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第42卷第7期             陈晓超,卜恒涛,梁 超,等. m5C甲基化相关基因预测肾透明细胞癌的预后[J].
                  2022年7月                     南京医科大学学报(自然科学版),2022,42(7):983-993                        ·987 ·


                据集中k在2~10之间变化时,k=2被认为是合适的聚                        透明细胞癌的临床病理特征,应用热图来显示分期
                类数(图2C)。然后,根据生存参数将肾透明细胞癌                          的显著差异(P < 0.05)。而其他特征,如TNM分类、
                样本分为两个亚群,可见亚群1中肾透明细胞癌患者                           性别、年龄和临床分级等无显著差异(图2E)。从而,
                的总生存期(overall survival,OS)较亚群 2 缩短(P <            我们可以得出结论,13个m5C甲基化相关基因的表
                0.001,图2D)。此外,为了更好地预测这两个亚群肾                       达特征与肾透明细胞癌患者的分期有关。


                A                                                B
                   1.0                                                 1.2

                   0.8                                                 1.0

                   0.6                                                 0.8
                  CDF                            2                   CDF曲线下面积的相对变化  0.6

                   0.4                           3
                                                 4
                                                 5                     0.4
                                                 6
                   0.2                           7
                                                 8
                                                 9                     0.2
                    0
                                                                        0
                      0     0.2   0.4   0.6  0.8   1.0                    2   3   4   5   6    7   8   9
                                  一致性系数                                                 k
                C                                       E
                                                                                                      cluster  cluster
                   2                                                                                  N   10  cluster1
                                                                                                      M     cluster2
                                                                                                      T
                   3                                                                                    **
                                                                                                      stage  5  N
                                                                                                      grade  N0
                   4                                                                                  gender  N1
                                                                                                      age  0  N2
                                                                                                      fustat
                   5
                                                                                                           M
                  k
                                                                                                     NSUN4 -5  M0
                   6                                                                                        M1
                                                                                                     NSUN3  T
                   7                                                                                      -10
                                                                                                            T1
                                                                                                            T2
                   8                                                                                 TET2
                                                                                                            T3
                   9                                                                                 TRDMT1  Stage
                                                                                                            StageⅠ
                                                                                                            StageⅡ
                                  样本                                                                 NSUN7  StageⅢ
                                                                                                            StageⅣ
                D
                                                                                                     NSUN2
                                                                                                           grade
                                                                                                            G1
                  1.0                           cluster 1
                                                                                                     DNMT1  G2
                                                cluster 2                                                   G3
                                                                                                            G4
                  0.8
                                                                                                     ALYREF
                                                                                                           gender
                                                                                                            female
                                                                                                     NOP2
                  0.6
                  生存率                                                                                NSUN5  age male
                  0.4
                                                                                                            ≤65 y
                                                                                                            >65 y
                                                                                                     DNMT3B
                  0.2                                                                                      fustat
                          P < 0.001                                                                         aive
                                                                                                     NSUN6  death
                    0
                      0     2     4     6     8    10                                                DNMT3A
                                  时间(年)
                   A、B:共识聚类累积分布函数(CDF)和CDF曲线下区域的相对变化,从k=2到k=9;C:肾透明细胞癌的样本追踪图:D:通过Kaplan⁃Meier 方
                法对两个亚群进行生存分析;E:根据临床病理参数分组的患者中13个m5C甲基化相关基因的表达热图;两组比较,P < 0.01。
                                                                                              **
                                         图2 共识聚类分析显示肾透明细胞癌两个亚群的预后差异
                Figure 2 Consensus clustering analysis revealed prognostic differences between two subgroups of clear cell renal cell carcinoma
   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96