Page 46 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 46
第41卷第11期
·1608 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年11月
functional impact of the variant on H19 still needs further experimental validation.
[Key words] renal cell carcinoma;genetic variant;H19,;susceptibility;survival
[J Nanjing Med Univ,2021,41(11):1607⁃1613]
肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是肾癌的 族,无血缘基因联系。所有患者均经组织病理学证
主要类型,分别占男性和女性所有恶性肿瘤的 5% 实患 RCC,既往接受过化疗、放疗或有其他类型恶
和 3% [1-2] ,其中高达 17%的患者在诊断时出现转 性肿瘤的患者被排除在本研究之外。根据WHO标
移,其余 30%的患者甚至在手术治疗后也会出现 准及TNM系统进行分级,分为局部(Ⅰ期和Ⅱ期)及
转移 [3-4] ,总体预后较差。肾癌的发生是一个复杂 晚期(Ⅲ期和Ⅳ期)RCC。对照组为门诊体检患者,
[5]
的过程,涉及环境和遗传因素之间的相互作用 。 并按照性别和年龄(±5岁)进行频率匹配,排除与患
近年来,基因变异已被广泛研究并证明影响RCC的 者有遗传关联或有癌症病史的患者。本研究设计
易感性、进展和预后 [6-7] 。 为两个阶段:实验组于2004年5月—2009年10月共
长链非编码RNA(long non⁃coding RNA,lncRNA) 纳入342例RCC患者和361例对照,每6个月在门诊
是一类长度超过200个核苷酸的内源性细胞核糖核 随访患者,终点为患者死亡或丢失访。其中 44 例
[8]
酸,缺乏蛋白质编码能力 ,越来越多的证据表明 (12.9%)患者缺少足够的随访信息被排除,最长随
lncRNA 在各种癌症的发生和发展中起到至关重要 访时间为72.0个月,中位随访时间为25.1个月。验
[9]
的作用 。lncRNAH19 是一种父系印记基因,位于 证组至今共纳入672例RCC患者和702例对照。所
[10]
人类染色体11p15.5上 ,通过调节miRNA功能及介 有患者信息均通过标准问卷调查获得,获得知情同
导DNA甲基化参与重要的生物学和病理学过程 。 意后,捐献 5 mL 静脉血。本研究对 1 014 例 RCC 患
[11]
H19 与胰岛素样生长因子 2(insulin like growth fac⁃ 者及 1 063 例健康对照 4 种基因多态性的多种组合
tor 2,IGF⁃2)基因密切相关,该基因也位于受甲基化 进行分型与分析。
印记影响的区域,参与胎儿的正常生长和发育 ,同 1.2 方法
[12]
时也在癌症的发生发展中发挥功能 [13] 。研究表明 1.2.1 多态性选择
H19异常表达与多种恶性肿瘤包括膀胱癌、乳腺癌、 使用UCSC网站(http://genome.ucsc.edu/)对位于
食管癌及肾细胞癌的发生相关 [14] 。Wang 等 [15] 研究 人染色体 11p15.5(位置 20164062021693)H19 基因
发现,H19 在 RCC 肿瘤组织中高表达,并与肿瘤分 及其启动子中的基因多态性进行鉴定,在千人基因组
期、淋巴结转移及远处转移有关,且 H19 表达是 计划的东亚人群中以定位等位基因频率>0.05 为标
RCC 患者临床预后的独立预测因子。新近研究一 准。本研究最终选择并研究 rs2839698、rs217727、
致表明 H19 基因多态性与各种癌症发病风险及预 rs3741216和rs3741219 4个标记多态性。
后相关,包括胃癌 [16] 、结直肠癌 [17] 、膀胱癌 [18] 和乳腺 1.2.2 DNA提取和基因分型
癌 [19] 等。最近一项荟萃分析表明,H19 rs2839698与 通过蛋白酶K消化及氯仿从外周血中提取基因
胃肠癌风险增加有关 [20] 。鉴于 H19 在 RCC 发生发 组 DNA,4 种多态性基因分型使用预先设计的 Taq⁃
展中的关键作用,其基因变异可能与RCC发病及预 Man SNP基因分型试剂盒(Applied Biosystems 公司,
后相关。然而目前并没有研究探讨此类问题,因此 美国)进行分析,每个单核苷酸多态性的引物和探
本 研 究 选 择 H19 最 被 广 泛 研 究 的 4 个 多 态 性 : 针 序 列 可 根 据 要 求 提 供(表 1)。 在 384 孔 ABI
rs2839698、rs217727、rs3741216 和 rs3741219,并在 7900HT实时聚合酶链反应系统中进行扩增和分析,
一项两阶段病例对照研究中评估其与 RCC 风险及 使用SDS 2.3软件进行等位基因鉴别。每个平板内均
预后的关系。 包括质控品,以确保基因分型的准确性。随机选择约
10%的样本进行重复基因分型,结果100%一致。
1 对象和方法
1.3 统计学方法
1.1 对象 基因突变的等位基因频率在分析前使用拟合
本研究始于2004年5月,得到南京医科大学第 优度χ 检验检测是否偏离 Hardy⁃Weinberg 平衡,采
2
一附属医院伦理委员会批准。所有入组者均为汉 用Student’s t检验(连续变量)和χ 检验(分类变量)
2