Page 75 - 南京医科大学学报自然科学版
P. 75
第43卷第10期 吴 鑫,音海玲,殷 倩,等. 选择性磁珠纯化法结合高通量测序技术在无创产前筛查中的
2023年10月 应用[J]. 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(10):1398-1401,1426 ·1401 ·
异常的风险。它的临床应用大大降低了侵入性产 带来的焦虑情绪,缩短了检测周转时间(turn⁃around
前诊断率。但由于本身 cffDNA 释放至母体外周血 time,TAT),提高了检测效率,有助于临床及时召回
液循环中含量较少,NIPT 检测时孕周范围多为孕 高风险病例。
12~20 周,因此由于母体血浆中 cffDNA 浓度达不到 对两组样本的高通量测序质控数据进行比较
NIPT 检测质控要求而重复采血的情况并不少见。 发现,游离DNA的GC比率无统计学差异,测序质量
有研究报道,不同检测平台 NIPT 初次检测失败率 指标Q30分别为传统纯化法组(97.05±0.49)%、片段
为 1%~8% ,目前对于初次 NIPT 失败病例则通常 选择富集法组(96.98±0.42)%,两组间差异无统计学
[8]
建议再次抽血,而再次抽血检测的成功率仍仅约为 意义。说明在样本制备环节,采用片段选择富集法
50%~60% 。所以如何高效富集母体外周血液中 不会对高通量测序的质量指标的稳定性产生影响。
[9]
cffDNA 以最大程度降低 NIPT 检测过程中的假阴性 根据胎儿产前诊断及分娩结局的随访,对NIPT
率和假阳性率,减轻孕妇家庭及社会负担是当前迫 筛查准确性进行比较,应用片段选择富集法前后,
切需要解决的问题。 胎儿目标染色体异常的阳性检出率并无显著差异
对孕妇血浆中不同类型 DNA 片段的分子特征 (0.36% vs. 0.32%),21 三体、18 三体和 13 三体的阳
研究提示,孕妇血浆中母源DNA 比cffDNA 片段长; 性预测值均无显著性差异。而两组均发生1例染色
孕妇血浆中游离DNA长度范围约在105~798 bp,而 体异常漏诊(0.02% vs. 0.01%,P=0.49)。由此提示,
cffDNA 长度范围约在 107~313 bp,其中< 193 bp 的 采用新的片段选择富集法在富集cffDNA的同时,并
约占 80% 。对短片段的游离 DNA 进行区分并纯 不会导致富集DNA质量的下降,也未影响染色体异
[3]
化是富集提取cffDNA的方法之一。 常识别的准确性。
磁珠法为常用的核酸纯化方法,磁珠法进行核 综上所述,本研究表明采用羧基化修饰的具有
酸纯化主要分为两类,其一为无差别的吸附和回 DNA 片段选择能力的纳米分选磁珠富集 cffDNA,
收,主要用于核酸的纯化和浓缩,其二为通过特殊 可以对短片段 cffDNA 进行有效富集,且不影响后
手段修饰磁珠以特异性吸附目的核酸。研究发现, 续高通量测序的稳定性,从而可以减少因 cffDNA
将纳米磁珠进行羧基化修饰后,控制纳米磁珠与样 浓度过低导致的重采血,提高检测效率。该法在保
本 DNA 的配比在特定范围区间时,可以分步骤,先 证cffDNA产物提取质量的同时,并不影响目标染色
特异性吸附长片段的游离核酸,再特异性吸附短片 体疾病的阳性预测值。
段的游离核酸,从而到达分离、纯化、富集cffDNA的 [参考文献]
目的 [4,6] ,有文献报道,采用该方法富集小片段 DNA
[1] 徐贵江,李 茜,张 坡,等. 基于高通量测序的无创产
[7]
可以将cffDNA浓度提高1倍以上 。
前诊断研究[J]. 中国优生与遗传杂志,2018,26(12):
本研究从 2020 年 5 月开始,采用羧基化修饰
40-43
的具有 DNA 片段选择能力的纳米分选磁珠富集 [2] LO Y M,TEIN M S,LAU T K,et al. Quantitative analysis
cffDNA 用于 NIPT 筛查。按照是否使用该技术将病 of fetal DNA in maternal plasma and serum:implications
例分为传统纯化法组和片段选择富集法组,通过比 for noninvasive prenatal diagnosis[J]. Am J Hum Genet,
较发现,两组提取的 cffDNA 浓度分别为(341.59± 1998,62(4):768-775
93.92)nmol/L和(252.52±120.76)nmol/L(P < 0.001)。 [3] ALLEN C K C,ZHANG J,HUI A B Y,et al. Size distribu⁃
分析原因,可能与两组 DNA 片段长度有关,片段选 tions of maternal and fetal DNA in maternal plasma[J].
择富集后血浆 DNA 提取产物中以短片段 DNA 为 Clin Chem,2004,50(1):88-92
[4] 刘 莹,程 立,张 博. 基于新型磁分离技术的高分
主,其绝对质量相对较低,所以浓度也低。
辨率 DNA 片段筛选技术[J]. 生物技术通报,2021,37
通过比较还发现,采用传统纯化法期间,因
(10):257-265
cffDNA 浓度过低导致的复检抽血率为 0.56%,与文
[5] ZHANG B,ZHAO S T,WAN H,et al. High⁃resolution
献报道的0.47%~0.50%接近 [8,10] ,采用新的片段选择
DNA size enrichment using a magnetic nano ⁃ platform
富集法以后,因cffDNA浓度过低导致的复检抽血率 and application in non⁃invasive prenatal testing[J]. Anal,
降低到 0.01%,与传统纯化法的差异有统计学意义 2020,145(17):5733-5739
(P < 0.001)。DNA 片段选择性磁珠纯化法,通过富 [6] 张介中,李珊珊,玄兆伶,等. 一种具有片段选择性纯化
集孕妇血浆样本中的cffDNA,减少了孕妇再次抽血 (下转第1426页)