Page 75 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 75
第43卷第7期 时 坚,刘雪昂,朱 岩,等. m1A相关基因构建的胰腺癌预后模型的综合分析[J].
2023年7月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(07):954-965 ·961 ·
NA
A 1.00 ++ + + + +++ B 1.00 +++ +++ NA NA
+
+
+ + 高TMB组 NA + ++ + +++++++ + 高TMB+高风险组 NA
NA
+ ++ ++++++ + 低TMB组 NA ++ + ++ + 高TMB+低风险组
+ + ++ NA NA + 低TMB+高风险组
0.75 ++ + 0.75 ++
NA
+ ++ + + + + ++ + 低TMB+低风险组 NA
+
++ + + NA + + NA
生存率 0.50 +++ + + ++ + + + + ++ + + NA NA 生存率 0.50 + + + + + ++ +++ ++ + + ++ + + NA
+
+
+
+
+ +++
++++ + ++++++ + +++ ++++++ +++ + +
++ +++
+++ ++
0.25 + 0.25 +
P=0.008 + + + +
+ P=0.016
0 0
0 1 2 3 4 5 6 7 8 0 1 2 3 4 5 6 7 8
时间(年) 时间(年)
C D
错义突变 框内缺失 框内插入 错义突变 框移插入 无义突变
框移缺失 无义突变 多次突变 框移缺失 框内缺失 多次突变
框移插入 12 474
87
TMB NA 0 例数 42 TMB NA 0 例数 56
0 0
KRAS 52% KRAS 70%
TP53 52% TP53 60%
SMAD4 12% NA SMAD4 31% NA
CDKN2A 16% CDKN2A 20%
TTN 12% TTN 11%
MUC16 6% MUC16 8%
RNF43 2% RNF43 10%
HECW2 5% HECW2 5%
TNXB 2% TNXB 8%
RYR1 4% RYR1 4%
ARID1A 4% ARID1A 5%
TGFBR2 6% TGFBR2 4%
RIMS2 4% RIMS2 5%
TPO 4% TPO 5%
CACNA1B 1% CACNA1B 6%
LRP1B 2% LRP1B 5%
GNAS 2% GNAS 6%
PCDH15 5% PCDH15 4%
RNF213 1% RNF213 6%
GLI3 1% GLI3 6%
E
** ** * * ** ** ** · l · l 臂级缺失
l l l l
0.75 l l l 二倍体/正常
l l l
l l l l 臂级增益
l l
l l l l
l l l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
浸润水平 0.50 l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l
l
l l l
l l
l
l l
l
l l l
l
l
l
l
l l l l
l l l l l
l l l
l l l
l l l l
l l l
l l
l l l l l
l l ll
l l
l l l
l
l
l
l l
l l l l
0.25 l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l l l l
l
l
l l l
l ll
l l l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l l l
l l l l l l
l l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l
l l
l l l l
l l l
l l l l l l l
l l l l l
l
l l l l l
l l
l l l l l
l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l
l l
l l l
l l ll
l l l ll l l l l l l
l l l
l l l
l l l l l l l l l l l l l
l l l l l l l l
l l l l l l l
l l
l l l l l l l l ll
l
l l l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l l l l l
l l ll
l
l l l l l l l l
l l
ll l l l l l
l l l l l
l l l
l l l l ll
l l l
l l l
l l l l
l l
l l
l l
l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l ll
l l l l l l
l l l l l
l l l l l l l
l l l
l l
l
l l l l l l
l
l l l l
l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l l l l l
l l
l
l l l l l l
l l l
l l l l l l l l l
l l l
l l
l l l l l l
l l
l l l l
l l
l l l l
l l
l lll l l
0 l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l lll l l l ll l l l l lll ll l l l l l l ll
ll l ll l l
l
l l l
l l l l l l
l l l l llll
l
B细胞 CD8 T细胞 CD4 T细胞 巨噬细胞 中性粒细胞 树突状细胞
+
+
F
** · ** · l
l
l 臂级缺失
l l l
0.75 l l l l l l 二倍体/正常
l l l l 臂级增益
l l
l l l l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l 高扩增
浸润水平 0.50 l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l
l
l
l
l l l
l l l
l l l l
l l l l l l
l l
l l l
l l l
l
l l l l l
l l l l l
l l l l l
l l
l l
l l l
l l l
l l l
l
l l l l l
l
l l
l
0.25 l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l
l l l l
l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l
l l l l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l l l l l l l
l
l
l l l ll l
l l
l l l lll
l l l l l l l l
l l
l l l l l
l l l l l l
l l
l l l l
l
l l l l l l l
l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l
l l l
l l l l
l l l l l l l
l
l l l
l l l
l l l l l
l
l l
ll l l l
l l l l l l l
l l l l l l l l l l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l
l
l l l ll
l l l l
l l l
l l l l
l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l l
l
l l l l
l
l l ll
l l l l ll
l
l
l l ll
l l
l
l l l l
l
l
l l
l
l l l l ll l
0 ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l lll l lll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l
l l l l
l l l l
l
l ll
l l l ll lll ll
ll
ll
l l l l lll
B细胞 CD8 T细胞 CD4 T细胞 巨噬细胞 中性粒细胞 树突状细胞
+
+
A:胰腺癌患者 TMB 水平与生存时间的关系(log⁃rank 检验);B:PC⁃m1AScore 联合 TMB 预测胰腺癌预后的效能;C:PC⁃m1AScore低风
险组的基因突变情况;D:PC⁃m1AScore高风险组的基因突变情况;E:CRLS1基因拷贝数状态与免疫子集细胞浸润水平的关系;F:C7orf50基因
拷贝数状态与免疫子集细胞浸润水平的关系;两组比较,P < 0.05,P < 0.01。
*
**
图4 PC⁃m1AScore模型及其权重基因与基因突变和免疫细胞浸润水平的关系
Figure 4 The relation of PC⁃m1AScore model and the levels of gene mutation and immune cell infiltration