Page 93 - 南京医科大学学报自然科学版
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第42卷第7期 陈晓超,卜恒涛,梁 超,等. m5C甲基化相关基因预测肾透明细胞癌的预后[J].
2022年7月 南京医科大学学报(自然科学版),2022,42(7):983-993 ·989 ·
A P值 HR(95%CI) B 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 4 3 3 3 0
NSUN2 0.002 1.083(1.030~1.140)
NSUN7 0.379 0.943(0.826~1.075) 12.9
TRDMT1 0.001 0.435(0.263~0.719)
NSUN6 < 0.001 1.300(1.161~1.455)
12.8
NSUN4 0.015 0.799(0.666~0.957)
NSUN3 0.090 0.760(0.554~1.044) 12.7
NSUN5 < 0.001 1.142(1.081~1.206)
DNMT3A 0.016 1.198(1.034~1.389) 部分似然偏差值 12.6
TET2 < 0.001 0.697(0.563~0.864)
DNMT1 0.004 1.142(1.044~1.250)
DNMT3B < 0.001 1.335(1.191~1.497) 12.5
NOP2 0.140 1.031(0.990~1.073)
ALYREF 0.337 1.008(0.991~1.026) 12.4
0.25 0.35 0.50 0.71 1.00 1.41
12.3
HR
-6 -5 -4 -3 -2
C 9 8 8 8 0 D log2λ
4
0.2
9
1.0 高风险组
低风险组
8
5
1 0.8
0 6
系数 3 0.6
-0.2 2 生存率 0.4
-0.4 0.2
P < 0.001
7 0
-6 -5 -4 -3 -2 0 2 4 6 8 10
log2λ 时间(年)
E
Risk
N Risk
M ** high
T * 10 low
stage N
grade ** 5 N0 grade
gender N1 G1
age 0 N2 G2
fustat M G3
-5 M0 G4
M1 gender
NSUN6 -10 female
T
male
T1
TET2 T2 age
T3
≤65 y
stage >65 y
NSUN5 StageⅠ fustat
StageⅡ aive
StageⅢ death
DNMT3B StageⅣ
F G
P值 HR(95%CI) P值 HR(95%CI)
年龄 < 0.001 1.030(1.017~1.044) 年龄 < 0.001 1.034(1.018~1.049)
性别 0.700 0.938(0.679~1.297) 性别 0.999 1.000(0.716~1.397)
分级 < 0.001 2.302(1.858~2.851) 分级 < 0.001 1.549(1.218~1.968)
分期 < 0.001 1.926(1.678~2.209) 分期 0.027 1.689(1.062~2.689)
T < 0.001 1.987(1.674~2.357) T 0.664 0.910(0.595~1.392)
M < 0.001 4.388(3.178~6.060) M 0.269 1.538(0.717~3.298)
N < 0.001 1.856(1.528~2.255) N 0.174 0.832(0.638~1.085)
0.5 1.0 2.0 4.0 0.5 1.0 2.0
HR HR
A:单变量Cox回归分析结果显示了13个m5C甲基化相关基因的P值和风险比(HR)以及置信区间(CI);B、C:Lasso⁃Cox回归分析显示了4个
选定的m5C甲基化相关基因(NSUN5、NSUN6、DNMT3B、TET2)的系数;D:Kaplan⁃Meier总体生存分析将TCGA肾透明细胞癌队列的分为高风险组
和低风险组,然后进行风险评分;E:高风险组和低风险组在T、M分期和分级方面存在差异,P < 0.01;F、G:单变量和多变量Cox回归分析揭示了可
**
能的独立预后因素。
图3 4种m5C甲基化相关基因所构建的生存预后模型
Figure 3 A survival prognostic model constructed by four m5C methylation⁃related genes