Page 38 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第5期
               ·620 ·                            南 京    医 科 大 学 学         报                        2023年5月


                        A                                           B
                                                                          hsa_circ_0001479 18 s rRNA
                                                                                               2 000 bp
                                                                                               1 000 bp
                                                                                               750 bp
                                                                                               500 bp
                                                                     151 bp                    250 bp
                                                                      71 bp                    100 bp
                                          hsa_circ_0001479
                                               18 s rRNA


                       C
                         测序结果:









                         反向互补序列:
                         5′⁃ATCTTCGAAAACATACA︳GA︳GCAGCCCGACGGCCATGGAGGCTGAAGAGACGATGGAATGCCTTCAGGAGTT⁃3′
                                      成环点
                 A:荧光定量PCR熔解曲线;B:荧光定量PCR产物琼脂糖凝胶电泳图;C:hsa_circ_0001479 PCR产物测序图,测序结果的反向互补序列与
              Circbase数据库提供的hsa_circ_0001479分子序列一致。
                                    图1 RT⁃qPCR检测hsa_circ_0001479和18 s rRNA的正确度评价
                          Figure 1 Accuracy evaluation for detection of hsa_circ_0001479 and 18 s rRNA via RT⁃qPCR


                               40                                   30
                                              Y=-2.831X+23.65                     Y=-2.918X+6.958
                                                                                   2
                                              2
                               35             r =0.999 4                          r =0.999 2
                                                                    20
                              CT值  30                              CT值
                                                                    10
                               25
                               20                                   0
                                 -5  -4    -3   -2   -1   0          -8     -6    -4    -2     0
                                         稀释系数(log)                            稀释系数(log)
                                 图2 RT⁃qPCR检测hsa_circ_0001479(A)和18 s rRNA(B)的线性范围评价
                      Figure 2 Linear range evaluation for detection of hsa_circ_0001479(A)and 18 s rRNA(B)via RT⁃qPCR


               A                                B                                    C
                                                       4                          11     1.5  Rnase R-
                                                 ZNF131                                       Rnase R+  P<0.001
                                  MRE(microRNA                                          相对表达量  1.0
                                  response elemeot)                 4 11
                                  RBP(RNA binding                      Spliced site      0.5
                                  pcotein)
                                  ORF(open rending
                                  frenc)
                                                                                          0
                                                                                          hsa_circ_0001479 ZNF131
                                D
                                           cDNA gDNA cDNA gDNA         Rnase R- Rnase R+
                                  250 bp                        250 bp
                                  100 bp                        100 bp

                                                                  :Divergent primer  :Convergent primer
                                        hsa_circ_0001479  ZFN131
                 A:CSCD 数据库下载的 hsa_circ_0001479 结构图;B:hsa_circ_0001479 环化位点及其所对应的测序结果;C:Rnase R 实验验证 hsa_circ_
              0001479稳定性;D:琼脂糖凝胶电泳显示hsa_circ_0001479仅可在cDNA中被扩增。
                                            图3 Hsa_circ_0001479的成环性和稳定性验证
                                       Figure 3 Ring structure and stability of hsa_circ_0001479
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