Page 76 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第7期
·962 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年7月
A P < 0.001 低风险组
0.4 高风险组
P=0.537
P=0.262 P=0.896
0.3
细胞浸润水平 0.2 P=0.146 P=0.295 P=0.127 P=0.587 P=0.764
P=0.280
P=0.207
P=0.012 P=0.490 P=0.269
0.1 P=0.662 P=0.003 P=0.178 P=0.039
P=0.347 P=0.601
P=0.280
P=0.980
0
巨噬细胞 ( M2 )
CD4 T细胞 ( 幼稚 )
B细胞 ( 幼稚 ) 浆细胞 CD4 T细胞 ( 记忆, 活化 ) 静止的NK细胞 单核细胞 巨噬细胞 ( M1 ) 活化的树突状细胞 嗜酸细胞
静止 )
调节性T细胞 ( Tregs)
巨噬细胞 ( MO )
活化的NK细胞
滤泡辅助性T细胞
γδ T细胞
中性粒细胞
CD8 T细胞
静止的树突状细胞
静止的肥大细胞
B细胞 ( 记忆 )
活化的肥大细胞
CD4 T细胞 ( 记忆,
B
( log2TPM ) 4 2 P=0.030 ( log2TPM ) 4 2 P=0.167 ( log2TPM ) 4 3 2 P=0.121 ( log2TPM ) 4 2 P=0.172 ( log2TPM ) 4 2 P=0.020
LMTK3基因表达量 0 CRLS1基因表达量 TIGIT基因表达量 -2 0 CRLS1基因表达量 CD274基因表达量 -1 1 0 CRLS1基因表达量 CTLA4基因表达量 0 CRLS1基因表达量 PDCD1基因表达量 0 CRLS1基因表达量
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3
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5
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C (log2TPM) (log2TPM) (log2TPM) (log2TPM) (log2TPM)
( log2TPM ) 4 2 P<0.001 ( log2TPM ) 4 2 P=0.001 ( log2TPM ) 0 Expression Level (log2 TPM) 3 3 l l l l l l l l l l l l l l l l l l l C7ORF50 P<0.001 ( log2TPM ) 4 2 P=0.136 ( log2TPM ) 4 3 2 P=0.826
l
l l l
LMTK3基因表达量 -2 0 5 6 7 8 TIGIT基因表达量 -2 0 5 6 7 8 CD274基因表达量 1 1 0 CD274 l Expression Level (log2 TPM) l CTLA4基因表达量 0 5 6 7 8 PDCD1基因表达量 -1 1 0 5 6 7 8
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2 2
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8
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6
C7orf50基因表达量
(log2TPM)
(log2TPM)
(log2TPM)
(log2TPM) C7orf50基因表达量 C7orf50基因表达量 C7orf50基因表达量 C7orf50基因表达量
(log2TPM)
A:22种免疫细胞在PC⁃m1AScore高、低风险组胰腺癌组织中的浸润差异;带下划线为高、低风险组间差异有统计学意义的4种免疫细胞;
B、C:CRLS1(B)、C7orf50(B)表达量与免疫检查点基因表达量的相关性分析。
图5 PC⁃m1AScore高低风险组的免疫细胞浸润差异以及模型基因与免疫检查点基因表达量的相关性
Figure 5 Differences in immune infiltration between high and low risk groups and correlations between model genes and
immune checkpoints
LASSO回归构建胰腺癌预后风险模型,并通过GEO 明,m1A 修饰广泛参与许多疾病的发生和进展,例
数据库和本中心胰腺癌病例的基因表达和临床数 如去甲基化修饰酶 ALKBH3 在许多人类癌症中高
据进行系统验证,找到了能预测胰腺癌患者预后的 度表达,与癌细胞中 tRNA 的 m1A 修饰和蛋白质合
新工具,期待能转化应用于临床,助力于对胰腺癌 成密切相关 [11-12] ,甲基转移酶TRMT6重复序列中的
[2]
患者的个性化监测、治疗和预后改善。 移码突变已在结肠癌中得到证实。Gao 等 提出了
越来越多的证据表明 RNA 化学修饰在基本细 由71个m1A相关基因组成的集群,在该集群基础上
胞过程中具有重要功能,如细胞分化、蛋白质产生、 建立的 m1AScore 算法能预测结肠癌的预后。本研
细胞信号转导和昼夜节律的维持等 。已经证实, 究也通过GO 功能富集分析发现,这71个m1A 相关
[9]
m1A 失调影响多种细胞过程,包括 RNA 结构稳定 基因主要富集在细胞内物质转运和分泌、DNA 复
性、折叠、与蛋白质的相互作用、细胞活力、自我更 制、RNA转录、RNA降解等功能上,这些通路在许多
新能力受损、细胞增殖和细胞死亡 [10] 。最近研究表 生物过程中都至关重要,稍有调控异常便可能导致