Page 126 - 南京医科大学学报自然科学版
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第41卷第6期
·904 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2021年6月
uTYPE(One Lammbda 公司,美国)软件分析测序结 30:01、02:06、31:01、01:01。南京、镇江、常州、扬
果,得出相应HLA⁃A位点等位基因分型。 州总体也很接近,常见的前 4 位等位基因依次为
1.3 统计学方法 A*11:01、24:02、02:01:01G、33:03。盐城、宿迁比
根据直接计数法计算 HLA⁃A 位点等位基因频 较接近,常见的 HLA⁃A 位点等位基因大体依次为
率,公式按GF=X/2n,X为某一等位基因在该群体中 A*11:01、24:02、02:01:01G、30:01、33:03、02:07、
的个数,n 为该群体的人数。以南京地区频率作为 02:06、01:01,仅在 A*02:01:01G 和 A*30:01 的顺
对照,就各地市常见的前5位等位基因,将江苏其余 序上有所区别。徐州、淮安也比较接近,常见的
7 地市与南京地区进行对比分析,行卡方检验,以 HLA⁃A 位点等位基因大体依次为 A*24:02、11:01、
P<0.01 为有显著性差异,分析各地市常见的 HLA⁃ 30:01、02:01:01G、33:03,仅在A*30:01和A*02:01:
A位点等位基因及其分布规律。 01G的顺序上有所区别。
江苏北连山东,南与上海、浙江接壤,HLA⁃A位
2 结 果
点等位基因频率与相邻地区比较发现:我国鲁南地
2.1 江苏8地市汉族人群HLA⁃A位点等位基因频率 区汉族人群HLA⁃A 位点常见的等位基因依次为A*
江苏8地市汉族人群HLA⁃A位点等位基因频率 24:02、30:01、11:01、02:01:01G、33:03 ,与徐州、
[5]
见表 1,共检测出 85 种等位基因,其中常州 55 种, 淮安非常接近,这与地域分布基本吻合。上海汉族
南京 55 种,镇江 38 种,扬州 37 种,淮安 41 种,宿迁 人群 HLA⁃A 位点常见的前 4 位等位基因依次为 A*
[6]
44 种,徐州42种,盐城41种。 11:01、24:02、02:01:01G、33:03 ,浙江 HLA⁃A 位
2.2 江苏 8 地市汉族人群常见 HLA⁃A 位点等位基 点常见的前 3 位等位基因依次为 A*11:01、24:02、
因分析 02:01:01G ,二者与南京、镇江、常州、扬州完全一
[7]
常见 HLA 等位基因更能反映该地区 HLA 多态 致,这与地域分布也基本吻合。
性,江苏8地市HLA⁃A位点等位基因频率排名前10 A*02 是发现最早、频率较高、高度多态性的
(频率约高于2.7%)见表2。 HLA⁃Ⅰ类分子,不同人种、民族、相同人种不同地域
以南京地区频率作为对照,就 A*02:01:01G 、 其亚型频率有明显差异。江苏8地市频率最高的均
11:01、24:02、30:01、33:03 等位基因,将江苏其余 为A*02:01:01G,其次是A*02:07,这点与我国北方
7 地市与南京地区进行对比分析(表 3)。可见南京 A*02 的多态性完全一致 [8] ,而在我国南方,如广
与常州在A*30:01基因频率上有显著性差异。南京 东、广西 A*02:07 频率远高于 A*02:01 [9] ,这也说
与镇江、扬州在A*02:01:01G 、11:01、24:02、30:01、 明江苏8地市HLA⁃A位点基因多态性总体还是偏向
33:03基因频率上均无显著性差异。南京与淮安在 我国北方。A*02:03 在我国南北方汉族频率都不
A*02:01:01G、11:01、30:01 基因频率上有显著性 高,在江苏 8 地市频率也不高,而在广西壮族人群
差异。南京与宿迁在A*11:01、24:02、30:01基因频 中,A*02:03 在 A2 亚型中频率最高,同时 A*02:07
[10]
率上有显著性差异。南京与徐州在A*11:01、30:01 频率远高于 A*02:01 ,这说明广西壮族人群的
基因频率上有显著性差异。南京与盐城在A*11:01、 HLA 分布既有少数民族的特点,也兼有我国南方人
30:01、33:03基因频率上有显著性差异。 群的部分特点。江苏8地市A*02:07、02:06 的分布
也有其规律,常州、南京、镇江、扬州、盐城、淮安的
3 讨 论
A*02:07频率远高于A*02:06,这点与上海、浙江一
江苏地理位置特殊,本研究涉及的江苏 8 地市 致 [6-7] 。宿迁A*02:07、02:06频率相差无几,而在徐
HLA⁃A 位点等位基因分布特征与地域分布大体吻 州,A*02:06 频率远高于 A*02:07,这点与我国鲁
合。南京、镇江、扬州非常接近,在 A*02:01:01G 、 南、河南一致 ,而徐州离鲁南、河南都非常近,这与
[5]
11:01、24:02、30:01、33:03常见等位基因频率上均 地域特点基本吻合。
无显著性差异。其中南京、镇江最为接近,常见的 HLA⁃Ⅰ类分子呈递来源于病原体的多肽,HLA
HLA⁃A 位 点 等 位 基 因 依 次 为 A*11:01、24:02、 ⁃A 位点等位基因与病原体疾病相关性也有不少研
02:01:01G、33:03、30:01、02:07、02:06、31:01、01:01; 究,大多是区域性研究,如来自湖北地区的研究发现
[11]
常州、扬州也非常接近,常见的 HLA⁃A 位点等位基 A* 02:06是Ⅰ型艾滋病感染的危险因素之一 。A*
因依次为A*11:01、24:02、02:01:01G、33:03、02:07、 01:01为结核病的易感基因之一 [12] ,A*02:03与乙肝