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第45卷第12期        石   靓,奚佩雯,吴 靓,等. RBM7在乳腺癌细胞MDA⁃MB⁃231中的表达及其对AKAP12表达
                 2025年12月                的影响[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2025,45(12):1766-1774                  ·1769 ·


                过夜,PBS 缓冲液冲洗 3 次,加兔二抗,室温下孵育                       变量均采用均数±标准差(x ± s)的形式进行描述性统
                20~30 min,PBS 冲洗 3 次。二氨基联苯胺(diamino⁃              计,以准确反映数据的集中趋势和变异程度。对于符
                benzidine,DAB)显色后充分冲洗,苏强度评分和阳                     合正态分布且方差齐性的两组均数比较使用两组独
                性细胞比例评分之积。着色强度评分标准:0 分未                           立样本t检验;使用方差分析比较多组间均数差异。
                染色,1分浅棕色,2分棕色,3分深棕色。阳性细胞                          实验均重复3次,P < 0.05为差异有统计学意义。
                比例评分标准:0 分无阳性细胞,1 分阳性细胞比例
                                                                  2  结 果
                ≤10%,2 分阳性细胞比例 11%~50%,3 分阳性细胞
                比例51%~80%,4分阳性细胞比例为81%~100%。                      2.1  在乳腺癌细胞 MDA⁃MB⁃231 中构建稳定的
                1.2.6 转录组分析                                       RBM7过表达及干扰细胞株

                    利用 Illumina Hiseq 4000 平台进行转录组 RNA                通过qRT⁃PCR和Western blot实验发现,在过表
                测序,通过Tophat2工具soft(v2.1.0)将读数与参考基                 达 RBM7 的实验组(RBM7)和对照组(NC)中,与对

                因组作图。由 DESeq(1.10.1)发现的调整后的 P <                   照组相比,实验组 RBM7 的 mRNA 和蛋白表达水平
                0.05 的基因(log2FC>2)被指定为差异表达。使用 R                   明 显 增 高 ,差 异 有 统 计 学 意 义(P 均 < 0.05,图
                包 clusterProfiler 实现对差异表达基因(differentially        1A~C);同时,在干扰RBM7的实验组(Sh⁃1和Sh⁃2)
                expressed gene,DEG)在特定基因本体论(gene ontol⁃           和对照组(SCR)中,实验组 RBM7 的 RNA 和蛋白表
                ogy,GO)富集显著性的量化评估。                                达水平明显下降,差异有统计学意义(P < 0.05,图

                1.2.7  RNA结合蛋白免疫共沉淀(RNA binding pro⁃              1D~F),筛选出的稳转细胞株用于后续实验。
                tein immunoprecipitation,RIP)                     2.2  高通量测序检测发现RBM7主要富集通路
                    将人乳腺癌细胞 MDA⁃MB⁃231(2×10 个)用                       本课题组前期研究将已构建的RBM7过表达组
                                                       7
                RNA免疫沉淀裂解缓冲液裂解,离心取上清,在4 ℃                        (RBM7)和相应对照组(NC)的乳腺癌细胞提取
                下分别与 5 μg 抗兔 RBM7 抗体和抗兔非特异性 IgG                   RNA 并进行 RNA⁃seq 检测,发现可能受 RBM7 表达
                摇床孵育过夜。待抗体与RNA以及磁珠结合后,对                           改变影响的基因和通路 。进一步经GO分析发现,
                                                                                       [7]
                沉淀下来的复合物进行RNA纯化。之后,将纯化的                           受RBM7影响的显著表达的基因主要富集在细胞周
                RNA进行qRT⁃PCR、RT⁃PCR及琼脂糖电泳实验。                      期这一通路中(图2A)。因此,猜想受RBM7影响的
                1.3  统计学方法                                        显著差异表达的基因可能在细胞周期过程中发挥
                    应用GraphPad Prism 10统计软件分析,所有数值                重要作用。


                       A    20        *             B         MDA⁃MB⁃231         C     8        *
                         Relative expression  mRNA of RBM7  15  β⁃actin    -31 kDa  Relative expression  protein of RBM7  6 4
                                                              NC
                                                                     RBM7
                                                       RBM7
                            10
                                                                           -43 kDa

                             0 5                                                       2 0
                                  NC    RBM7                                                NC    RBM7
                       D              *             E                            F
                            1.5     *                        SCR  Sh⁃1  Sh⁃2           1.5     *  *
                                                              MDA⁃MB⁃231
                         Relative expression  mRNA of RBM7  1.0  β⁃actin   -31 kDa  Relative expression  protein of RBM7  1.0
                                                       RBM7

                            0.5
                                                                                       0.5
                                                                           -43 kDa
                            0.0                                                        0.0
                                SCR  Sh⁃1  Sh⁃2                                            SCR  Sh⁃1  Sh⁃2
                                                                                                   *
                   A:The overexpression of RBM7 regulated RNA expression of RBM7 in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231 via qRT⁃PCR(n=3,P < 0.05). B,C:The
                                                                                               *
                overexpression of RBM7 regulated protein expression of RBM7 in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231 via Western blot(n=3,P < 0.05). D:The knock⁃
                                                                                     *
                down of RBM7 regulated RNA expression of RBM7 in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231 via qRT⁃PCR(n=3,P < 0.05). E,F:The knockdown of RBM7
                                                                             *
                regulated protein expression of RBM7 in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231 via Western blot(n=3,P < 0.05).
                                   图1   人乳腺癌 MDA⁃MB⁃231 细胞中 RBM7 过表达效率及干扰效率的验证
                         Figure 1 The validation of RBM7 overexpression and knockdown in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231
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