图7 RT⁃qPCR验证结果
Figure 7 RT⁃qPCR validation reesults 的产生减少,提示高原低氧胁迫会抑制机体线粒体
能量代谢。
帕金森病(Parkinson’s disease,PD)、缺血性中风和 热休克蛋白β⁃1(heat shock protein β⁃1,HSPB1)
其他疾病等神经系统或神经退行性疾病有重要联 为热休克蛋白家族成员,热休克蛋白家族是一组具
系 [17] 。APOA4 基因在甘油三酯和高密度脂蛋白代 有多种生物学功能的蛋白质。研究表明,HSPB1通
谢中起重要作用。有报道称,APOA4 在调节大鼠 过降低细胞内ROS和一氧化氮水平,维持谷胱甘肽
的葡萄糖和脂质代谢中发挥作用,并且可以作为肝 (glutathione,GSH)水平以及稳定线粒体膜电位,在
脏葡萄糖和脂质代谢之间的潜在连接物 [18] 。Cheng 抵抗氧化应激反应中起重要作用 [23-24] 。此外有报道