Page 89 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 89
第43卷第9期 李 巧,王宇昊,夏一凡,等. 集成机器学习构建透明细胞肾细胞癌免疫影像分型及预测
2023年9月 患者生存的价值[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(9):1265-1272 ·1267 ·
AJCC TNM 分期、细胞核分化程度、ImRad分型、3个 (表2),Rad模型预测OS的C⁃index为0.756(95%CI:
CD8 T浸润评分、TMB、MSI、4种免疫耗竭关键基因 0.636~0.876)。
+
及21种免疫细胞表达。对于维度较多的临床⁃病理⁃ 30 个基于独立预测因子建立 ImRad 预后指数
免疫影像(clinicopathologic⁃immuno⁃radiomics,Clinic (表2,图2A),其预测OS的C⁃index为0.857(95%CI:
⁃Pt⁃ImRad)融合模型,利用 Lasso⁃Cox 回归将不相关 0.787~0.927),优于 Rad 模型。Clinic⁃Pt⁃Im 指标中,
特征的回归系数缩小到零,得到系数不为零的特 AJCC 分期、TMB、初始B细胞等11个指标是患者OS
征。使用最大相关最小冗余法(mRMRe)基于有无 的独立预测因子,Clinic⁃Pt⁃Im模型预测OS的C⁃index
肿瘤复发对851个组学特征进行降维,获取30个关 为 0.924(95%CI:0.872~0.976),优于 Rad 和 ImRad
键特征构建影像组学(radiomics,Rad)预后模型。 (表2,图2B)。
进一步多因素 Cox 回归分析,最终构建如下预 融合模型Clinic⁃Pt⁃ImRad 预测OS的C⁃index 为
后模型:①Rad 及 ImRad 模型;②临床⁃病理⁃免疫 0.938(95% CI:0.902~0.974),优 于 Rad、ImRad 和
(clinicopathologic immune,Clinic ⁃ Pt ⁃ Im)模 型 ;③ Clinic⁃Pt⁃Im模型(表3,图2C)。
Clinic⁃Pt⁃ImRad模型。 各独立预测因子的生存分析中,Rad⁃静息态树
1.3 统计学方法 突状细胞、Rad⁃激活态肥大细胞及Rad⁃M1巨噬细胞
采用受试者工作特征(receiver operating charac⁃ 3个免疫影像特征的Kaplan⁃Meier曲线在高、低表达
teristic,ROC)曲线和 ROC 曲线下面积(area under 组间存在显著差异(P < 0.05)。AJCC分期越早预后
curve,AUC)评价分类器效能。多因素Cox回归分析 越好;激活态肥大细胞及 MSI 高表达均提示预后不
计算各模型中预测因子高、低表达组间OS的风险比 佳,而静息态树突状细胞高浸润提示预后良好,其
(hazards ratio,HR)及其 95%可信区间(confidence 高、低表达组间生存曲线均存在显著差异(P < 0.05,
interval,CI)。C⁃index 评价模型预测效能。采用 图3)。
Kaplan⁃Meier 生存曲线分析独立预测因子的生存影
3 讨 论
响并进行 Log⁃Rank 检验。采用 SPSS 26、R3.6.1 和
MeCalc19.9.4 软件进行统计学分析。双尾 P < 0.05 ccRCC 多位于肾皮质,单发多见,通常大小不
为差异有统计学意义。 一,圆形或椭圆形,和周围肾实质分界较清晰,可有
假包膜,常有钙化、出血、坏死及囊变。显微镜下肿
2 结 果
瘤细胞体积较大,圆形或多边形,胞质丰富,透明或
2.1 ImRad免疫影像表型构建 颗粒状,间质具有丰富的毛细血管和血窦。CT平扫
在 两 步 骤 算 法 的 32 种 组 合 中(4 种 特 征 筛 表现主要取决于肿瘤本身的成分和血供的差异,以
选×8 种 ML 分类器算法),NB 算法较其他分类器建 及肿瘤内有无出血、坏死、囊变、钙化等。通常CT平
模有更好的分类效能(AUC:0.717~0.956,表1)。基 扫时密度与周围肾实质呈等或略低密度,体积较小
于 NB 算法构建的 ImRad 表型能够有效监测肿瘤组 的肿瘤密度多均匀,而体积较大者密度多不均匀,
织记忆 B 细胞(AUC=0.954)、静息态记忆 CD4 T 细 与瘤体内容易出血有关。绝大多数 ccRCC 为富血
+
胞(AUC=0.942)、激 活 态 自 然 杀 伤 细 胞(AUC= 供肿瘤,增强扫描动脉期多明显不均匀或条纹状强
0.931)、嗜酸性粒细胞(AUC=0.956)和调节性T细胞 化,强化程度多与邻近肾皮质相仿,甚至略高,静脉
(AUC=0.908)浸润(P < 0.05)。 期及延迟期强化程度较周围肾实质减低,多呈“快
2.2 多模组学融合预测OS效能 进快出”的特点。病理研究显示其早期高强化与透
分别对比分析 Rad、ImRad、Clinic⁃Pt⁃Im、Clinic⁃ 明细胞的小泡状结构密切相关。本研究基于 CT 增
Pt⁃ImRad对OS的预测效能。 强图像及集成 ML 构建 ccRCC 的免疫影像表型,并
采 用 梯 度 提 升 树 算 法(gradient boosting ma⁃ 探讨其对患者预后的预测价值。
chine,GBM⁃Cox)对 Rad 预测因子建模,获取 1 年、 目前基于全肿瘤影像组学特征分析主要用于
3 年、5 年 OS 的校准曲线图(图 1)。30 个经 mRMRe 肿瘤细胞异质性研究 [12] ,而本研究通过集成 ML 及
降维后的关键Rad特征中,wavelet⁃LLL_glcm_Imc1、 全肿瘤 ROI 影像组学特征分析,构建 ccRCC 的多重
wavelet ⁃ LHL_ngtdm_Strength、wavelet_HHH_glrlm_ 免疫影像分型,在技术方法及临床应用方面具有一
Long Run Low Gray Level Emphasis为独立预测因子 定探索性。本研究通过影像⁃免疫关联,构建了30个