Page 28 - 南京医科大学自然版
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第44卷第6期
·764 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2024年6月
1.2.6 Transwell实验 相比,在 PTC 组织(图 1B)和 PTC 细胞株(图 1C)中,
每孔2×10 个细胞铺于6孔板中,贴壁后分别转 UBE2T蛋白表达水平均显著升高(P < 0.01)。
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染质粒。48 h后收集对数生长期细胞,使用细胞计数 2.2 UBE2T 表达水平升高与 PTC 预后不良及淋巴
板计数后,无血清培养基重悬细胞,调整细胞浓度为 结转移相关
1×10 个/mL,混匀。下室加入500 μL 全培养基,上室 利用 TCGA⁃THCA 数据库,对 UBE2T 表达与患
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加入200 μL细胞悬液(侵袭实验需在Transwell 上方 者临床病理特征进行深入分析。结果表明,UBE2T
小室中加基质胶),放入37 ℃细胞培养箱,TPC⁃1细胞 高表达与患者 DFI 缩短显著相关,高表达组的 DFI
培养24 h、KTC⁃1 细胞培养 18 h。取出小室,PBS 清 明显更短[图 1D,HR=3.43,95%CI:1.43~8.21,P <
洗 2 遍,4%多聚甲醛固定 15 min,0.1% 结晶紫染色 0.05]。 此 外 ,还 观 察 到 淋 巴 结 转 移 组(N1)的
20 min,去除未与细胞结合的结晶紫及小室上侧未迁 UBE2T表达水平比淋巴结无转移组(N0)更高,差异
移的细胞,然后在显微镜下观察计数。 有统计学意义(图1E,P < 0.01)。
1.2.7 划痕实验 2.3 敲减UBE2T抑制PTC细胞增殖、迁移、侵袭
在 6 孔板的底部平均划 3 条横线,随后按照 2× 采用2种PTC细胞TPC⁃1和KTC⁃1,转染质粒进
10 个/孔细胞铺于 6 孔板中,贴壁后分别转染质粒。 行UBE2T敲减,Western blot验证敲减效果,结果显示
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48 h 后用 20 μL 的枪头在 6 孔板中划 2 条竖线。用 与对照组相比,UBE2T的表达显著降低,差异均有统
PBS 洗去漂浮的细胞,观察 12~48 h,记录划痕愈合 计学意义(图2A)。
情况。 利用CCK⁃8法检测UBE2T敲减后对细胞增殖的
1.2.8 生物信息学分析 影响,结果表明,敲减 UBE2T 能显著抑制 TPC⁃1 和
从 UCSC 癌 症 浏 览 器(https://xenabrowser.net/ KTC⁃1的增殖活力(图2B,P < 0.001)。同时,验证了
datapages/)获取 TCGA⁃THCA 数据集的基因表达数 敲减 UBE2T 能显著抑制 PTC 细胞的集落形成能力
据。使用 R 软件(版本 4.2.1)进行配对样本 t 检验。 (图2C,P < 0.01)。
通过 R 软件包 survival 中的 survfit 函数分析两组无 划痕实验进一步探究 UBE2T 对 PTC 细胞迁移
疾病间隔(disease⁃free interval,DFI)的差异,并使用 和侵袭的影响。结果显示,UBE2T敲减后划痕愈合
Logrank 检验评估不同组样本之间 DFI 差异的显著 速度较为缓慢,提示UBE2T敲减可抑制PTC细胞的
性。使用非配对的Student’s t检验进行淋巴结无转 迁移(P < 0.001,图 3A;P < 0.01,图 3B)。Transwell
移(N0)与淋巴结转移(N1)组间的差异显著性分 实验验证,发现UBE2T敲减后,TPC⁃1和 KTC⁃1细胞
析。使用基因集富集分析(gene set enrichment anal⁃ 的迁移和侵袭数目明显减少(图 3C、D,P < 0.01),进
ysis,GSEA)软件(3.0 版本,http://software.broadinsti⁃ 一步说明 UBE2T 敲减可以抑制 PTC 细胞的迁移和
tute.org/gsea/index.jsp)按照 UBE2T 的表达水平高低 侵袭。
排序,前 50%为高表达组,后 50%为低表达组,以评 2.4 UBE2T参与JAK⁃STAT信号通路
估相关途径和分子机制。 为了进一步探究 UBE2T 促进 PTC 细胞增殖迁
1.3 统计学方法 移侵袭的机制,根据 TCGA⁃THCA 样本中 UBE2T 的
实验数据通过Graphpad Prism 9.0 统计软件进行 表达水平将样本分为 UBE2T 高表达组和 UBE2T 低
分析并制图。两组间的比较使用 Student’s t 检验, 表达组,并进行了 GSEA,结果显示 UBE2T 参与了
ANOVA单因素方差分析用于多组间的比较。每组 JAK⁃STAT 信号通路(图 4A)。接着,在 TPC⁃1 和
实验均重复3次,P < 0.05为差异有统计学意义。 KTC⁃1 细胞中敲减 UBE2T 后,检测了STAT3的磷酸
化水平。Western blot 结果显示,相比对照组,敲减
2 结 果
UBE2T 后 STAT3 磷酸化水平显著下调(图 4B,P <
2.1 UBE2T在PTC组织和细胞系中表达水平升高 0.001),提示 UBE2T 可能通过调控 JAK⁃STAT 信号
在对TCGA数据库中PTC组织及其相应癌旁正 通路促进PTC细胞的增殖、迁移和侵袭。
常组织的 RNAseq 数据进行差异分析,生物信息学 2.5 UBE2T通过激活JAK⁃STAT信号通路促进PTC
分析结果表明相比癌旁正常组织,PTC中UBE2T的 细胞增殖
表达量显著升高(图 1A,P < 0.001)。通过 Western 进 一 步 使 用 STAT3 激 活 剂 Colivelin 来 探 究
blot 检测发现,与癌旁正常组织及甲状腺正常细胞 STAT3 在 UBE2T 介导的 PTC 细胞功能变化中的关