Page 75 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 75

第43卷第7期             时  坚,刘雪昂,朱      岩,等. m1A相关基因构建的胰腺癌预后模型的综合分析[J].
                  2023年7月                     南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(07):954-965                       ·961 ·

                                                                  NA
                A         1.00  ++ + + + +++                          B      1.00  +++  +++                      NA  NA
                               +
                                +
                                 +          + 高TMB组              NA              + ++  + +++++++  + 高TMB+高风险组   NA
                                                                                                         NA
                                + ++  ++++++  + 低TMB组   NA                        ++ + ++    + 高TMB+低风险组
                                 + +  ++                NA             NA                    + 低TMB+高风险组
                          0.75   ++ +                                        0.75  ++
                                                                                                                       NA
                                  + ++                                             + + + + ++  + 低TMB+低风险组             NA
                                                                                    +
                                  ++ + +                              NA            + +                              NA
                         生存率  0.50  +++ + + ++ +  +  +  +  ++  +  +  NA NA  生存率  0.50  + + + + + ++ +++ ++ +  +  ++  +  +  NA
                                   +
                                   +
                                                                                         +
                                                                                           +
                                    + +++
                                    ++++ + ++++++                                     + +++  ++++++ +++  +  +
                                       ++                                             +++
                                        +++                                             ++
                          0.25           +                                   0.25        +
                               P=0.008      +  +                                          +     +
                                              +                                  P=0.016
                            0                                                  0
                               0  1  2  3  4  5  6  7  8                         0  1  2  3  4  5  6  7  8
                                       时间(年)                                            时间(年)
                C                                                 D
                          错义突变     框内缺失     框内插入                          错义突变     框移插入    无义突变
                          框移缺失     无义突变     多次突变                          框移缺失     框内缺失    多次突变
                          框移插入                                     12 474
                    87
                    TMB                            NA  0  例数  42    TMB                             NA  0  例数  56
                     0                                                 0
                   KRAS                            52%              KRAS                            70%
                   TP53                            52%               TP53                           60%
                  SMAD4                            12%   NA        SMAD4                            31%   NA
                 CDKN2A                            16%            CDKN2A                            20%
                    TTN                            12%               TTN                            11%
                  MUC16                            6%              MUC16                            8%
                  RNF43                            2%               RNF43                           10%
                 HECW2                             5%              HECW2                            5%
                   TNXB                            2%               TNXB                            8%
                   RYR1                            4%               RYR1                            4%
                 ARID1A                            4%              ARID1A                           5%
                 TGFBR2                            6%              TGFBR2                           4%
                  RIMS2                            4%               RIMS2                           5%
                    TPO                            4%                TPO                            5%
                CACNA1B                            1%            CACNA1B                            6%
                  LRP1B                            2%               LRP1B                           5%
                   GNAS                            2%               GNAS                            6%
                 PCDH15                            5%              PCDH15                           4%
                 RNF213                            1%              RNF213                           6%
                   GLI3                            1%                GLI3                           6%
                        E
                                   ** **    *  *     ** **  **            ·      l  ·   l 臂级缺失
                                     l                                          l l l
                             0.75                                               l  l    l 二倍体/正常
                                                       l                        l  l
                                                      l                         l  l    l  臂级增益
                                                                              l     l
                                                                                 l  l l  l
                                                                                l l l
                                                                              l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l l l  l  l l l
                            浸润水平  0.50  l l l l  l l l l  l    l             l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l
                                                                                l
                                                                                l
                                                                                l l l
                                                                                l l
                                                                                l
                                                                                l l
                                                      l
                                                                                l l l
                                                                                l
                                                                             l
                                                                                l
                                                                                l
                                                                                l l l l
                                                                                l l l l l
                                                                                l l l
                                                                                l l l
                                                                                l l l l
                                                                                l l l
                                                                                l l
                                                                                l l l l l
                                                                                l l ll
                                                                                   l l
                                                                                l l l
                                                                                   l
                                              l
                                     l
                                              l l
                                              l l l l
                             0.25    l l l l l  l l  l l l l l l l l l l l l  l l l  l l  l l l l  l l l  l  l l  l l l l  l
                                              l l l l
                                              l
                                     l
                                              l l l
                                              l ll
                                              l l l
                                     l l  l  l l l  l l l l l l l l l l l l l l l  l l  l l l l l l  l  l  l l  l  l l l  l l
                                              l l l
                                              l l l l l l
                                             l l
                                     l l l l  l  l l l l l l l  l  l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l  l l  l l l l l l l l l  l l l l  l  l  l l  l  l l  l
                                           l
                                             l l
                                              l l l l
                                           l l l
                                                                        l l l l l l l
                                                l l l l l
                                     l
                                                      l l l l l
                                                                       l l
                                             l l l l l
                                  l  l  l l l l l l l  l  l  l  l l  l ll l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l  l l l l l l  l l l l l l l l l l  l l l l l  l l l l l l l l l l l  l l l l  l l l l l ll l  l  l l
                                                l l
                                                    l l l
                                                      l l ll
                                                      l l l ll l l l l l l
                                                                       l l l
                                                                       l l l
                                                                       l l l l l l l l l l l l l
                                                                       l l l l l l l l
                                                                       l l l l l l l
                                     l l
                                                                       l l l l l l l l ll
                                                                          l
                                                      l l l
                                   l l  l l l l l l l l  l l l  l  l l  l l l  l l l l  ll l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l  l l l l l l  l l l l l l  l l l  l l l l l l l  l l l l l l l  l l l l l
                                                      l l l l l
                                                      l l ll
                                     l
                                                                       l l l l l l l l
                                                    l l
                                                                       ll l l l l l
                                                                       l l l l l
                                                                          l l l
                                     l l l l ll
                                     l l l
                                                      l l l
                                                      l l l l
                                  l l
                                     l l
                                                      l l
                                  l l l l l l  l l ll l l l l l l l l l l l l  l l l  l  l l l l l  l  l l  l ll l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l  l l l ll l  l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l  l l l l l l l ll
                                                      l l l l l l
                                                      l l l l l
                                     l l l l l l l
                                   l l l
                                                             l l
                                     l
                                     l l l l l l
                                     l
                                        l l l l
                                   l ll l l l l l  l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l  l l l  ll l l  l l  l l l l  l l l l l  l l l l l l l l l l l l l l l l l ll ll l l l l l l  l l  l  l l l l  l l l l l l l
                                                               l l l l l
                                     l l
                                                         l
                                     l l l l l l
                                     l l l
                                     l l l l l l l l l
                                     l l l
                                     l l
                                                               l l l l l l
                                                               l l
                                     l l l l
                                                               l l
                                                            l l l l
                                                            l l
                                                               l lll l l
                               0     l l l l l l  l l l  l l  l l l l l l l l  ll l lll l l l ll l l  l l lll ll l l l l l l ll
                                                               ll l ll l l
                                                            l
                                                               l l l
                                                               l l l l l l
                                                               l l l l llll
                                     l
                                    B细胞   CD8 T细胞 CD4 T细胞 巨噬细胞 中性粒细胞 树突状细胞
                                             +
                                                      +
                        F
                                     **        ·      **  ·                    l
                                                                               l
                                                                                        l  臂级缺失
                                     l                                         l l
                             0.75                    l                         l l  l  l  l  二倍体/正常
                                                     l                         l l      l 臂级增益
                                                                                l  l
                                                                             l  l l  l
                                                                               l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l ll l l l l l l l l l  l 高扩增
                            浸润水平  0.50  l l l l  l l l l  l    l               l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l  l l
                                                                               l
                                                                             l
                                                     l
                                                                               l
                                                                               l l l
                                                                               l l l
                                                                               l l l l
                                                                               l l l l l l
                                                                               l l
                                                                               l l l
                                                                               l l l
                                                                               l
                                                                               l l l l l
                                                                               l l l l l
                                                                               l l l l l
                                                                                 l l
                                                                               l l
                                                                               l l l
                                                                               l l l
                                                                                 l l l
                                                                                 l
                                                                               l l l l l
                                                                               l
                                                                                 l l
                                                     l
                             0.25   l l l l l l l  l  l l l l l l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l  l l l l  l  l l  l  l l l l  l l l l l  l
                                             l
                                             l l l l
                                               l
                                     l     l  l l l l l l l l l l l l l  l l l l l  l  l l l l l  l  l l  l l  l l
                                             l
                                             l l l l
                                   l  l  l  l  l  l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l  l  l l  l l l l l l l l  l  l  l l l  l  l l l l
                                             l l l l l l l
                                                     l
                                                     l
                                             l l l ll l
                                                              l l
                                             l l l lll
                                             l l l l l l l l
                                             l l
                                             l l l l l
                                                                      l l l l l l
                                                              l l
                                    l l l l
                                    l
                                                                       l l l l l l l
                                  l  l l l l  l l l  l  l l l l l l l ll l l l l l  l l l l l l l l l l l l l l l  l  l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l  ll  l l l l  l l l  l l l l ll l l l l  l l l l l l l l l l
                                                                      l l l
                                                                      l l l l
                                                                       l l l l l l l
                                                                      l
                                                                         l l l
                                                     l l l
                                    l l l l l
                                                                          l
                                                     l l
                                    ll l l l
                                                                      l l l l l l l
                                                                       l l l l l l l l l l
                                    l l l l l l l l  l  l l l l l l l l l  l l l l  l l l l l l l  l  l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l  l  l l l l l l l l l l l l l  l l  l  l l  l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l
                                                                      l
                                                                       l
                                                                         l l l ll
                                                                        l l l l
                                                     l l l
                                      l l l l
                                    l l l l l l ll l l l l  l l l l  l l  l l l  l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l  l l l l l l l  l l l l l  l l l l l l l ll l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l
                                    l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l l l l l ll l  l  l l l  l l  l  l l l l l l l  l l l l l l  l  l l l l l l l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l  l  l l l l l l  l l l l l l  l
                                                              l l
                                      l
                                    l l l l
                                    l
                                    l l ll
                                    l l l l ll
                                    l
                                    l
                                      l l ll
                                                                l l
                                                              l
                                                              l l l l
                                    l
                                                              l
                                                              l l
                                                                l
                                                              l l l l ll l
                               0    ll l l l l l l l  l l l l l l l  l  l l l l l l l l l l l l lll l lll l l l l l l l l l l l l l  l l l l l l l l  l l
                                                                l l l l
                                                              l l l l
                                                              l
                                                                l ll
                                                                l l l ll lll ll
                                                              ll
                                                              ll
                                                              l l l l lll
                                    B细胞   CD8 T细胞 CD4 T细胞 巨噬细胞 中性粒细胞 树突状细胞
                                             +
                                                      +
                   A:胰腺癌患者 TMB 水平与生存时间的关系(log⁃rank 检验);B:PC⁃m1AScore 联合 TMB 预测胰腺癌预后的效能;C:PC⁃m1AScore低风
                险组的基因突变情况;D:PC⁃m1AScore高风险组的基因突变情况;E:CRLS1基因拷贝数状态与免疫子集细胞浸润水平的关系;F:C7orf50基因
                拷贝数状态与免疫子集细胞浸润水平的关系;两组比较,P < 0.05,P < 0.01。
                                                      *
                                                             **
                                 图4 PC⁃m1AScore模型及其权重基因与基因突变和免疫细胞浸润水平的关系
                       Figure 4  The relation of PC⁃m1AScore model and the levels of gene mutation and immune cell infiltration
   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80