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第44卷第2期          王  翔,徐煜皓,孙 宇,等. 儿童急性淋巴细胞白血病的代谢组学及外显子组学研究[J].
                  2024年2月                    南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(2):197-204,234                     ·199 ·


                及预测能力均较好。图3C、D为OPLS⁃DA的模型验                        下降最显著的10种差异代谢物是1⁃吡咯啉⁃5⁃羧酸、
                证,进行200次置换检验,实验数据建立的OPLS⁃DA                       5⁃羟色胺,PE(O⁃18:0/22:5)、PG(16:0/18:1)、SM
                模型未发生过拟合,代表模型非常可靠。上述结果                           (34:2;3)、γ⁃谷氨酰半胱氨酸、亮氨酸、叶酸、SM
                表明,ALL和对照组的模型稳定性和预测性较好,可                         (40:2;3)、肉碱⁃C(18:2)(图4C)。
                用于后续差异代谢物的筛选。                                     2.2.3 代谢通路的富集分析
                2.2.2 代谢差异物的筛选                                        将鉴定出的差异代谢物通过KEGG进行通路分
                    结果发现,与对照组相比,ALL 组中共筛选出                        析(图 5)。研究发现 ALL 组的通路富集于细胞过
                61种差异性代谢物(图4)。37种代谢物在ALL中表                        程、环境信息处理、人类疾病、代谢、生物体系统等
                达上升,24种代谢物在ALL中表达降低。这些代谢                          一级通路。其中细胞过程富集于缝隙连接等二级
                物来自13个亚组,如氨基酸、多肽和类似物、酰基肉                          通路,环境信息处理富集于鞘脂信号通路、Ras信号
                碱、鞘脂、类固醇、激素和脂肪酸等(图4B、D)。热图                        通路、Rap1信号通路、磷脂酶D信号通路、神经活性
                分析示 ALL 组氨基酸、脂质、核苷酸等代谢物改变                         配体⁃受体的相互作用、cAMP 信号通路、钙信号通
                明显(图 4A)。ALL 组表达量上升最显著的 10 种差                     路、Apelin信号通路等二级通路,人类疾病通路富集
                异代谢物是对甲酚、脱氧胆酸、12⁃酮石胆酸、7⁃酮石                        于前列腺癌、癌症的途径、内分泌抵抗、EGFR 酪氨
                胆酸、DG(20∶0/20∶0)、24⁃OH 胆固醇、焦谷氨酰异                  酸激酶抑制剂耐药性、化学致癌作用⁃受体激活等二
                亮氨酸、莽草酸、硫酸吲哚酯、肉碱⁃C16OH,表达量                        级通路,代谢通路富集于鞘脂代谢、嘌呤代谢、氨基

                A                                                B
                    9.0e6                                            6.8e6
                    8.5e6                                            6.5e6
                    8.0e6                                            6.0e6
                    7.5e6                                            5.5e6
                    7.0e6
                    6.5e6                                            5.0e6
                    6.0e6                                            4.5e6
                   Interst.cps  5.0e6                               Interst.cps  3.5e6
                    5.5e6
                                                                     4.0e6
                    4.5e6
                                                                     3.0e6
                    4.0e6
                    3.5e6
                    3.0e6                                            2.5e6
                    2.5e6                                            2.0e6
                    2.0e6                                            1.5e6
                    1.5e6                                            1.0e6
                    1.0e6
                    0.5e6                                            0.5e6
                      0.0                                              0.0
                        0.0  1.0  2.0  3.0  4.0  5.0  6.0  7.0  8.0  9.0  10.0  11.0  12.0  13.0  14.0  15.0  16.0  17.0  18.0  0.0  1.0  2.0  3.0  4.0  5.0  6.0  7.0  8.0  9.0  10.0  11.0  12.0  13.0  14.0  15.0  16.0  17.0
                                       Time(min)                                       Time(min)
                                        A:XIC diagram of positive ion mode. B:XIC diagram of negative ion mode.
                                                    图1   标准品混合物XIC图谱
                                               Figure 1  XIC pattern of standard mixtures
                   A                                           B
                         60
                                                                    25
                                                                    20
                       ( 15.58% )  0                     Group    ( 12.37% )  15
                         30
                                                                    10
                                                          ALL
                                                          NC
                       PC2                                QC      PC3  5 0                                  ( 15.58% )
                        -30                                         -5                                 20  30  PC2
                                                                   -10                             0  10
                                                                                                 -10
                                                                   -15                        -20
                                                                     -40 -30 -20 -10  0  10  20
                        -60
                                                                             PC1(29.91%)
                                  -50      0       50
                                     PC1(29.92%)
                   A:PCA score chart of the comparison group. B:PCA 3D score graph of the comparison group. ALL:acute lymphoblastic leukemia;NC:negative
                comtrol;QC:quality control.
                                                      图2   比对组PCA得分图
                                                 Figure 2 PCA score plot of each group
   56   57   58   59   60   61   62   63   64   65   66