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第44卷第12期 季明德,廖俊进,高彩月,等. SAMD13通过激活ERK1/2对胶质瘤细胞增殖和侵袭的影响[J].
2024年12月 南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(12):1649-1656 ·1651 ·
数据库(http://gepia.cancer⁃pku.cn/)分析低级别胶质 2×Taq Plus Master Mix Ⅱ进行PCR扩增反应,PCR产
瘤(low⁃grade glioma,LGG)和高级别胶质瘤——胶 物用 1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳(120 V,30 min),
质母细胞瘤(glioblastma multiforme,GBM)患者肿瘤 进行琼脂糖凝胶成像观察。
组织中 SAMD13 基因的表达情况,并分析 SAMD13 1.2.6 Western blot检测
基因表达与胶质瘤患者预后的相关性。 用 RIPA 裂解细胞,将细胞裂解物煮沸后离心
1.2.2 细胞培养 (12 000 g,5 min)取上清,用10%或12%预制混胶行
将 U373、U87 和 U251 细胞接种于 3 mL 含 10% SDS⁃PAGE 电泳,先用 50 V 恒压电泳 30 min 浓缩蛋
FBS 的 DMEM 完全培养基中,置于 37 ℃、5% CO2培 白,再用 120 V 恒压电泳 2 h 分离蛋白,接着用 0.3A
养箱中培养。细胞传代:当细胞融合度为90%左右 湿转2 h,待蛋白转印到PVDF 膜上后,再用5%脱脂
时,用 1 mL 0.25%胰蛋白酶消化细胞,3 mL 完全培 奶粉室温封闭 2 h,加入 SAMD13(1∶1 000)、t⁃Akt1
养基终止消化,1 000 r/min 离心 5 min 后重悬细胞, (1∶1 000)、p⁃Akt1(1∶1 000)、t⁃ERK1/2(1∶1 000)、
按 1∶3 比例接种于新的细胞培养皿,置于培养箱中 p⁃ERK1/2(1∶2 000)、t⁃STAT3(1∶1 000)、p⁃STAT3
继续培养。 (1∶2 000)和β⁃actin(1∶100 000)抗体,4 ℃孵育过
1.2.3 质粒构建 夜,用1×TBST洗涤3次,每次15 min,再用HRP标记
SAMD13过表达质粒委托通用生物(安徽)股份 的二抗(1∶10 000)室温孵育 40 min,洗涤 3 次后行
有限公司构建,以 pIRES2⁃EGFP 质粒作为载体,构 ECL化学发光试剂检测。
建 SAMD13 过 表 达 质 粒 ,并 命 名 为 pIRES2 ⁃ 1.2.7 CCK⁃8实验
SAMD13。由南京科瑞斯生物科技有限公司设计并 将U373细胞接种于96孔板,同时转染各shRNA,
合成 3 个针对 SAMD13 基因不同靶点的 shRNA 序 培养 48 h,用无血清 DMEM 配制 10%的 CCK⁃8 工作
列,并以pRNA3⁃SV40⁃GFP(2A)Puro⁃U6质粒作为载 液,每孔替换 100 μL CCK⁃8 工作液,放置培养箱孵
体,构建各shRNA表达质粒,分别命名为shSAMD13⁃1 育,用酶标仪测定在450 nm的吸光度值。
(5′⁃GCTATCTGTTGACATGGAA⁃3′)、shSAMD13⁃2 1.2.8 侵袭实验
(5′⁃GGATTTGAGGAGCAAGCTA⁃3′)、shSAMD13⁃3 将 U373 细胞接种于 Transwell 小室,24 孔板下
(5′⁃TGCTATTGATGACAAGAAA⁃3′),同时合成对照 室加入 600 μL DMEM,放置细胞培养箱中,12 h 后
shRNA(shCTR,5′⁃TTCTCCGAACGTGTCACGT⁃3′)。 弃上清,用 PBS 洗涤 Transwell 小室 3 次,之后将
1.2.4 细胞转染 Transwell 小室放入甲醇中固定 30 min,再用 PBS 次
取 6 μL Lipofectamine 2000 和 94 μL 无 血 清 洗涤3次,接着加入结晶紫染色30 min,用PBS洗涤
DMEM,吹打混匀;另取 2 μg 质粒加入 100 μL 无血 3 次。擦去 Transwell 小室内部未穿膜的细胞,自然
清DMEM,吹打混匀;将稀释后的Lipofectamine 2000 干燥,在显微镜下观察并拍照。
加入稀释后的质粒中,吹打混匀,静置 15 min;弃掉 1.3 统计学方法
细胞培养皿中的DMEM,用PBS清洗,加入1.8 mL无 所有实验均独立重复 3 次,所得定量数据以均
血清 DMEM,将静置后的 Lipofectamine 2000 和质粒 数±标准误(x ± Sx)表示。采用 SPSS 19.0 统计软件
混合溶液加入细胞培养皿中,培养8 h后,换含10% 进行统计学分析,两组间比较采用配对t检验,多组
FBS的DMEM培养基继续培养。 间比较则采用单因素方差分析,Bonfferoni法进行两
1.2.5 RT⁃PCR 两比较,P < 0.05为差异有统计学意义。
通过NCBI数据库查找人SAMD13和GAPDH基
2 结 果
因 mRNA 序列,并使用 Primer⁃BLAST 在线设计 PCR
引物,由通用生物(安徽)股份有限公司合成。引物 2.1 胶质瘤患者肿瘤组织和细胞系中 SAMD13 的
序列如下:SAMD13(上游 5′⁃GTGCTTTTCAGGAA⁃ 表达情况
CAGGAAAT⁃3′;下游 5′⁃CCTTTGTGGGGAGGAGT⁃ 首先使用 GEPIA 数据库分析胶质瘤患者肿瘤
GTC⁃3′);GAPDH(上游 5′⁃GCGTCGCCAGCCGAG⁃ 组织中 SAMD13 的表达情况,结果发现与癌旁正常
3′;下游 5′⁃TGGAATTTGCCATGGGTGGA⁃3′)。用 组织比较,SAMD13 在患者肿瘤组织中显著高表达
VeZol 裂解细胞,提取细胞总 RNA,再用 HiScript Ⅱ (图 1A),且 GBM 组织中 SAMD13 表达量多于 LGG,
QRT SuperMix 逆转录为 cDNA,以 cDNA为模板,用 并与患者的不良预后密切相关(图1B)。之后,选用

