Page 148 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 148

第41卷第2期
               ·298 ·                            南 京    医 科 大 学 学         报                        2021年2月


              差异代谢物筛选和代谢通路富集分析。其中模型                             行反复验证以使模型具有更高的可靠性。
              构建是对多元变量统计分析的关键步骤,主要方法                                 综上,代谢组学拥有一套完整的方法体系,其
              包括无监督的主成分分析法(principal component                  工作流程如图1所示。相比于其他组学(基因组学、
              analysis,PCA)和有监督的偏最小二乘法判别分析                      转录组学、蛋白组学),代谢组学位于组学终端,代
              法(partial least squares discriminant analysis,PLS ⁃  谢产物的变化往往更能代表肿瘤细胞内发生的各
              DA),目的是对代谢组学的高维数据进行降维处                            种生理生化反应的整体信息和最终结果,被认为是
              理。前者适用于分类信息未知的样品,反映不同组                            反映生物表型最有效的分子,能为肿瘤的机制研
              别间自然的聚类趋势,在代谢组学中主要用于质控                            究、药物靶标发现、生物标志物研究和临床诊疗等
              评价或分组。后者是代谢组学使用较多的方法,强调                           提供更多有价值的信息。
              自变量对因变量的解释和预测作用,去除对回归无益
                                                                2  胶质母细胞瘤与代谢异常机制
              噪声的影响,使分类模型包含最少的变量数,为避免
              模型因过拟合而造成的预测作用不佳,还要对模型进                                神经胶质瘤是最常见的脑部恶性肿瘤,约占脑





                                           肿瘤组织
                            肿瘤患者                                           HPLC/GC⁃MS
                                  样本采集            样本提取           送样检测
                                         肿瘤细胞培养
                                                                              NMR
                                                      对照组和实验组
                            荷瘤小鼠
                                    生物体液(血浆、脑脊液等)



                                          2⁃hydroxy⁃glutaric acid                      数据采集与
                                                       信息挖掘    聚类分析         PLS⁃DA分析   统计学分析

                                              tryptophan
                                              肿瘤标志物
                                                               PCA分析         通路分析
                                                    图1   代谢组学工作流程图
                                            Figure 1  Working flowchart of metabolomics


              部恶性肿瘤的 80%,其中胶质母细胞瘤(glioblasto⁃                   ab)是目前唯一获美国FDA批准的GBM分子靶向药,
                                                                                                       [24]
              ma,GBM)属于神经胶质瘤中的级别最高的分型(Ⅳ                         它通过抑制肿瘤血管新生而发挥抗肿瘤效应 。
              级),恶性程度相对较高,治疗后的 5 年生存率仅为                              代谢失调是细胞癌变的重要标志之一,该特征
                 [19]
              2%   。目前,GBM 的治疗多采用手术切除癌灶再                        在GBM中也得到充分体现,推测其原因可能是肿瘤
              辅助放化疗的策略          [20] 。替莫唑胺(temozolomide,        细胞为更好维持其在体内的生存、增殖和侵袭所做
              TMZ)是目前胶质瘤治疗的一线药物,临床试验表明                          出的适应性调整,包括对细胞内糖类、谷氨酰胺、脂
              接受放疗联合TMZ治疗的患者的中位生存期明显长                           质、核苷酸等重要物质进行的代谢重编程(metabol⁃
              于仅接受放疗的患者 。另外,合用TMZ能延长神                           ic reprogramming) 。因此,解析其异常的代谢机
                                 [21]
                                                                                [25]
              经胶质瘤患者手术后的生存期 。亚硝基脲类烷化                            制是阻止肿瘤发生发展,提高治疗收益以及改善预
                                         [22]
              剂如卡莫司汀(carmustine)、洛莫司汀(lomustine)                后的关键所在。Marin⁃Valencia等        [26] 研究表明,通过
                                                                                                   18
              等,常单用或与其他化疗药物如甲基苄肼(procarba⁃                      18 F⁃脱氧葡萄糖正电子发射断层成像( F deoxyglu⁃
              zine)和长春新碱(vincristine)等组成联合化疗方案                  cose⁃positron emission tomography,FDG⁃PET),证
                                                                                                18
              应用于恶性胶质瘤的治疗            [23] 。另外,靶向血管内皮            实在GBM中葡萄糖代谢十分活跃,同位素标记显示
              生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)     从葡萄糖衍生的谷氨酸合成谷氨酰胺的生化反应

              的重组人单克隆 IgG1 抗体贝伐珠单抗(bevacizum⁃                   异常活跃是GBM的重要代谢特征,由于谷氨酰胺酶
   143   144   145   146   147   148   149   150   151   152   153