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第41卷第2期 严晓娣，史国振，毛旭华. 高通量测序技术检测非小细胞肺癌相关驱动基因的突变［J］.
2021年2月 南京医科大学学报（自然科学版），2021，41（02）：193-197 ·195 ·

表1 高通量测序法检测EGFR基因突变
2 结 果
Table 1 EGFR mutations detected by high⁃throughput se⁃
2.1 高通量测序法检测基因突变在 NSCLC 患者中 quencing
的分布 外显 EGFR 突变位点 突变
子 例数
本研究入组 160 例 NSCLC 患者，提取其组织标
18 c.2125G>A，（p.E709K） 02
本DNA。经检测10例标本DNA质量不符合实验要
c.2155G>A，（p.G719S） 04
求，对其余 150 例标本进行检测。其中男 87 例，女
19 c.2186G>C，（p.G729A） 01
63例；年龄<60岁57例，≥60岁93例；病理类型为腺 c.2245G>C，（p.E749Q） 01
癌 109 例，鳞癌 34 例，腺鳞癌 2 例，其他 5 例；高⁃ 中 c.2248G>C，（p.A750P） 02

分化61例，低分化89例；TNM分期Ⅰ~Ⅱ期52例；Ⅲ~ c.2260A>G，（p.K754E） 01
Ⅳ期 98 例。150 例标本进行高通量测序检测，结果 c.2127_2129del，（p.E709_T710delinsD） 02
c.2235_2249del，（p.E746_A750del） 06
显示，EGFR、KRAS、BRAF、NRAS、Her⁃2 和 PIK3CA
c.2236_2244del，（p.E746_R748del） 03
基因突变检出率分别为51.33%（77/150）、7.33%（11/
c.2236_2249del，（p.E746_A750del） 01
150）、1.33%（2/150）、1.33%（2/150）、2.00%（3/150）
c.2236_2250del，（p.E746_A750del） 05
和4.67%（7/150）。57例标本未检出任何基因突变，
c.2236_2256del，（p.E746_S752del） 01
84例标本检出单个驱动基因发生突变，9 例标本检
c.2237_2251del，（p.E746fs） 01
出 2 个及以上驱动基因发生突变。 c.2238_2252del，（p.E746_T751delinsE） 04
6 种驱动基因中，EGFR 基因突变检出率最高， c.2239_2256del，（p.L747_S752del） 02
77 例标本共检出 86 个 EGFR 基因突变，其中有 9 例 c.2240_2257del，（p.L747_P753delinsS） 04
患者检出 EGFR 基因双位点复合突变。EGFR 基因 20 c.2369C>T，（p.T790M） 01
突变位点集中在 EGFR 基因 19 外显子缺失突变和 c.2341T>A，（p.C781S） 01
21 外显子 L858R 位点突变，分别占 33.72%（29/86） 21 c.2471G>C，（p.G824A） 01
c.2500G>T，（p.V834L） 01
和 45.35%（39/86），具体结果见表 1。KRAS 基因突
c.2573T>G，（p.L858R） 39
变集中在 12、13 密码子，其中 12 密码子占 91.67%
c.2582T>A，（p.L861Q） 01
（11/12），1例患者12密码子检出G12C和G12V两个
c.2588G>A，（p.G863D） 02
不同位点复合突变。2 例 BRAF 基因突变分别为
V600E 和 L618F 位点突变。2 例 NRAS 基因突变分 表 2 高通量测序法检测 KRAS、BRAF、NRAS 、Her⁃2 和
别为 G12D 和 D33E 位点突变。3 例 Her⁃2 基因突变
PIK3CA 基因突变
均为 P761H 位点突变。PIK3CA 基因突变分别为 Table 2 KRAS，BRAF，NRAS，Her⁃2 and PIK3CA muta⁃
E542K、E545K 和 H1047L 位点突变，其中 1 例患者 tions detected by high⁃throughput sequencing
检出E542K和E545K两个不同位点复合突变，具体 基因 突变位点 突变例数
结果见表2。 KRAS c.34G>T，（p.G12C） 3
2.2 高通量测序法、Sanger测序法和ddPCR法检测 c.34G>A，（p.G12C） 1
EGFR基因突变的比较 c.35G>A，（p.G12D） 4
c.35G>T，（p.G12V） 2
150 例标本采用金标准 Sanger 测序法检测 EG⁃
FR 基因突变，突变检出率为 38.67%（58/150），与高 c.35G>C，（p.G12A） 1
c.37G>T，（p.G13C） 1
通量测序法突变检出率［51.33%（77/150）］比较，差
BRAF c.1799T>A，（p.V600E） 1
异有统计学意义（χ =4.862，P=0.027）。高通量测序
2
c.1854G>T，（p.L618F） 1
法灵敏度为98.28%，特异度为78.26%。
NRAS c.35G>A，（p.G12D） 1
150 例标本采用 ddPCR 法检测 EGFR 基因突 c.99T>G，（p.D33E） 1
变，突变检出率为 50.00%（75/150），与高通量测序 Her⁃2 c.2282C>A，（p.P761H） 3
法比较，差异无统计学意义（χ =0.053，P=0.818）。 PIK3CA c.1624G>A，（p.E542K） 2
2
阳性一致率为 82.67%，阴性一致率 80.00%，总一致 c.1633G>A，（p.E545K） 3
率为81.33%。3种不同方法的具体比较见表3。 c.3140A>T，（p.H1047L） 3