Page 94 - 南京医科大学自然版
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第44卷第5期
·682 · 南 京 医 科 大 学 学 报 2024年5月
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或Ⅲ期CRC患者在术后复发 。当前精准医学高速 (北京天根公司)操作。收集的DNA样品使用分光光
发展,依靠传统指标(如癌胚抗原)预测肿瘤复发灵 度计测定吸光率并计算浓度,分装后在-80 ℃冰箱保
敏度及特异度均较低,亟需新的标志物为临床医生 存待用。
提供信息以精准识别术后复发的高危患者。 1.2.3 实时定量荧光 PCR(qRT⁃PCR)检测 mtDNA
线粒体是进化上相对保守的细胞器,具有独特 含量
的生物学特征,在调节代谢、调节细胞周期、能量产 采用 20 μL PCR 反应体系(Q321⁃02/03,南京
生、细胞凋亡和细胞衰老中发挥重要作用 。线粒 Vazyme 公司):2×Mix 10 μL,正向引物(10 μmol/L)
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体 DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)为 不 同 于 核 0.4 μL,反向引物(10 μmol/L)0.4 μL,DNA模板10 ng,
DNA 的双链环状 DNA,携带的 37 个编码基因是维 ddH20 补至 20 μL。置于 Cobas Z PCR 仪依照程序:
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持线粒体、细胞正常功能所必需的 。目前 mtDNA 95 ℃,30 s;95 ℃,10 s;60 ℃,30 s;40 个循环。反应
在肿瘤相关研究中更多围绕DNA序列变异展开,关 结束后读取Ct值,以3个平行复孔计算平均值。
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于 DNA 含量的研究尚不多见 。尽管 mtDNA 含量 1.2.4 mtDNA引物及含量计算方法
变化受多种遗传、组织环境等因素影响,但这也可 便于科学合理计算 mtDNA 相对于核 DNA 的含
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能意味着线粒体功能障碍,并在肿瘤、线粒体疾病、 量,本文参考文献方法 并进行了适当修改。通过
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抑郁症、糖尿病等疾病中发挥重要作用 。mtDNA 相对定量法,即将线粒体16 S rRNA基因(MT⁃RNR2
含量与CRC患者预后的关系鲜有报道。因此,本研 基因)扩增水平作为 mtDNA 含量指标,将 HemoG 基
究收集 117 例 CRC 患者新鲜组织标本,分析 mtDNA 因扩增水平作为核 DNA 含量指标,将每个样品的
含量与CRC临床病理特征及患者预后的相关性。 mtDNA 含量指标除以 HemoG 扩增水平以校正组织
间差异。该比值被当作组织 mtDNA 相对含量。计
1 对象和方法
算公式为 2 -ΔCt ,ΔCt=(MT-RNR2 基因 Ct 值-HemoG
1.1 对象 基 因 Ct 值 )。 引 物 序 列 :HemoG,正 向 :5′ ⁃
选取2018年1月—2020年6月在南京医科大学 GAAGAGCCAAGGACAGGTAC⁃3′,反向:5′⁃CAACT⁃
第二附属医院行手术治疗的117例CRC患者。纳入 TCATCCACGTTCACC⁃3′;MT⁃RNR2,正向:5′⁃ GCC⁃
标准:①术后病理确诊为腺癌;②患者知情同意且 TTCCCCCGTAAATGATA ⁃3′,反向:5′⁃ TTATGCGA⁃
依从性好;③初次诊断且术前未行新辅助放化疗。 TTACCGGGCTCT ⁃3′。
排除标准:①合并其他恶性肿瘤或免疫系统疾病;② 1.3 统计学方法
随访资料缺失或失访;③急诊手术;④非复发/死亡因 采用SPSS 24.0统计软件、GraphPad Prism 8.0进
素而术后辅助治疗中断。本研究经过本院伦理委员 行数据分析及作图。mtDNA含量不符合正态分布,
会批准(编号:[2021]⁃KY⁃048⁃01),并知情同意。 以中位数(四分位数)[M(P25,P75)]表示。癌与癌旁
1.2 方法 组织间 mtDNA含量比较采用Wilcoxon秩和检验,两
1.2.1 临床资料 组间mtDNA含量比较采用 Mann⁃Whitney U检验,多
收集患者一般临床资料,包括年龄、性别、肿瘤 组间比较使用Kruskal⁃Wallis检验。采用受试者工作
位置、肿瘤大小、病理分化、大体类型、DNA 错配修 特 征(receiver operating characteristic,ROC)曲 线 、
复(mismatch repair,MMR)状态、KRAS 基因突变情 ROC曲线下面积(area under curve,AUC)判断mtDNA
况、BRAF基因突变情况、T分期、N分期、TNM分期。 含量预测价值,使用约登指数计算公式(灵敏度+特
117例中,男70例,女47例。TNM分期中,Ⅰ期31例, 异度-1)计算最佳截断值。DFS 生存曲线绘制采用
Ⅱ期34例,Ⅲ期52例。随访3年内出现影像学上明 Kaplan⁃Meier 检验。采用单因素和多因素 Cox 回归
确局部复发或远处转移定义为肿瘤复发,采用无病 分析DFS相关危险因素。P < 0.05为差异有统计学
生存期(disease free survival,DFS)进行评价。 意义。
1.2.2 组织DNA的提取
2 结 果
手术时,从肿瘤边缘切取肿瘤组织,癌旁组织
从距离肿瘤2 cm处获取。所获组织均由液氮保存, 2.1 癌组织及癌旁组织mtDNA含量比较
每个样本提取时取适量并碾碎。将碾碎后的组织 在收集的 117 例 CRC 组织样本中,提取组织
放于 1.5 mL EP 管中,按照 DNA 抽提试剂盒说明书 DNA 并计算癌组织中的 mtDNA 含量以及相对应癌