Page 36 - 南京医科大学学报自然科学版

第42卷第10期
·1378 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2022年10月

21个表达下调的miRNA），并绘制差异表达的mRNA 多因素Cox回归分析筛选出3个与预后更密切的miR⁃
和miRNA的火山图和热图（上调和下调最显著的前 NA：miR⁃21⁃5p、miR⁃885⁃5p、miR⁃1251⁃5p，根据多因
20个基因，mRNA见图1A、B；miRNA见图1C、D）。 素回归分析结果构建风险预后模型。风险评分=EXP⁃
2.2 预后模型的构建 miRNAa×Coeffcient1+miRNAb×Coeffcient2+……+miR⁃
初步对 Train 组进行单因素 Cox 回归分析得到 NAn×Coeffcientn。EXPmiRNAa表示对应miRNA的表
4 个生存相关的miRNA，然后将初筛变量进一步纳入 达量，Coeffcient1表示对应miRNA的回归系数（表1）。

A 400 B 200

300 150
-lgFDR 200 -lgFDR 100

100 50

0 0
-15 -10 -5 0 5 10 15 -10 -5 0 5 10
C log2FC D log2FC
Type 20 Type Type Type
SLC18A318A3 C has⁃miR⁃4784 C
SLC
GSG
GSG1L21L2 has⁃miR⁃599 15
PAEP 15 T has⁃miR⁃875⁃5p T
PAEP
SCARNA55 has⁃miR⁃508⁃5p
SCARNA
TBX55 has⁃miR⁃184
TBX
MUC
MUC1717 has⁃miR⁃514b⁃5p 10
AC079310.1079310.1 10 has⁃miR⁃514a⁃5p
AC
AC
AC073336.1073336.1 has⁃miR⁃506⁃3p
UNCX has⁃miR⁃509⁃3⁃5p
UNCX
AC 5 has⁃miR⁃200c⁃5p 5
AC090709.1090709.1
SEMG22
SEMG has⁃miR⁃129⁃2⁃3p
LINC0243702437
LINC has⁃miR⁃216b⁃5p
AC has⁃miR⁃892c⁃3p
AC112243.1112243.1
TMEM 0 has⁃miR⁃892b 0
TMEM207207
LINC0212102121 has⁃miR⁃888⁃5p
LINC
AC
AC008060.4008060.4 has⁃miR⁃892a
RNU
RNU5B⁃15B⁃1 has⁃miR⁃891b
APOA44
APOA -5 has⁃miR⁃891a⁃5p -5
CFHR55
CFHR has⁃miR⁃138⁃5p
AC has⁃miR⁃129⁃5p
AC113410.2113410.2
RNY
RNY33 has⁃miR⁃203b⁃3p
RTL
RTL11 has⁃miR⁃1269b
S
S100G100G has⁃miR⁃374c⁃5p
BIRC77
BIRC has⁃miR⁃155⁃3p
HP has⁃miR⁃4652⁃5p
HP
MYEOV has⁃miR⁃210⁃5p
MYEOV
TTC
TTC21B⁃AS121B⁃AS1 has⁃miR⁃155⁃5p
AL
AL590644.1590644.1 has⁃miR⁃200c⁃3p
OSTM
OSTM1⁃AS11⁃AS1 has⁃miR⁃532⁃3p
SLC12A112A1
SLC has⁃miR⁃141⁃3p
CALB11
CALB has⁃miR⁃362⁃5p
AQP22
AQP has⁃miR⁃509⁃3p
UMOD has⁃miR⁃514a⁃3p
UMOD
NPHS
NPHS22 has⁃miR⁃508⁃3p
ATP has⁃miR⁃1251⁃5p
ATP12A12A
ELF has⁃miR⁃210⁃5p
ELF55
TMEM
TMEM238L238L has⁃miR⁃122⁃5p
MUC1515 has⁃miR⁃885⁃5p
MUC
PRR has⁃miR⁃224⁃5p
PRR3535
GP
GP22 has⁃miR⁃592
A：差异表达的mRNA火山图；B：差异表达的miRNA火山图；C：上调及下调的前20个mRNA的热图；D：上调及下调的前20个miRNA的热
图。热图横坐标蓝色代表样正常组样本，红色代表肿瘤组样本；纵坐标代表基因；红色代表与整体样本表达水平相比该基因在对应样本中高表达，
绿色代表与整体样本表达水平相比该基因在对应样本中低表达，黑色代表该基因在对应样本的表达水平与该基因在整体样本的表达水平一致。
图1 差异表达的mRNA和miRNA火山图和热图
Figure 1 Volcano map and heat map of differentially expressed mRNA and miRNA
表1 Cox多变量回归分析差异表达的miRNA对ccRCC患者生存率的影响
Table1 CoxmultivariateregressionanalysisoftheeffectsofdifferentiallyexpressedmiRNAsonsurvivalinpatientswith ccRCC
名称 回归系数 风险比 95%置信区间 P值
hsa⁃miR⁃21⁃5p 0.485 1.624 1.158~2.276 0.005
hsa⁃miR⁃885⁃5p -0.104 0.901 0.802~1.012 0.079
hsa⁃miR⁃1251⁃5p -0.111 0.895 0.787~1.016 0.087