Page 17 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第11期 颜 凤,邱佳韵,庄丽丽,等. 转录因子STAT1对癌症相关基因Gas6的调控研究[J].
2023年11月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(11):1487-1493 ·1489 ·
1450 作为模板构建 STAT1 结合位点突变的启动子 1.2.5 双萤光素酶报告基因实验
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重组质粒,将其命名为 pGas6⁃1450 mut1、pGas6⁃ 在96孔板中培养HEK⁃293T细胞(1×10 个/孔),
1450 mut2、pGas6⁃1450 mut1+2(合称为 pGas6⁃1450 24 h 后将待测质粒(100 ng)pGas6⁃1450 或 pGas6⁃
mut)并测序鉴定,突变序列见图1。 1450 mut与pRL⁃TK质粒(4 ng)共同转染至细胞中,
原始序列⁃821 5′⁃GCAAAGAGAAACTG. . . . . .ATAAAAGGAAACCG⁃3′ ⁃414
突变序列⁃821 5′⁃GCAAAGAGGAACTG. . . . . .ATAAAAGGGAACCG⁃3′ ⁃414
mut1 mut2
图1 突变序列
Figure 1 The mutated sequences
再培养24 h后检测启动子活性;将待测质粒和siRNA 表3 qRT⁃PCR引物序列
50 nmol/L或过表达质粒(100 ng)与 pRL⁃TK 质粒共 Table 3 Sequences of qRT⁃PCR primers
同转染至细胞,检测敲低或过表达STAT1对启动子 名称 序列(5′→3′)
活性的影响;使用荧光光度计和双萤光素酶检测试 STAT1 上游:AGTCCAGCTTCTGCTTACCC
下游:CTGAACGTGGCGAGAGTCAT
剂盒检测启动子活性,启动子活性统一标准化为
Gas6 上游:TGGCATGTGGCAGACAATCT
pRL⁃TK的活性。结果重复3次及以上,siRNA序列见
下游:ATACCTCCCACGGTCAGGTT
表2。
GAPDH 上游:GAGTCAACGGATTTGGTCGT
表2 siRNA序列 下游:TTGATTTTGGAGGGATCTCG
Table 2 Sequences of siRNA
siRNA 序列(5′→3′) 摇床孵育一抗10~12 h,TBST洗膜3次(20 min/次),室
siSTAT1 正义链:CCUCCAUCCUUUGGUACAATT 温摇床孵育二抗1 h,再洗膜后曝光显影。完成第一
反义链:UUGUACCAAAGGAUGGAGGTT 次化学发光检测后分别用蒸馏水、一抗二抗去除
siNC 正义链:UUCUCCGAACGUGUCACGUTT 液、蒸馏水各漂洗 5 min 后进行封闭等后续操作以
反义链:ACGUGACACGUUCGGAGAATT
完成第二次化学发光检测。该实验以GAPDH 作为
1.2.6 实时荧光定量PCR(qRT⁃PCR) 内参并重复3次以上。
在12孔板中培养HEK⁃293T细胞(1×10 个/孔)。 1.3 统计学方法
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24 h 后将 siRNA、过表达质粒和其对照试剂转染至 应用 GraphPad Prism6 与 SPSS 25.0 软件对实验
细胞中,再培养24 h后检测敲低和过表达STAT1对 数据进行统计分析。实验结果以均数±标准差(x ± s)
Gas6 mRNA 表达的影响。使用 Omega RNA 提取试 表示,两组间比较采用t检验。P<0.05为差异有统
剂盒提取细胞总 RNA,再将其均逆转录为第 1 链 计学意义。
cDNA,并 进 行 qRT⁃PCR 实 验(反 应 条 件 :95 ℃
2 结 果
10 min ;95 ℃ 15 s、60 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s ,循 环
40 次;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,95 ℃ 15 s)。该实验 2.1 生信分析
以 GAPDH 作为内参进行 3 次以上,并以 2 -ΔΔCt 评估 应用GEO数据库分析得出乳腺癌的高表达(红
mRNA相对表达水平,相关引物序列见表3。 色)及低表达(绿色)基因(图2A),其中Gas6属于高
1.2.7 Western blot实验 表达基因(图 2B);应用 PROMO 数据库和 JASPAR
在6孔板中培养HEK⁃293T 细胞(2×10 个/孔), 数据库预测出转录因子 STAT1 与 Gas6 启动子有多
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24 h 后将 siRNA、过表达质粒和其对照试剂转染至 个结合位点,以此设计了两个突变位点使Gas6不能
细胞中,再培养48 h 后使用总蛋白提取试剂盒提取 与相应转录因子结合;应 用 GEPIA 数据库分析
细胞总蛋白,加入适量上样缓冲液后 100 ℃煮沸 STAT1 和 Gas6 在多种癌症中的相关性,结果表明
10 min。制备 10% SDS⁃PAGE 凝胶,加样、电泳(电 STAT1 与 Gas6 在多种癌症中有正相关趋势(P 均<
泳条件:80 V,30 min;150 V,40 min)并在快速转膜液 0.05,图2C~E)。
中(转膜条件:常温恒流400 mA,30 min)将蛋白转至 2.2 转录因子STAT1与Gas6启动子结合
PVDF膜,用快速封闭液室温摇床封闭30 min后4 ℃ 为探究 STAT1 是否与 Gas6 启动子结合,使用