Page 30 - 南京医科大学自然版
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第44卷第12期
               ·1644 ·                           南 京    医 科 大 学 学         报                        2024年12月


              细胞,进行敲降慢病毒的感染,取对数生长期的                             发挥作用。
              KYSE410细胞,进行过表达慢病毒感染,并通过RT⁃                       2.4  LINC01424体内功能研究
              PCR 确 定 各 组 LINC01424 的 表 达 情 况(图 3B)。                 为了进一步验证 LINC01424 在 ESCC 的作用,
              CCK⁃8、平板克隆、Transwell 实验结果表明,敲降                    利用裸鼠移植瘤模型评价LINC01424对在体肿瘤生
              LINC01424 能够显著降低 ESCC 细胞增殖、侵袭能                    长的影响,结果表明敲降 LINC01424 明显抑制肿瘤
              力;而过表达 LINC01424 后,其增殖、侵袭能力显著                     的 在 体 生 长( 图 4A~C)。 RT ⁃ PCR 检 测 发 现
              增 强( 图 3C~E)。 以 上 细 胞 实 验 结 果 提 示 ,               LINC01424敲降组中瘤体LINC01424 的表达明显降
              LINC01424能够作为致癌基因在ESCC增殖、侵袭中                      低(图4D),Ki⁃67 蛋白表达显著下调(图4E)。


              A                **            B                               C
                  8             ***                6             ***
                 level  6         ***              4                             4 3  ● ■ ▲  NC  ECA109
                                                                                     KD
                 Relative LINC01424  4 2  **      Relative expression of LINC01424  2  ***  Relative cell vitality  2  ▼ OE  KYSE410  ▼  ▲ ▼ ●  ***
                                                                                     NC

                                                                                                           ***

                  0                                0                             1          ▼ ● ▲ ■  ● ▲ ■  ■
                          KYSE150
                               KYSE410
                  KYSE30 KYSE70 ECA109  KYSE180  TE⁃1 TE⁃10 HEEC  NC  KD  NC  OE  0   ▼ ● ▲
                                                                                      ■
                                                               KYSE410
                                                       ECA109109
                                                       ECA
                                                                                            2
                                                                                      1
                                                                                             Time(d) 3   4
              D        NC          KD
                                                              ECA109                          KYSE410
                                                 250            ***               250
                 ECA109                          200                              200            ***
                                                Number of colonies  150          Number of colonies  150
                       NC          OE            100                              100
                 KYSE410                          50                               50

                                                   0
                                                          NC          KD            0      NC          OE


              E         NC          KD                        ECA109               2.5         KYSE410
                                                  1.5
                 ECA109                           1.0           ***                2.0           ***

                                                                                   1.5

                        NC          OE           Invasion fold change  0.5       Invasion fold change  1.0
                 KYSE410                                                           0.5


                                                   0                                0
                                                          NC          KD                   NC          OE
                 A:Expression of LINC01424 in HEEC and ESCC cell lines. B:qRT⁃PCR assay to verify the expression of LINC01424. C,D:CCK⁃8 assays(C)
              and colony formation assays(D)were performed to determine the cell viability of ESCC cells(×200). E:Invasion assays were used to detect the invasion
                                                                       **
                                                                              ***
              abilities of ESCC cells(×200). NC:negative control;KD:knockdown;OE:overexpressin. P < 0.01, P < 0.001(n=3).
                                  图3   敲低/过表达CT⁃LINC01424可以抑制/促进ESCC增殖和侵袭能力
               Figure 3  Knockdown/overexpression of CT⁃LINC01424 inhibited/promoted the proliferation and invasive ability of ESCC

              2.5  LINC01424潜在靶基因预测                             库,预测了LINC01424的潜在靶基因,相关性评分排
                  为进一步探索LINC01424对食管癌进展影响的                      名前10的基因如图5A所示。随后使用公共数据库
              具体机制,试图寻找其下游基因。基于 MEM 数据                          GSE53624(119 对 ESCC 样本)分析结果进一步证实
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