Page 130 - 南京医科大学学报自然科学版

第42卷第5期
·726 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2022年5月

出的可疑菌株进行革兰氏染色，镜检为革兰氏阴性
杆菌或球杆菌的菌株（图 1），纯化培养后进行生化
鉴定，共鉴定出186株小肠结肠炎耶尔森菌，分离率
为2.91%。其中59株菌分离自腹泻患者，43株菌来
自猪，22株菌分离自狗粪便，25株菌来自羊粪，14株
菌分离自牛粪，11株菌分离自鸡粪，6株菌分离自食
品，6株菌从苍蝇中分离到（表1）。

2.3 毒力基因分析
二 代 测 序 原 始 下 机 数 据 导 入 CLC genomics
workbench V20.0.4 软件，经过滤后 Clean data 在 NC⁃ 图1 小肠结肠炎耶尔森菌江苏分离株革兰氏染色镜检图
BI 数据库中比对 5 个主要毒力基因（ail、ystA、ystB、
Figure 1 Gram stain microscope image of Yersinia entero⁃
yadA、virF）。国内常见的毒力基因型为Ⅰ型（ail+、 colitica strain isolated from Jiangsu Province
ystA+、ystB⁃、yadA+、virF+）；Ⅱ型（ail+、ystA+、ystB⁃、
yadA⁃、virF⁃）；Ⅲ型（ail⁃、ystA⁃、ystB+、yadA⁃、virF⁃）； 的分支有10个（图2）。
Ⅳ型（ail⁃、ystA⁃、ystB⁃、yadA⁃、virF⁃）。通过全基因组
3 讨 论
扫描发现4种毒力基因型均有，Ⅲ型较多（119/186，
63.98%），其次为Ⅳ型（46/186，24.73%）。人源株中只 小肠结肠炎耶尔森菌是一种可通过食物进行传
有Ⅲ型和Ⅳ型，其中Ⅲ型为主（50/59，84.75%）（表2）。 播的人兽共患病病原菌，本研究显示2016—2019年
2.4 MLST聚类分析 江苏省监测标本小肠结肠炎耶尔森菌分离率为
测序数据上传 pub⁃MLST 数据库定义菌株的 2.91%，而2010—2013年江苏菌株分离率为3.77% ，
［11］
7 个等位基因及ST型，每个等位基因的匹配度均为 该结果表明随着人民生活水平的提高及疾病防控
100%。结果显示186株菌被分为81个ST型，菌株最 意识的加强，江苏地区小肠结肠炎耶尔森菌流行强
多的3个ST型为别为ST429（21株）、ST157（11株）、 度可能出现一定程度的下降。国内其他地区小肠
ST404（9 株）。患者分离株有 32 个 ST 型，其中最 结肠炎耶尔森菌分离率差异较大，安徽省六安市
多的 3 个 ST 型为 ST17（6 株）、ST178（6 株）和 ST157 2015—2018 年监测结果显示当地小肠结肠炎耶尔
（5 株）。所有 ST 型聚类图显示，ST3 型处于中心位 森菌分离率高达 12.22% ［12］ ；河南省 2011—2017 年
置，从 ST3 型分出 19 个亚型或分支，存在人源 ST 型 分离率则为3.06% ［13］ ，与本研究结果较为接近。

表1 小肠结肠炎耶尔森菌不同来源标本分离情况
Table 1 The table of Yersinia enterocolitic strains isolated from different sources
年份 腹泻患者 猪 牛 羊 鸡 狗 苍蝇 生肉 熟肉 合计

2016 采样数 0400 169 86 169 87 169 100 200 200 1 580
分离数 0017 13 1 12 4 14 2 1 2 70
分离率（%） 04.25 7.69 1.16 7.10 4.60 8.28 2.00 0.50 1.00 4.43
2017 采样数 0400 164 80 160 140 160 100 200 200 1 604
分离数 000.9 9 0 1 2 1 2 0 0 24
分离率（%） 02.25 5.49 0 0.63 1.43 0.63 2.00 0 0 1.50
2018 采样数 0 458 164 82 164 124 122 100 200 200 1 614
分离数 0018 10 4 10 3 4 0 0 0 49
分离率（%） 03.93 6.10 4.88 6.10 2.42 3.28 0 0 0 3.04

2019 采样数 0400 160 80 160 140 160 100 200 200 1 600
分离数 0015 11 9 2 2 3 2 2 1 48
分离率（%） 03.75 6.88 11.25 1.25 1.43 1.88 2.00 1.00 0.50 3.00
合计 采样数 1 658 657 328 653 491 611 400 800 800 6 398
分离数 0059 43 14 25 11 22 6 3 3 186
分离率（%） 03.55 6.54 4.27 3.83 2.24 3.60 1.50 0.38 0.38 2.91