Page 31 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 31
第41卷第8期 程照翔,方 超,吕纯业. 抑制PP2Acα促进胃癌进展中WTAP高表达[J].
2021年8月 南京医科大学学报(自然科学版),2021,41(08):1128-1134 ·1133 ·
A
已知的关系 预测关系 其他
KLAA1429
CBLL1
来源于数据库 基因相邻 文献提及
WTAP
实验证明 基因融合 共表达
METTL3
基因共现 蛋白质同源性
ZC3H13
MED17
MEITL14
POLR2B
number of nodes:32 expected number of edgen: 52
number of edges:222 PPI enrichment p⁃value: <1.0e⁃16
average node degree:13.9 your network has significantly more interactions
avg. local clustering coefficient:0.86 than expected(what does that mean?)
INTS5
GSK3B
PPP2CA
PDPK
AKT3
PPP2R5A
PPP2R1B
PPP2R1A PPP2R5C AKT2
PPP2CB
AKT1
PPP2R5D
PPP2R5E
LCMT1 PPP2R5B
PPP2R3B
PPP2R2D
SGOL1 PPP2R2A
PPP2R2B
PPP2R2C
PPME1
B 磷酸化
160
140 泛素化
其他
120
数据来源数 100
80
60
40
20
0 Wtap
50 100 150 200 250 300 350
Residue number
A:蛋白互作网络显示PP2Acα通过INTS5、POLR2B与WTAP建立联系;B:WTAP蛋白的氨基酸序列中存在大量磷酸化位点。
图5 探究PP2Acα与WTAP二者之间的联系
Figure 5 Explore the relationship between PP2ACα and WTAP
(matrix metallopeptidase 7,MMP7)和基质金属蛋白 测,抑制 PP2Acɑ促进胃癌细胞的恶性表型,可能是
酶28(matrix metallopeptidase 7,MMP28)的表达来增 通过上调WTAP的表达水平实现的。
强胆管癌的侵袭性 [21] 。所以,WTAP 的表达水平与 为了探究PP2Acɑ与WTAP之间的调控关系,笔
胃癌进展的关系也是值得深入研究的,但目前仅有 者首先通过蛋白互作功能富集分析网站 STRING,
生物信息学文章支持WTAP的高表达与胃癌进展相 查询这两种蛋白之间的联系。发现 PP2Acɑ通过
关,相关的基础实验仍然缺乏。 INTS5、POLR2B与WTAP建立联系。但是数据库显
因此,本研究初步探究了PP2Acɑ失调与胃癌进 示的证据不足以明确 PP2Acɑ通过 INTS5、POLR2B
展的联系,以及在这一过程中 WTAP 表达水平的变 调控 WTAP 的表达或功能。为了明确 PP2Acɑ与
化。本研究中,通过慢病毒介导的shRNA抑制胃癌 WTAP 之间的调控关系,笔者又通过 Phosphosite 网
细胞中PP2Acɑ的表达,随后进行的细胞体外实验表 站查询 WTAP 的磷酸化修饰情况,发现 WTAP 的氨
明,胃癌细胞的形态出现EMT典型特征,并且增殖、 基酸序列存在大量磷酸化位点。这表明WTAP的功
迁移与侵袭能力均得到增强;裸鼠层面的活体实 能会受到磷酸化修饰的影响,而磷酸化修饰往往伴
验,也证明了抑制 PP2Acɑ可以促进胃癌细胞的增 随蛋白质稳定性的改变,最终导致蛋白总量的变
殖;RT⁃qPCR、WB实验表明,WTAP的mRNA与蛋白 化。PP2Acɑ对于体内磷酸化稳态的维持必不可少,
水平均显著升高。基于上述讨论及实验结果,推 其表达失调会对蛋白的表达和功能产生重要影响,