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第43卷第11期       陈雪松，陈     玲，何梦钰. SMARCA4突变的非小细胞肺癌患者临床特征及相关生物信息分析［J］.
                 2023年11月                    南京医科大学学报（自然科学版），2023，43（11）：1520-1526                      ·1521 ·


                    肺癌是最常见的恶性肿瘤，也是癌症相关死亡                          统计患者生存时间。总生存期（overall survival，OS）指
                的主要原因之一。WHO统计2022年我国新增肺癌                          诊断NSCLC开始直至由于任何原因死亡的时间。
                人数约87万，因肺癌死亡人数约50万，肺癌仍是威                          1.2.2 差异表达分析
                胁国民健康的重要疾病 。根据病理类型，肺癌分                                运用TIMER数据库（http：//timer.cistrome.org）获
                                     ［1］
                为小细胞肺癌（small cell lung cancer，SCLC）和非小            取SMARCA4在不同肿瘤中的相对表达水平；TIMER
                细胞肺癌（non⁃small cell lung cancer，NSCLC），其中         数据库、GEPIA 数据库（http：//gepia.cancer⁃pku.cn）
                NSCLC 占 85%，主要包括肺腺癌及肺鳞癌。近年                        分析 SMARCA4 在肺腺癌组织与正常组织、肺鳞癌
                来，NSCLC 的诊断策略及治疗手段不断发展，但患                         组织与正常组织间的表达差异。
                者5年生存率仍不尽人意。NSCLC的发生发展是一                          1.2.3 遗传突变分析
                个多因素、多基因共同参与的过程，因而探究其中                                通过 cBioPortal 数据库（https：//www.cbioportal.
                的分子机制、寻找关键基因，对 NSCLC 诊疗具有重                        org）的“cancer types summary”模块分析 SMARCA4
                要价值。                                              基因在所有TCGA NSCLC的突变类型和拷贝数改变
                    SWI/SNF（Switch/sucrose nonfermentable）染色质    （copy number alteration，CNV）信息，并进一步分析
                重塑复合体是 ATP 依赖性染色体重塑复合物五大                          肺腺癌及肺鳞癌中的遗传突变信息。同时，在数据
                亚家族的成员之一，参与染色质修复、调控细胞增                            库“comparison”模块进行 SMARCA4 突变型及野生

                殖 分 化 过 程 。 SMARCA4（SWI/SNF related，matrix        型肺腺癌及肺鳞癌患者的生存分析。
                associated，actin dependent regulator of chromatin，  1.2.4 蛋白相互作用分析
                subfamily A member 4）编 码 BRG1（brahma ⁃ related        运 用 STRING 数 据 库（Version：11.5）探 索 与
                gene⁃1）蛋白，催化 ATP 水解，是为整个 SWI/SNF 复                SMARCA4 潜在相互作用的蛋白并构建网络图，相
                                       ［2］
                合物提供能量的核心基团 。由此可见，SMARCA4                         互作用蛋白网络构建条件为置信度大于0.7。
                对肿瘤发生发展过程中的基因调控起重要作用，然                            1.3  统计学方法
                而目前SMARCA4基因与NSCLC的相关研究仍不深                            运用SPSS 26.0 统计学软件进行数据分析，计量
                入。本研究分析了含SMARCA4基因突变NSCLC患                        资料用均数±标准误（x ± Sx ）表示。生存分析采用
                者的临床特征及预后，同时采用生物信息学方法探                            Kaplan⁃Meier法绘制生存曲线，Log⁃rank法进行生存
                究SMARCA4基因在NSCLC中的差异表达、突变、与                       时间的比较。SMARCA4 基因差异表达采用非参数
                预后相关情况及潜在的生物学功能，为NSCLC诊断                          Mann⁃Whitney 检验分析。P < 0.05为差异有统计学
                及治疗提供新思路。                                         意义。

                1  对象和方法                                          2  结 果

                1.1  对象                                           2.1  一般资料
                    回顾性分析 2020 年 1 月—2022 年 12 月于南京                   本研究共纳入 35 例 SMARCA4 突变的 NSCLC
                医科大学第一附属医院就诊且符合条件的 35 例患                          患者（表 1），其中男 23 例，女 12 例，年龄（64.26 ±
                者临床资料。纳入经组织病理或细胞病理确诊为                             1.70）岁（39~78 岁），有吸烟史患者 18 例，否认吸烟
                                                           ［3］
                NSCLC［根据 WHO（2021 版）肺肿瘤组织学分型 ］                    史患者17例。35例患者NSCLC组织学类型为腺癌
                且经二代测序（next generation sequencing，NGS）方           27 例（77.1%），鳞癌 4 例（11.4%），其他类型 4 例
                法检测有SMARCA4基因突变的患者。本研究获得                         （11.4%）；Ⅰ~ⅢA 期 8 例（22.9%），ⅢB~ⅣB 期 27 例

                南京医科大学第一附属医院伦理委员会批准（2023⁃                        （77.1%）。
                SR⁃318）。                                          2.2  基因分析

                1.2  方法                                               在 35 例含 SMARCA4 基因突变 NSCLC 患者中
                1.2.1 患者资料收集                                      进行基因表达谱分析（表 1），伴随 EGFR 基因突变

                    本研究共纳入 35 例经 NGS 确诊为 SMARCA4                  14例（40.0%）；伴随TP53基因突变11例（31.4%）；伴
                基因突变的 NSCLC 患者，记录其性别、年龄、吸烟                        随KRAS基因突变4例（11.4%）；伴随ERBB2基因突
                史、组织学类型、SMARCA4突变类型、突变位点、共                        变4例（11.4%）；伴随STK11基因突变3例（8.6%）；伴
                突变基因等指标。对35例患者进行电话或门诊随访，                          随CDKN2A基因突变3例（8.6%）；伴随ALK 基因突
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