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第43卷第8期 颜 凤,周国平. 转录因子AP2A对肾病相关基因Gas6的调控研究[J].
2023年8月 南京医科大学学报(自然科学版),2023,43(8):1085-1093 ·1087 ·
胞因子刺激 HEK⁃293T 细胞 24 h,用 PBS 洗涤细胞 1.2.5 人Gas6启动子及转录因子结合位点突变的启
2 次,收集细胞,用 100 μL 1×Binding Buffer 重悬,加 动子的萤光素酶报告基因重组质粒的构建与鉴定
入 Annexin V⁃FITC 和 PI staining solution 各 2.5 μL, 人 Gas6 基因(GenBank 编号:NC_000013.11)序
混匀,室温避光孵育 10 min,加入 300 μL 1×Binding 列从美国国立生物技术中心数据库 NCBI(https://
Buffer,混匀,使用流式细胞仪检测。 www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/)找 到 起 始 密 码 子 上 游
1.2.4 染色质免疫沉淀(ChIP) 1 400 bp片段、下游50 bp片段序列。将人Gas6启动
使用ChIP Assay Kit试剂盒,根据其说明书进行 子的转录起始位点(TSS)设置为+1。将人Gas6启动
实验及分析。将 HEK⁃293T 细胞在 1%甲醛中固定 子片段-1 400~+50 nt 的序列插入 pGL3⁃Basic 载体
10 min,沉淀细胞并充分裂解,超声剪切基因组DNA 中,命名为 pGas6⁃1450 并测序,使用 NCBI 的 blast
使其断裂成 200~1 000 bp 大小(去除交联,纯化 (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)功能鉴定该
DNA,进行琼脂糖凝胶电泳观察超声处理效果)。 质粒的正确性。以pGas6⁃1450 为模板构建TFAP2A
样品特异性免疫沉淀后去除交联并纯化,选择引物 结合位点突变的启动子质粒,分别命名为 pGas6⁃
进行PCR或qRT⁃PCR并进行琼脂糖凝胶电泳(目的 1450 mut1、pGas6⁃1450 mut2、pGas6⁃1450 mut1+2
PCR 产 物 碱 基 编 号 :- 418~- 283,上 游 引 物 :5′ ⁃ (下文合称为pGas6⁃1450 mut)并测序核对。具体突
AAACCGTCGCATTTCACTCG ⁃ 3′ ,下 游 引 物 :5′ ⁃ 变点见图1。
CCCCGAATCTACTGCATCCT⁃3′;Control Primers:上 1.2.6 双萤光素酶报告基因实验
游引物:5′⁃TACTAGCGGTTTTACGGGCG⁃3′,下游引 将HEK⁃293T细胞接种到96孔板中(1×10 个/孔)。
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物:5′⁃TCGAACAGGAGGAGCAGAGAGCGA⁃3′)。 24 h 后,将 100 ng pGas6⁃1450 或 pGas6⁃1450 mut 或
原始序列⁃397 5′⁃TGGCCCCCAGTGGG……CAACCACCGCCTG⁃3′ -152
突变序列⁃397 5′⁃TGGTCCCCAGTGGG……CAACCACCGTCTG⁃3′ -152
mut1 mut2
图1 突变序列
Figure 1 The mutated sequences
pGL3⁃basic 质粒与 4 ng pRL⁃TK 质粒共同转染到细 表1 小干扰RNA序列
胞中,24 h 后检测 pGas6⁃1450 或 pGas6⁃1450 mut 的 Table 1 Sequences of siRNA
siRNA 序列(5′→3′)
启动子活性;将 100 ng pGas6⁃1450 或 pGas6⁃1450
mut 和 siTFAP2A(50 nmol/L)或 siNC(50 nmol/L)与 siTFAP2A 正义链:CCUGCUCACAUCACUAGUATT
反义链:UACUAGUGAUGUGAGCAGGTT
4 ng pRL⁃TK质粒共同转染到细胞中,24 h后检测敲
siNC 正义链:UUCUCCGAACGUGUCACGUTT
低TFAP2A对pGas6⁃1450或pGas6⁃1450 mut启动子
反义链:ACGUGACACGUUCGGAGAATT
活性的影响;同时,将 100 ng pGas6⁃1450 或 pGas6⁃
1450 mut 和 100 ng pENTER⁃TFAP2A 或 pENTER 与 ADR)(0.2 μg/mL)或等体积生理盐水(normal sa⁃
4 ng pRL⁃TK质粒共同转染到细胞中,24 h后检测过 line,NS)刺激MPC5细胞,检测肾病相关指标mRNA
表达TFAP2A对pGas6⁃1450或pGas6⁃1450 mut启动 表达量的变化以确定阿霉素细胞模型构建成功与
子活性的影响。检测方法采用双萤光素酶报告基 否,同时检测 Gas6 mRNA 表达量的变化;用 Gas6 细
因系统,使用 TD 20/20 荧光光度计,按照双萤光素 胞因子(100 ng/mL)或等体积 NS 刺激 MPC5 细胞后
酶检测试剂盒步骤分别检测 pGL3⁃basic、pGas6⁃ 检测肾病相关指标表达量的变化;用Gas6细胞因子
1450、pGas6⁃1450 mut 以及敲低和过表达 TFAP2A (100 ng/mL)刺激HEK⁃293T细胞检测凋亡相关指标
后 pGas6⁃1450 和 pGas6⁃1450 mut 的启动子活性,并 表达量的变化;将小干扰RNA或过表达质粒或相应
将其标准化为pRL⁃TK的活性。结果至少重复3次。 的对照试剂转染到HEK⁃293T细胞中检测敲低或过
具体小干扰RNA序列见表1。 表达TFAP2A对Gas6 mRNA表达量的影响。24 h后
1.2.7 实时荧光定量PCR(qRT⁃PCR) 使用 Omega RNA 提取试剂盒从细胞系中提取总
将MPC5细胞或HEK⁃293T细胞接种到12孔板 RNA,并将其逆转录为第 1 链 cDNA,进行 qRT⁃PCR
中(1×10 个/孔)。24 h 后用阿霉素(adriamycin, 实验。反应条件为:95 ℃ 10 min,95 ℃ 15 s、60 ℃
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