Page 16 - 南京医科大学学报自然科学版
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第43卷第11期
·1488 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2023年11月
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期,不良反应较大,复发率较高 。因此,有必要探 1.2 方法
究影响癌症进展的潜在分子机制,并以此提供新的 1.2.1 生信分析
诊疗方法。 用 GEO 数 据 库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
生长抑制特异性基因6(growth arrest specific 6, gds 和 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles)预测
Gas6)编码一种可与受体酪氨酸激酶Axl、Mer和Tyro3 乳腺癌的高表达及低表达基因聚类分析结果;用
结合的维生素 K 依赖性分泌型蛋白。细胞因子 PROMO 数 据 库(http://alggen.lsi.upc.es/cgi ⁃ bin/pro⁃
Gas6 通过与 TAM(Tyro3⁃Axl⁃Mer)受体结合激活下 mo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3)和JASPAR
游信号通路(如PI3K、PLCγ、ERK和NF⁃κB)以调节细 数据库(https://jaspar.genereg.net)预测 Gas6 启动子
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胞存活、增殖、分化、迁移、黏附和凋亡 。研究表明, 的转录因子结合位点;用 GEPIA 数据库(http://ge⁃
Gas6通过诱导肿瘤相关巨噬细胞转化为免疫抑制的 pia.cancer⁃pku.cn)预测Gas6和STAT1在多种癌症中
M2 样表型促进癌症进展 [9-10] ,这些肿瘤包括乳腺癌、 的相关性。
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肺癌 、骨肉瘤、肝癌和肾细胞癌等,并且Gas6/Axl的 1.2.2 细胞培养
表达水平与乳腺癌的不良临床结局相关 。 在37 ℃、5% CO2培养箱中将HEK⁃293T 细胞置
[9]
据此,本研究通过染色质免疫沉淀(chromatin 于含 1%青链霉素双抗和 10%胎牛血清的 DMEM 高
immunoprecipitation,ChIP)实验检测信号转导和转 糖培养基中培养,2~3 d换液1次,细胞密度为85%~
录激活因子 1(signal transducer and activator of tran⁃ 100%时传代或冻存,均使用对数期生长细胞。
scription 1,STAT1)是否与Gas6启动子结合,将含人 1.2.3 ChIP实验
Gas6 启动子或 STAT1 结合位点突变的 Gas6 启动子 使用 ChIP 试剂盒,依据其说明书进行相关实
的萤光素酶报告质粒转染至 HEK⁃293T 细胞,同时 验及分析。在 1%甲醛中固定 HEK⁃293T 细胞约
敲低或过表达转录因子 STAT1,应用双萤光素酶报 10 min,充分裂解细胞,超声剪切基因组 DNA 为
告基因系统检测Gas6启动子的活性变化。在HEK⁃ 200~800 bp大小(去除交联并进行琼脂糖凝胶电泳观
293T细胞中敲低或过表达转录因子STAT1,应用实 察DNA大小)。将合格样品分别进行特异性免疫沉
时荧光定量 PCR 和蛋白质免疫印迹技术分别检测 淀并去除交联,选择相应引物进行 qRT⁃PCR 或
Gas6 mRNA 和蛋白表达。本研究探讨了转录因子 PCR,进行琼脂糖凝胶电泳实验并观察结果,相关引
STAT1对癌症相关基因Gas6的调控,为阐明Gas6在 物见表1。
癌症中的作用和机制奠定了基础。 表1 PCR引物序列
1 材料和方法 Table 1 Sequences of PCR primers
名称 序列(5′→3′)
1.1 材料 Gas6⁃1 上游:CCCACTTTCAAACCAGTGACCT
人胚肾细胞(HEK⁃293T)、pRL⁃TK(海肾萤光素 下游:CTCAGCAGGCTCAACGCTTA
酶报告质粒)为本实验室保存;DMEM培养基(Gibco Gas6⁃2 上游:TGGTCTCTGAAGACAAGCACA
公司,美国);含 Gas6 启动子及点突变的 Gas6 启 下游:CGAGTGAAATGCGACGGTTT
动子的萤光素酶报告质粒、STAT1 过表达质粒 GAPDH 上游:TACTAGCGGTTTTACGGGCG
下游:TCGAACAGGAGGAGCAGAGAGCGA
pENTER⁃STAT1 及 pENTER、引物、STAT1 的小干扰
RNA(small interfering RNA,siRNA)siSTAT1 及 siNC 1.2.4 萤光素酶报告基因重组质粒的构建与鉴定
(南京擎科生物科技有限公司);SDS⁃PAGE 凝胶配 应用美国国立生物技术信息中心数据库 NCBI
制试剂盒、Western blot 一抗二抗去除液(强碱性)、 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene)查 询 人 Gas6 基
ChIP检测试剂盒(上海碧云天生物技术有限公司); 因(GenBank 编号:NC_000013.11)转录起始位点
RNA 提取试剂盒、去内毒素小量质粒提取试剂盒 (transcription start site,TSS)上游1 400 bp、下游50 bp
(Omega公司,美国);双萤光素酶报告基因检测试剂 的片段序列。将人 Gas6 基因的转录起始位点碱
盒(Promega 公司,美国);Gas6、GAPDH、STAT1 一 基 编 号 为 + 1。 将 人 Gas6 启 动 子 片 段(- 1 400~
抗及羊抗兔二抗(武汉三鹰生物技术有限公司);总 +50 bp)插入 pGL3⁃Basic 载体以构建质粒 pGas6⁃
蛋白提取试剂盒(南京凯基生物技术股份有限公司); 1450 并测序,应用 NCBI 的 blast(https://blast.ncbi.
全DNA提取试剂盒(北京天根生化科技有限公司)。 nlm.nih.gov/Blast.cgi)工具鉴定该质粒。并以pGas6⁃