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第44卷第2期          王  翔,徐煜皓,孙 宇,等. 儿童急性淋巴细胞白血病的代谢组学及外显子组学研究[J].
                  2024年2月                    南京医科大学学报(自然科学版),2024,44(2):197-204,234                     ·203 ·


                             表4 变异类型数量统计                          GCNT4、B3GNT4、GALNT12、GALNT15、GALNT5(图
                Table 4  Statistics of the number of variant types for ALL  6B),可能为ALL的关键基因。
                       and control groups               (n)
                                                                  3  讨 论
                     ID               SNP             InDel
                   ALL1              28 047           1 608
                                                                      ALL 是一种罕见的恶性血液病,儿童的发病率
                   ALL2              27 340           1 619
                                                                  远高于成人,临床上ALL表现为骨髓、外周血、淋巴
                   ALL3              27 600           1 558
                                                                  和非淋巴组织中恶性、未成熟的淋巴母细胞增殖和聚
                   ALL4              27 726           1 528
                                                                  集,未经治疗的ALL患儿会在几个月内死亡 。本研
                                                                                                        [6]
                   control 1         28 475           1 603
                                                                  究是基于LC⁃MS对ALL患儿的血液进行研究,找到
                   control 2         27 816           1 528
                   control 3         27 655           1 538       ALL 患者血清代谢物的改变,寻找与 ALL 相关的潜
                   control 4         27 621           1 628       在代谢生物标志物以指导临床。新陈代谢改变越
                                                                  来越被认为是癌症的一个重要表现,因此是识别治
                突变不具备致病性,故需要进一步筛选与疾病相关                            疗靶点或标志物的潜在研究领域 。目前对白血病
                                                                                               [7]
                性更强的变异。根据保留满足 ALL 组两位及两位                          的治疗虽然已经取得了很大进展,但是很多患儿仍
                以上受试者共有并且未在健康对照组中出现的突                             然达不到预期效果,甚至达不到缓解状态。近年血
                变位点,8 位受试者共保留 SNP 位点 957 个,其中                     浆代谢方向在白血病中的研究颇多,文献报道血浆
                479 个为非同义突变,对应基因 334 个;InDel 位点                   代谢组学检测诱导治疗后的 ALL 患者脂质代谢发
                                                                              [8]
                37个,对应28个基因。共有基因8个,分别是GOL⁃                        生了显著改变 。
                GA8H、HOXB1、KIF20B、MUC16、MUC17、MUC4、                   本研究发现相比对照组,ALL 组的差异代谢物
                TNRC6A、ZNF283。对 354 个基因进行蛋白互作网                    主要来源于氨基酸代谢、脂质代谢、三羧酸循环及
                络分析(PPI)(图 6A)。然后利用 Cytoscape 软件中                 核苷酸代谢等通路。氨基酸是蛋白质的基本组成
                的“cytohubba"算法筛选出互作关系前10的基因,分                     单位,具有重要的生理功能,一些氨基酸,如酪氨
                别 为 MUC17、MUC12、MUC16、MUC4、B3GNT3、                酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酰胺和甘氨酸分别是合

                  A                                                           B
                                                         CSGALNACT2
                                                  CHST12                                    GALNT12
                            HEATR2
                     DNAH11                 KANK4          MCM8
                                     L1TD1
                               KMT2C                GINS3
                       TNRC6A                ADAMTS9        ABCA4                           GALNTL5
                                 SHANK1
                          DLGAP4
                                   TRAF5
                             BIRC3
                                          ADAMTS7  ADAMTS14                              MUC17   MUC4
                                                             CEP290
                                  B3GNT4                                        B3GNT4                   GCNT4
                                               GALNTL5
                                                       ASPM
                                                                                         MUC16   MUC12
                             GCNT4    MUC16                       TULP1
                                                   NDC80   NCAPG
                                          MUC4
                                                                       NOM1
                                                                RBM19                       B3GNT3
                                                       KIF20B
                                     MUC12
                              B3GNT3     MUC17
                                                 GALNT15
                                                                                            GALNT15
                                  CCR5
                           PTAFR                NEDD4         POLR1A
                                                                   NVL
                                   MMP7                CYP2C18
                            NID1
                                  LILRA6                          CCT3
                                         GALNT12           TUBAL3
                                 PRKACG           MYOM2           COL16A1
                                        HLA⁃A         UGT1A3
                                              HLA⁃F
                              PM20D1
                       SLC17A3                        COL22A1
                                                              PLOD1
                                   SMO
                                                   TTN
                               SYNE2       TAPBP
                         SUN1                             MYH2
                                              PLEC              SETD8
                                  CDON
                                           ZBTB22
                                  CDH15
                                            图6 差异基因的蛋白互作网络(A)和子网络图(B)
                            Figure 6 Protein interaction networks(A)and subnetwork(B)diagrams of differential genes
   60   61   62   63   64   65   66   67   68   69   70