Page 10 - 南京医科大学自然版
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第44卷第5期
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              苷(IPTG)加入到细菌溶液中,并在 22 ℃下诱导表                            检测 TBK1 的酶活性是否影响与 NLRC4 的相
              达 12 h。 4 ℃ 3 000 r/min 离 心 20 min 后 收集菌          互作用:将 pcDNA3.1⁃Flag⁃TBK1、pcDNA3.1⁃Flag⁃
              体。超声波裂解后,按照 HIS 标签蛋白纯化试剂盒                         TBK1Ser172A、pcDNA3.1⁃Flag⁃TBK1Ser172D、pcD⁃
              的说明获得纯化的FLIC蛋白。                                   NA3.3⁃Myc⁃NLRC4在 HEK293T中过表达16 h,Co⁃IP
              1.2.7 毒力蛋白激活NLRC4炎症小体                             方法同上,后续加入一抗Anti⁃Flag、Anti⁃Myc及相应
                  在室温下,将 PolyJet Reagent 转染试剂(3 μL)             二抗进行Western blot检测。
                                     TM
              与含有 5 μg/mL 的 FLIC 蛋白溶液(20 μL)混合于                      检测NLRC4 Ser533位点的磷酸化水平是否影响
              100 μL DMEM中并静置15 min,随后滴加到IBMDM                  与TBK1的作用:将pcDNA3.1⁃Flag⁃TBK1、pcDNA3.3⁃
              细胞中,37 ℃继续培养 24 h。收集细胞培养上清,                       Myc ⁃ NLRC4、pcDNA3.3 ⁃ Myc ⁃ NLRC4 Ser533A、
              使用 Loading buffer 裂解细胞,收集细胞裂解液,进                  pcDNA3.3⁃Myc⁃NLRC4 Ser533D在 HEK293T中过表
              行Western blot检测,方法同1.2.5。                         达 16 h,Co⁃IP 方法同上,后续加入一抗 Anti⁃Flag、

              1.2.8  重组 GST⁃TBK1 及 HIS⁃NLRC4 蛋白的制备、             Anti⁃Myc及相应二抗进行Western blot检测。
              纯化及GST pull⁃down                                  1.2.10 免疫沉淀(immunoprecipitation,IP)实验
                  将含有 TBK1 和 NLRC4 的重组质粒 pgex6p1⁃                    为了检测TBK1是否磷酸化NLRC4,将pcDNA3.1⁃
              GST⁃TBK1、pet28a⁃HIS⁃NLRC4 转化到大肠杆菌                 Flag⁃TBK1、pcDNA3.3⁃Myc⁃NLRC4、pcDNA3.3⁃Myc⁃
              BL21中。使用0.1 mmol/L IPTG在20 ℃下诱导重组                 NLRC4 Ser533A在 HEK293T中过表达16 h后,用含

              蛋白GST⁃TBK1表达12 h;0.5 mmol/L IPTG诱导HIS⁃            有 1%蛋白酶抑制剂 PMSF 的 RIPA 缓冲液裂解细
              NLRC4 表达14 h。按照GST标记蛋白质纯化试剂盒                      胞,4 ℃ 12 000 r/min 离心 10 min,收集上 清。加入
              或 HIS 标记蛋白质纯化试剂盒提供的说明进行纯                          Anti⁃Myc抗体,4 ℃过夜,加 入蛋白 A/G 磁珠混合 1 h,
              化。将纯化的蛋白质混合在同一离心管中,孵育过夜                           然后用 1×PBST(含有 1% TritonX⁃100)洗涤磁珠3次,
              后,加入镍柱或谷胱甘肽磁珠混合2 h,再用1×PBST                       将 IP 样品用 2×Loading buffer 重悬,并 95 ℃煮沸
             (含有1% TritonX⁃100)洗涤磁珠3次以去除抗原非特                    5 min,后续加入Anti⁃p⁃Ser、Anti⁃p⁃NLRC4、Anti⁃Myc、
              异性结合,样品用2×Loading buffer重悬,并在95 ℃下                Anti⁃Flag及相应二抗进行Western blot。
              煮沸5 min,进行Western blot检测,方法同1.2.5。                1.2.11 细胞免疫荧光
              1.2.9  免疫共沉淀(co⁃immunoprecipitation,Co⁃IP)             S.T(MOI:10)刺激后的 IBMDM,用 1×PBS 洗涤
              实验                                                3 次,4%多聚甲醛室温固定 15 min,在 0.02% NP⁃40
                  检测TBK1是否与NLRC4相互作用:将pcDNA3.1⁃                 中通透 10 min,使用快速封闭液封闭 15 min,并用
              Flag⁃NLRC4、pcDNA3.3⁃ Myc⁃TBK1 在 HEK293T 中         Anti⁃ASC 抗体(1∶100)孵育过夜。荧光标记的二抗
              过表达 16 h。然后用含有 1%蛋白酶抑制剂 PMSF                     (FITC 标记的山羊抗鼠 IgG)室温避光孵育细胞
              的 RIPA 裂解液裂解细胞,4 ℃下以 12 000 r/min 离               60 min,DAPI复染,通过荧光显微镜观察。同法处
              心10 min,收集上 清。加入Anti⁃Myc或Anti⁃Flag 抗              理过表达 TBK1 及 NLRC4 的 HEK293T 细胞,加入
              体,4 ℃下过夜,加 入蛋白 A/G 磁珠混合 1 h,然后                    Anti⁃Flag、Anti⁃Myc抗体(1∶100)及相应二抗孵育后,
              用 1×PBST(含有 1% TritonX⁃100)洗涤磁珠 3 次,将             荧光显微镜观察。
              Co⁃IP 样品用 2×Loading buffer 重悬,并 95 ℃煮沸            1.2.12 ASC寡聚化实验
              5 min。后续加入一抗Anti⁃Flag、Anti⁃Myc 及相应二                    将 IBMDM 铺于细胞孔板中,待其密度达到
              抗进行Western blot检测。                                50%,使用S.T菌株(MOI:10)刺激细胞2 h,4 ℃ 裂解

                  检测TBK1与NLRC4的结合区域:将pcDNA3.1⁃                  细胞30 min。收集细胞悬液,离心取上清备用。 剩
              Flag⁃TBK1、pcDNA3.3⁃Myc⁃NLRC4、pcDNA3.3⁃Myc⁃        余细胞沉淀加入 1×PBS 重悬,加入 DSS 交联剂充分
              NLRC4⁃ΔCARD、pcDNA3.3⁃Myc⁃NLRC4⁃NACHT、             混匀,室温静置后离心,弃上清,加入 Loading buffer
              pcDNA3.3⁃Myc⁃NLRC4⁃LRR;pcDNA3.3⁃ Myc⁃TBK1、        煮样。所有样品进行 Western blot 检测,加入一

              pcDNA3.3⁃Myc⁃TBK1⁃N 端、pcDNA3.3⁃Myc⁃TBK1⁃C         抗 Anti⁃ASC 及相应二抗孵育。通过化学发光试剂
              端、pcDNA3.1⁃Flag⁃NLRC4 在 HEK293T 中过表达              和化学发光成像系统获得图像。

              16 h,Co⁃IP方法同上,后续加入一抗Anti⁃Flag、Anti⁃              1.2.13 S.T感染小鼠模型构建及相关炎症指标检测
              Myc、Anti⁃TBK1及相应二抗进行Western blot检测。                    将野生型(wild type,WT)C57BL/6 小鼠分为
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