Page 46 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第2期
·196 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年2月
表3 Sanger测序法、ddPCR法和高通量测序法特点比较 极低,3 号外显子上 61 号密码子突变最常见,其次
Table 3 The characteristics comparison of ddPCR, 是 2 号外显子上的 12 号密码子突变 [17] 。本研究检
Sanger sequencing and high ⁃ throughput se⁃
出 NRAS 基因 12 号密码子 G12D 位点突变及 D33E
quencing
罕见位点突变,由于样本量较小,并未检出 61 号密
特点 Sanger测序 ddPCR 高通量测序 码子突变。Song等 研究指出NSCLC中Her⁃2 基因
[18]
定量检测 不能定量检测 可绝对定量 可定量检测
突变以插入突变最为常见,其次为 P761H 位点突
检测灵敏度 10% 0.04%~0.10% 1%
变。本研究与之不同,检出的 3 例突变均为 P761H
检测范围 已知和未知突 已 知 特 定 突 已知和未知突
位点突变,未检出插入突变,具体原因还需进一步
变 ,可 提 供 基 变,无法提供 变,可提供基
分析。本研究中PIK3CA基因突变检出率为4.67%,
因序列信息 基因序列信息 因序列信息
检测周期 2~3 d 1 d 3~5 d 与此前的研究相符 [19] 。除 1 例标本检出 PIK3CA 基
检测通量 低通量 低通量 高通量 因 2 个不同位点的复合突变外,其余 6 例突变均和
其他驱动基因以复合突变的形式存在,该特征与
3 讨 论 [7]
Scheffler等 学者的研究一致。
随着高通量测序技术的不断发展,以其为技术 近年来国内外的研究发现,肿瘤驱动基因可以
基础的基因检测在 NSCLC 诊疗中的应用日益广 以复合突变的形式存在 [17,20] ,本研究也得到相同的
泛。本研究选择了NSCLC诊疗中相关的6个驱动基 结论,共发现9例标本存在驱动基因复合突变,这提
因进行高通量测序检测,并分析其在我国NSCLC患 示某些 NSCLC 的形成可能不单是一个驱动基因的
者中的变异情况。 作用,而是多个驱动基因共同作用的结果。
EGFR 基因突变是 NSCLC 最常见的突变基因, 本研究通过对 EGFR 基因突变的检测,分析比
本研究 EGFR 基因突变的检出率为 51.33%,与以往 较了 Sanger 测序法、ddPCR 法和高通量测序法 3 种
的研究报道相符 [9-10] 。检出的 EGFR 基因突变以常 不同的方法。高通量测序法与基因检测金标准
见的 19 外显子缺失突变和 21 外显子 L858R 位点突 Sanger测序法相比较,EGFR基因突变检出率大幅提
变为主,同时也检测到罕见位点突变。文献报道, 升,差异有统计学意义。高通量测序法检测灵敏度
EGFR 基因18外显子G719S罕见位点突变对TKI治 明显高于 Sanger 测序法,但研究中发现 1 例标本
疗敏感,但其敏感性不及常见突变,同时厄洛替尼 Sanger测序法检出19外显子缺失突变,但高通量测
比吉非替尼在罕见突变方面有更好的疗效 [11] 。18 序法却并未检出,猜测可能是高通量测序法生物信
外显子E709X罕见位点突变与G719S罕见位点突变 息学软件分析结果时产生错误。高通量测序法与
相比,敏感性更低 [12] 。21外显子L861Q罕见位点突 新技术 ddPCR 法检测 EGFR 基因突变,检出率差异
变同 18 外显子 G719S 罕见位点突变一样表现出不 无统计学意义。理论上ddPCR法检测EGFR基因突
及常见突变的敏感性 [12] 。20 外显子 T790M 位点突 变应有更高的突变检出率,但实践中ddPCR法商用
变经大量研究证实是耐药位点 [12,13] 。本研究中有 9 检测试剂盒仅能检测少数已知的热点突变,部分罕
例患者检出 EGFR 基因双位点复合突变,有研究指 见和未知突变无法检测,导致突变检出率并不高。
综合来看,高通量测序法拥有更高的检测通量和突
出,罕见突变的复合突变其疗效要优于单一罕见突
变 [12,14] 。本研究中尚有部分罕见突变未见报道或相 变检出率,并可同时检测多个基因,更适合应用于
NSCLC诊疗。Sanger测序法和ddPCR法可作为有益
关证据不足,还需进一步研究。
的补充。
本研究中KRAS基因突变检出率与文献报道相
虽然高通量测序技术应用于 NSCLC 诊疗过程
吻合 [15] 。文献报道KRAS基因突变以G12C和G12V
中仍有诸多问题亟待解决,但随着高通量测序技术
突变位点最为常见 [15] ,而本研究与之不同,G12D 位
的不断发展,持续降低成本,缩短检测周期及提高
点突变检出最多。Zer等 [16] 学者的研究表明,G12C/
准确性,将更广泛地应用于肿瘤尤其是NSCLC的临
G12V 位点突变患者经TKI治疗后预后差,而G12D/
床诊断及个体化治疗中。
G12S 位点突变患者可以从 TKI 治疗中获益。本研
究检测到的 2 例 BRAF 基因突变,1 例为经典的 [参考文献]
V600E 位点突变,另 1 例为 L618F 位点罕见突变。 [1] BRAY F,FERLAY J,SOERJOMATARAM I,et al. Glob⁃
研究表明,NRAS 基因突变在 NSCLC 中的发生频率 al cancer statistics 2018:GLOBOCAN estimates of inci⁃