Page 85 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 85

第42卷第8期     陈柔柔,李     娜,赫荣波,等. 新诊断2型糖尿病合并高尿酸血症患者的临床特征及肠道菌群变化[J].
                  2022年8月                  南京医科大学学报(自然科学版),2022,42(08):1125-1132,1141                   ·1127 ·


                者仅单用二甲双胍;病史>5年的患者为单用二甲双                           指数、goods_coverage指数和ACE指数进行统计。
                胍或二甲双胍联合基础胰岛素,未用降尿酸、调脂                                β多样性分析:基于 Weighted Unifrac 距离以及
                药物及利尿剂等。                                          Unweighted Unifrac 距离可进行 PCoA(Principal Co-
                    健康对照组:年龄 18~80 岁;血糖正常,无糖尿                     ordinates Analysis)分析 [10] ,选择贡献率最大的主坐
                病家族史;正常嘌呤饮食状态下,尿酸正常;近 3 个                         标的组合作图后进行展示。若样本距离越接近,则
                月内未服用微生态制剂或抗生素;近 1 个月内无腹                          表示物种的组成结构越相似。
                泻及其他胃肠道的疾病史,无胃肠道手术史;无长                                OTU差异显著性分析:LDA EffectSize(LEfSe)作
                                                                                                           [11]
                期服用药物史。                                           为发现和解释高维度的生物标识分析工具之一 ,可
                    排除标准:近 3 个月内服用微生态制剂或抗生                        在组与组间寻找出组间的差异显著物种,本研究用
                素者;有腹泻及其他胃肠道的疾病史;长期酗酒、大                           LDA值柱状分布图及进化分支图来显示。
                量进食动物内脏及海产品等习惯的患者;严重心                             1.3  统计学方法
                脑、肝肾功能障碍;1 型或其他类型糖尿病;长期使                              采用 SPSS23.0 的统计学软件对本实验的数据
                用的药物不符合入组标准。                                      进行统计分析。对正态分布计量资料的数据采用

                1.2  方法                                           均数±标准差(x ± s)描述,两组间比较用独立t 检验
                1.2.1 一般资料及样本收集                                   计算,两组以上用方差分析,对于方差不齐的数据
                    患者临床信息采集主要通过随访问卷、医院信                          采用 Wilcoxon 秩和检验,组间两两比较采用 Tukey⁃
                息系统等多种途径获取患者的基本信息、临床检验                            HSD 检验。通过 Qimme 软件分析 Beta 多样性。分
                结果和临床特征。采集研究对象清晨排便后的新                             组样品的物种组成、群落结构进行差异显著性检验
                鲜粪便标本约 5 g,置于密闭无菌粪便采集盒内,分                         采用的是 T⁃test、LEfSe、MetaStat 等统计学分析方
                别编号。所有粪便采集盒的管壁及管帽上均标注                             法。P<0.05 为差异有统计学意义。
                患者的姓名、编码等基本信息(油性笔做好标记),
                                                                  2  结 果
                并于 30 min 内迅速储存于-80 ℃低温冰箱中,避免
                反复冻溶。                                             2.1  临床特征比较
                1.2.2 粪便16S rRNA基因测序                                  比较 98 例 T2DM 合并 HUA 患者不同糖尿病病
                    粪便样本基因组DNA的提取采用SDS方法,并                        程(病程<1 年、1~5 年和>5 年)的临床特征,结果显
                进一步使用琼脂糖凝胶电泳法检测 DNA 纯度及浓                          示,不同病程患者的年龄、低密度脂蛋白、并发症发
                度,随后将适量的样品放置在离心管中,用无菌水                            生率差异有统计学意义(P < 0.05)。新诊断 T2DM
                稀释样品至1 ng/μL。选择所需进行测序的区域,采                        合并 HUA 组(病程<1 年)比病程大于 5 年组的低密
                用带 Barcode 特异性引物,16S V3⁃V4 区的引物为                  度脂蛋白显著升高(P < 0.05),年龄及并发症发病率
                341F: CCTAYGGGRBGCASCAG; 806R: GGAC⁃              显著降低(P < 0.05,表1)。
                TACNNGGGTATCT AAT,进一步对细菌的 16S rD⁃                     比较新诊断 T2DM 合并 HUA 与单纯新诊断
                NA V3⁃V4区进行PCR扩增。根据PCR 产物浓度进                      T2DM患者的临床特征,结果显示新诊断T2DM合并
                一步进行等浓度的混样,并充分混合均匀,选取 1×                          HUA 组的糖化血红蛋白水平显著降低(P < 0.05),
                TAE 浓度 2%琼脂糖胶电泳进行纯化 PCR 的产物,                      而总胆固醇、甘油三酯、胰岛素、C 肽水平、血清尿
                主带大小选择在450~550 bp之间的序列,并予割胶                       酸、空腹葡萄糖、动脉硬化指数及脂肪肝发生率显
                回收目标条带。文库的构建采用美国Illumina 公司                       著升高(P < 0.05,表2)。
                的TruSeq DNA PCR⁃Free Library Preparation Kit 建库   2.2  DMUA组与T2DM组、HUA组及Control组的肠
                试剂盒。经过 Qubit 的定量及文库检测后,将构建                        道菌群分析
                好的符合后续测序要求的文库用NovaSeq6000进一                       2.2.1 临床资料比较
                步行上机测序。测序所获得的信息通过优化序列区                                4组研究对象的年龄、性别、体重指数(BMI)、转
                分样本后进行OTU聚类和物种的分类分析。                              氨酶无明显差异(P > 0.05)。DMUA 组与T2DM 组、
                1.2.3 OTU聚类和物种分类分析                                HUA 组及 Control 组相比,高密度脂蛋白降低,甘油
                    α多样性分析:主要用于分析组内微生物群落的                         三酯显著增高(P < 0.05)。DMUA 组与 T2DM 组、
                      [9]
                多样性 。本研究采用了chao1 指数、PD_whole_tree                 HUA 组相比,其动脉硬化指数亦明显升高(P <
   80   81   82   83   84   85   86   87   88   89   90