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第44卷第12期        季明德,廖俊进,高彩月,等. SAMD13通过激活ERK1/2对胶质瘤细胞增殖和侵袭的影响[J].
                 2024年12月                    南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(12):1649-1656                      ·1651 ·


                数据库(http://gepia.cancer⁃pku.cn/)分析低级别胶质           2×Taq Plus Master Mix Ⅱ进行PCR扩增反应,PCR产
                瘤(low⁃grade glioma,LGG)和高级别胶质瘤——胶                 物用 1.5%的琼脂糖凝胶进行电泳(120 V,30 min),
                质母细胞瘤(glioblastma multiforme,GBM)患者肿瘤             进行琼脂糖凝胶成像观察。
                组织中 SAMD13 基因的表达情况,并分析 SAMD13                     1.2.6 Western blot检测
                基因表达与胶质瘤患者预后的相关性。                                     用 RIPA 裂解细胞,将细胞裂解物煮沸后离心
                1.2.2 细胞培养                                       (12 000 g,5 min)取上清,用10%或12%预制混胶行
                    将 U373、U87 和 U251 细胞接种于 3 mL 含 10%            SDS⁃PAGE 电泳,先用 50 V 恒压电泳 30 min 浓缩蛋
                FBS 的 DMEM 完全培养基中,置于 37 ℃、5% CO2培                 白,再用 120 V 恒压电泳 2 h 分离蛋白,接着用 0.3A
                养箱中培养。细胞传代:当细胞融合度为90%左右                           湿转2 h,待蛋白转印到PVDF 膜上后,再用5%脱脂
                时,用 1 mL 0.25%胰蛋白酶消化细胞,3 mL 完全培                   奶粉室温封闭 2 h,加入 SAMD13(1∶1 000)、t⁃Akt1
                养基终止消化,1 000 r/min 离心 5 min 后重悬细胞,               (1∶1 000)、p⁃Akt1(1∶1 000)、t⁃ERK1/2(1∶1 000)、
                按 1∶3 比例接种于新的细胞培养皿,置于培养箱中                         p⁃ERK1/2(1∶2 000)、t⁃STAT3(1∶1 000)、p⁃STAT3
                继续培养。                                            (1∶2 000)和β⁃actin(1∶100 000)抗体,4 ℃孵育过
                1.2.3 质粒构建                                        夜,用1×TBST洗涤3次,每次15 min,再用HRP标记
                    SAMD13过表达质粒委托通用生物(安徽)股份                       的二抗(1∶10 000)室温孵育 40 min,洗涤 3 次后行
                有限公司构建,以 pIRES2⁃EGFP 质粒作为载体,构                     ECL化学发光试剂检测。

                建 SAMD13 过 表 达 质 粒 ,并 命 名 为 pIRES2 ⁃              1.2.7 CCK⁃8实验
                SAMD13。由南京科瑞斯生物科技有限公司设计并                              将U373细胞接种于96孔板,同时转染各shRNA,
                合成 3 个针对 SAMD13 基因不同靶点的 shRNA 序                   培养 48 h,用无血清 DMEM 配制 10%的 CCK⁃8 工作
                列,并以pRNA3⁃SV40⁃GFP(2A)Puro⁃U6质粒作为载                液,每孔替换 100 μL CCK⁃8 工作液,放置培养箱孵
                体,构建各shRNA表达质粒,分别命名为shSAMD13⁃1                    育,用酶标仪测定在450 nm的吸光度值。
               (5′⁃GCTATCTGTTGACATGGAA⁃3′)、shSAMD13⁃2             1.2.8 侵袭实验
               (5′⁃GGATTTGAGGAGCAAGCTA⁃3′)、shSAMD13⁃3                 将 U373 细胞接种于 Transwell 小室,24 孔板下
               (5′⁃TGCTATTGATGACAAGAAA⁃3′),同时合成对照                 室加入 600 μL DMEM,放置细胞培养箱中,12 h 后
                shRNA(shCTR,5′⁃TTCTCCGAACGTGTCACGT⁃3′)。           弃上清,用 PBS 洗涤 Transwell 小室 3 次,之后将
                1.2.4 细胞转染                                        Transwell 小室放入甲醇中固定 30 min,再用 PBS 次
                    取 6 μL Lipofectamine 2000 和 94 μL 无 血 清       洗涤3次,接着加入结晶紫染色30 min,用PBS洗涤
                DMEM,吹打混匀;另取 2 μg 质粒加入 100 μL 无血                  3 次。擦去 Transwell 小室内部未穿膜的细胞,自然
                清DMEM,吹打混匀;将稀释后的Lipofectamine 2000                干燥,在显微镜下观察并拍照。
                加入稀释后的质粒中,吹打混匀,静置 15 min;弃掉                       1.3  统计学方法
                细胞培养皿中的DMEM,用PBS清洗,加入1.8 mL无                          所有实验均独立重复 3 次,所得定量数据以均
                血清 DMEM,将静置后的 Lipofectamine 2000 和质粒              数±标准误(x ± Sx)表示。采用 SPSS 19.0 统计软件
                混合溶液加入细胞培养皿中,培养8 h后,换含10%                         进行统计学分析,两组间比较采用配对t检验,多组
                FBS的DMEM培养基继续培养。                                  间比较则采用单因素方差分析,Bonfferoni法进行两

                1.2.5 RT⁃PCR                                      两比较,P < 0.05为差异有统计学意义。
                    通过NCBI数据库查找人SAMD13和GAPDH基
                                                                  2  结 果
                因 mRNA 序列,并使用 Primer⁃BLAST 在线设计 PCR
                引物,由通用生物(安徽)股份有限公司合成。引物                           2.1  胶质瘤患者肿瘤组织和细胞系中 SAMD13 的

                序列如下:SAMD13(上游 5′⁃GTGCTTTTCAGGAA⁃                 表达情况
                CAGGAAAT⁃3′;下游 5′⁃CCTTTGTGGGGAGGAGT⁃                  首先使用 GEPIA 数据库分析胶质瘤患者肿瘤
                GTC⁃3′);GAPDH(上游 5′⁃GCGTCGCCAGCCGAG⁃              组织中 SAMD13 的表达情况,结果发现与癌旁正常
                3′;下游 5′⁃TGGAATTTGCCATGGGTGGA⁃3′)。用               组织比较,SAMD13 在患者肿瘤组织中显著高表达

                VeZol 裂解细胞,提取细胞总 RNA,再用 HiScript Ⅱ               (图 1A),且 GBM 组织中 SAMD13 表达量多于 LGG,
                QRT SuperMix 逆转录为 cDNA,以 cDNA为模板,用                并与患者的不良预后密切相关(图1B)。之后,选用
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