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第45卷第12期 石 靓,奚佩雯,吴 靓,等. RBM7在乳腺癌细胞MDA⁃MB⁃231中的表达及其对AKAP12表达
2025年12月 的影响[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2025,45(12):1766-1774 ·1769 ·
过夜,PBS 缓冲液冲洗 3 次,加兔二抗,室温下孵育 变量均采用均数±标准差(x ± s)的形式进行描述性统
20~30 min,PBS 冲洗 3 次。二氨基联苯胺(diamino⁃ 计,以准确反映数据的集中趋势和变异程度。对于符
benzidine,DAB)显色后充分冲洗,苏强度评分和阳 合正态分布且方差齐性的两组均数比较使用两组独
性细胞比例评分之积。着色强度评分标准:0 分未 立样本t检验;使用方差分析比较多组间均数差异。
染色,1分浅棕色,2分棕色,3分深棕色。阳性细胞 实验均重复3次,P < 0.05为差异有统计学意义。
比例评分标准:0 分无阳性细胞,1 分阳性细胞比例
2 结 果
≤10%,2 分阳性细胞比例 11%~50%,3 分阳性细胞
比例51%~80%,4分阳性细胞比例为81%~100%。 2.1 在乳腺癌细胞 MDA⁃MB⁃231 中构建稳定的
1.2.6 转录组分析 RBM7过表达及干扰细胞株
利用 Illumina Hiseq 4000 平台进行转录组 RNA 通过qRT⁃PCR和Western blot实验发现,在过表
测序,通过Tophat2工具soft(v2.1.0)将读数与参考基 达 RBM7 的实验组(RBM7)和对照组(NC)中,与对
因组作图。由 DESeq(1.10.1)发现的调整后的 P < 照组相比,实验组 RBM7 的 mRNA 和蛋白表达水平
0.05 的基因(log2FC>2)被指定为差异表达。使用 R 明 显 增 高 ,差 异 有 统 计 学 意 义(P 均 < 0.05,图
包 clusterProfiler 实现对差异表达基因(differentially 1A~C);同时,在干扰RBM7的实验组(Sh⁃1和Sh⁃2)
expressed gene,DEG)在特定基因本体论(gene ontol⁃ 和对照组(SCR)中,实验组 RBM7 的 RNA 和蛋白表
ogy,GO)富集显著性的量化评估。 达水平明显下降,差异有统计学意义(P < 0.05,图
1.2.7 RNA结合蛋白免疫共沉淀(RNA binding pro⁃ 1D~F),筛选出的稳转细胞株用于后续实验。
tein immunoprecipitation,RIP) 2.2 高通量测序检测发现RBM7主要富集通路
将人乳腺癌细胞 MDA⁃MB⁃231(2×10 个)用 本课题组前期研究将已构建的RBM7过表达组
7
RNA免疫沉淀裂解缓冲液裂解,离心取上清,在4 ℃ (RBM7)和相应对照组(NC)的乳腺癌细胞提取
下分别与 5 μg 抗兔 RBM7 抗体和抗兔非特异性 IgG RNA 并进行 RNA⁃seq 检测,发现可能受 RBM7 表达
摇床孵育过夜。待抗体与RNA以及磁珠结合后,对 改变影响的基因和通路 。进一步经GO分析发现,
[7]
沉淀下来的复合物进行RNA纯化。之后,将纯化的 受RBM7影响的显著表达的基因主要富集在细胞周
RNA进行qRT⁃PCR、RT⁃PCR及琼脂糖电泳实验。 期这一通路中(图2A)。因此,猜想受RBM7影响的
1.3 统计学方法 显著差异表达的基因可能在细胞周期过程中发挥
应用GraphPad Prism 10统计软件分析,所有数值 重要作用。
A 20 * B MDA⁃MB⁃231 C 8 *
Relative expression mRNA of RBM7 15 β⁃actin -31 kDa Relative expression protein of RBM7 6 4
NC
RBM7
RBM7
10
-43 kDa
0 5 2 0
NC RBM7 NC RBM7
D * E F
1.5 * SCR Sh⁃1 Sh⁃2 1.5 * *
MDA⁃MB⁃231
Relative expression mRNA of RBM7 1.0 β⁃actin -31 kDa Relative expression protein of RBM7 1.0
RBM7
0.5
0.5
-43 kDa
0.0 0.0
SCR Sh⁃1 Sh⁃2 SCR Sh⁃1 Sh⁃2
*
A:The overexpression of RBM7 regulated RNA expression of RBM7 in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231 via qRT⁃PCR(n=3,P < 0.05). B,C:The
*
overexpression of RBM7 regulated protein expression of RBM7 in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231 via Western blot(n=3,P < 0.05). D:The knock⁃
*
down of RBM7 regulated RNA expression of RBM7 in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231 via qRT⁃PCR(n=3,P < 0.05). E,F:The knockdown of RBM7
*
regulated protein expression of RBM7 in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231 via Western blot(n=3,P < 0.05).
图1 人乳腺癌 MDA⁃MB⁃231 细胞中 RBM7 过表达效率及干扰效率的验证
Figure 1 The validation of RBM7 overexpression and knockdown in breast cancer cell MDA⁃MB⁃231

