Page 78 - 南京医科大学学报自然科学版

第43卷第10期
·1404 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年10月

表2 ddPCR和PCR/CE分析SMN1第7号外显子拷贝数
ddPCR和PCR/CE结果（n） 灵敏度 特异度
MLPA结果
1拷贝（n=107） 2拷贝（n=355） 3拷贝（n=53） 4拷贝（n=1） （%） （%）
1拷贝（n=107） 107 000 000 0 100.0 100.0
2拷贝（n=355） 000 355 000 0 100.0 100.0
3拷贝（n=53） 000 000 053 0 100.0 100.0
4拷贝（n=1） 000 000 000 1 100.0 100.0
Kappa系数=1.000，P < 0.001。

在这4种方法中，只有ddPCR不包含针对SMN1 度和特异度分别为100.0%和99.5%。检测2拷贝的
第 8 号外显子的特定引物。针对 SMN1 第 8 号外显 灵敏度和特异度分别为99.4%和100.0%，检测>2拷
子，MLPA 结果显示，101 个样本被归类为杂合性缺 贝 的 灵 敏 度 和 特 异 度 分 别 为 100.0% 和 100.0%
失（SMN1 第 8 号外显子单拷贝），415 个为正常 （表 3）。相比之下，PCR/CE 检测 SMN1 第 8 号外显
（SMN1 第 8 号外显子≥2 拷贝）。与 MLPA 结果相 子的结果与 MLPA 的结果一致，其灵敏度和特异度
比，HRM 检测单拷贝的 SMN1 第 8 号外显子的灵敏 均为100.0%。

表3 HRM分析SMN1第8号外显子拷贝数
HRM结果（n） 灵敏度 特异度
MLPA结果
1拷贝（n=103） 2拷贝（n=348） > 2拷贝（n=65） （%） （%）
1拷贝（n=101） 101 000 00 100.0 099.5
2拷贝（n=350） 002 348 00 099.4 100.0
> 2拷贝（n=65） 000 000 65 100.0 100.0
Kappa系数=0.992，P < 0.001。

此 外 ，MLPA 和 PCR/CE 分 析 可 以 同 时 检 测 PCR/CE检测的结果与MLPA一致，灵敏度和特异度
SMN1和SMN2。针对SMN2第7号和第8号外显子， 均为100.0%（表4、5）。

表4 PCR/CE分析SMN2第7号外显子拷贝数
PCR/CE结果（n） 灵敏度 特异度
MLPA结果
1拷贝（n=103） 2拷贝（n=347） 3拷贝（n=65） >3拷贝（n=1） （%） （%）
1拷贝（n=103） 103 000 00 0 100.0 100.0
2拷贝（n=347） 000 347 00 0 100.0 100.0
3拷贝（n=65） 000 000 65 0 100.0 100.0
> 3拷贝（n=1） 000 000 00 1 100.0 100.0
Kappa系数=1.000，P < 0.001。

表5 PCR/CE分析SMN2第8号外显子拷贝数
PCR/CE结果（n）
灵敏度 特异度
MLPA结果 0拷贝 1拷贝 2拷贝 3拷贝 >3拷贝
（%） （%）
（n=20） （n=159） （n=287） （n=48） （n=2）
0拷贝（n=20） 20 000 000 0 0 100.0 100.0
1拷贝（n=159） 00 159 000 0 0 100.0 100.0
2拷贝（n=287） 00 000 287 0 0 100.0 100.0
3拷贝（n=48） 00 000 000 48 0 100.0 100.0
> 3拷贝（n=2） 00 000 000 0 2 100.0 100.0
Kappa系数=1.000，P < 0.001。

2.2 4种方法的比较 只能检测SMN1第7号外显子，HRM含有针对SMN1

表6总结了4种方法的各种特点。其中，ddPCR 第 7 号外显子和第 8 号外显子的探针，而 MLPA 和